雖然我不能原諒長門殺了自來也，但是長門其實並不是個壞人，他心地善良，關愛自己的同伴，在經歷父母雙亡和同伴的死去後，被「宇智波帶土」蠱惑，決定在痛苦的輪迴中孕育和平。
長門是漩渦一族的後裔，當初宇智波斑為了實現月之眼計劃，將自己的輪迴眼移植給了長門，希望有朝一日，長門可以用外道輪迴天生之術復活自己。第二次忍界大戰時期，兩名木葉忍者闖入長門家裡，誤以為長門的父母為敵人將其父母殺死，受驚的長門無意識地使用輪迴眼，將入侵者殺死。失去雙親的長門帶著一隻名為小不點的小狗過起了流浪的生活，後來暈倒在路上被經過的小南救起，並把長門帶到了一個基地裡結識了彌彥，同為戰爭孤兒的三人決定相依為命。
直到有一天，他們遇到了正在與雨隱村首領半藏交手的自來也、大蛇丸和綱手三人。他們看到了一場震撼的對決，在震驚之際，彌彥決定要向木葉三忍學習忍術，來改變這個殘破不堪的雨之國（當時淪為三大國主戰場的雨隱之村戰亂不斷）。於是他們踏上了尋找木葉三忍的旅途，歷經艱難，他們找到了木葉三忍，最後自來也決定收留這三個孩子，打算將他們撫養至成人為止，也算是對這個飽受戰火的國家的補償。
在和自來也生活的日子裡，長門重新收穫了家一般的溫暖。不過自來也剛開始沒打算教他們忍術，直到有一次看到了長門的輪迴眼，他以為長門就是他要找的預言之子，從那時起，自來也開始教授長門三人忍術，讓他們有足夠的能力保護自己。自來也希望長門能夠用自己的力量保護同伴，並在未來引導世界走向和平。後來他們長大了，自來也離開了。
長門，彌彥和小南創立了「曉」，他們遵循自來也的教導，將曉塑造成一個熱愛和平的組織。然而這個美好的願望很快就破滅了，半藏勾結木葉的志村團藏設計陷害曉，還讓彌彥被迫死在長門的手裡，眼見摯友死在自己面前，在極度憤怒之下的長門使用輪迴眼召喚出外道魔像，幾乎殺光了在場的所有忍者，只有半藏和團藏逃脫了。最後長門接受了帶土的提議，也開始認定只要在這個被詛咒的世界，不會有真正的和平，人與人是永遠不會相互理解的，對和平的理解走上了極端。曉也因此改變了性質，將曉這個原本熱愛和平的組織改變成了由各個忍村的S級叛忍組成的組織，長門為了讓彌彥繼續擔任曉的首領，把他製作成了六道佩恩中最強的天道，讓他替代自己出現在其他成員面前。後來，半藏被長門控制的佩恩六道所殺，從此長門支配了雨隱之村。
曉開始收集尾獸，曉的行動也引起了自來也的注意，為了收集曉的情報，自來也獨自前往雨隱村，昔日師徒再見面，卻不是久違的敘舊。自來也質問長門為什麼收集尾獸，長門告訴自來也他想要創造出可以瞬間毀滅一整個國家的禁術，並把它分配給每一個國家，讓國與國之間相互制衡，讓弱國不受欺凌，讓世界達到真正的和平。自來也並不認同長門的想法，出手阻止長門，而長門在彌彥死後，對這個世界已經徹底失望了，迫切想改變它，於是親手殺掉了這個一手將自己撫養長大的恩師。
佩恩和小南一起襲擊木葉捕捉九尾人柱力漩渦鳴人，並使用了神羅天徵將整個木葉隱村摧毀。從妙木山趕回來的鳴人與佩恩六道交戰，佩恩六道被鳴人逐個擊敗後 ，鳴人在小南用紙製作的一棵大樹裡找到了佩恩的本體--長門，經過一番談話後，長門被鳴人所感化，重拾少年時期的夢想 ，放棄和宇智波帶土的原定計劃，用外道·輪迴天生之術復活了在佩恩一戰所有死去的人，將自己的意志託付給了鳴人，力竭而亡。