新冠肺炎疫情當前，臺當局為保所謂「邦交」勉強讓海軍艦隊出航，導致所謂「敦睦艦隊」磐石艦暴發聚集性感染，22日又新增1例新冠肺炎確診病例，為艦隊實習生，群聚感染累計28人，引發臺灣民眾恐慌及輿論廣泛批評。臺軍方21日晚間檢討艦隊「染疫」存在的「四大缺失」， 防務部門主管嚴德發自請處分。臺灣地區領導人蔡英文22日中午11時親上火線發表敞廳談話，向外界致歉的同時要求臺軍方徹底檢討。
臺防務部門主管嚴德發：「我們一鞠躬，表達我們最深的歉意，一鞠躬。」
臺所謂「敦睦」艦隊感染新冠肺炎引爆臺灣輿論，臺防務部門主管嚴德發21日晚上在記者會上公布這起群聚感染事件初步調查結果及首波懲處名單，指出海軍存在四大缺失。他還稱，已自請處分，包括請辭，該負的政治責任絕對都會負責。
臺防務部門主管嚴德發：「臺海軍司令劉上將已經自請處分此外，艦指部指揮官高中將、與擔任支隊長的艦指部參謀長陳少將，我認為都難辭其咎。兩個人都檢討、調離現職，我接受所有的處分，包含請辭。我的責任到哪裡，我絕對負到哪裡，我不會規避。誠如剛剛跟大家報告的，坦然面對、誠實以對，該我負的政治責任我絕對會負。」
值得關注的是，臺立法機構外事及防務委員會22日原打算以視訊方式，對所謂「敦睦艦隊」支隊長、磐石艦長、醫官進行質詢。但在安排過程中，臺防務部門卻不斷阻擋視訊會議、說謊、卸責。藍綠雙方為此吵個不停：
民進黨籍民代柯建銘vs.國民黨籍民代林為洲
林為洲：「當事人現在不敢視訊，他們現在一直講人家，本來人家都講好了。」
民進黨籍民代何志偉vs.國民黨籍民代
何志偉：「反對『公審』，小醫官我們如果要『釘』就『釘大隻』的啦。我們要罵，罵防務部門主管就好，你公審這些『小隻的』幹什麼？是不是？蔡英文多大隻？多大隻？ 」「『三軍統帥』啊」
會議空轉將近一小時，嚴德發總算可以上臺報告，所謂「敦睦艦隊」支隊長陳道輝則透過電話向民代報告。
「敦睦艦隊」支隊長陳道輝：「我要表達對全體民眾、還有社會，造成如此重大不安，表達個人最深切歉意。」
22日中午，蔡英文召開記者會，向承擔疫情風險的民眾道歉，並要求臺軍方徹底檢討，在最短的時間內查清真相。外界點名臺軍所謂「參謀總長」黃曙光也該負起政治責任，蔡英文聲稱「絕對不會護短」。
蔡英文：「臺軍的事就是我的事、就是我的責任，但臺海軍這趟任務在防疫上出現這麼大的違失，讓民眾因此承擔疫情風險，我要致上我的歉意。臺防務部門所做的簡報只是初步調查的結果，等到調查完整之後，釐清責任，我們再進行懲處，我剛才講我不會護短。」
蔡英文口口聲聲說不護短，但有臺媒就質疑臺防務部門的首波懲處名單上怎麼沒有所謂的「蔡家班」？海軍出身的臺軍參謀總長黃曙光平常就親近蔡英文，臺海軍司令劉志斌是之前蔡辦的侍衛長，此次兩人都沒有被懲處，僅僅叫一個臺海軍副司令出面道歉，臺灣《中國時報》認為此番處理「荒腔走板」，是為「棄軍保帥」。
此外，是誰來拍板決定所謂「敦睦艦隊」照常執行任務，蔡英文對此給出答案：
「是在例行簡報裡面有提到，他們工作中間有一項是這個，那這個是防務部門主管例行性報告，已經做成的決定，就應該是予以尊重。」
另外，蔡英文還不忘煽動兩岸對立，辯稱面對大陸在疫情期間的軍事行動，臺軍要保持正常戰力跟戰備。針對所謂「敦睦艦隊」疫情，國民黨22日上午召開記者會，質疑防務部門、臺海軍對疫情說明不清，應受指責，但蔡英文身為領導人，甚至是拍板決定讓艦隊出航的決策者，卻在第一時間表達「遺憾」，要軍方道歉，急忙撇清關係的卸責之舉，不僅讓臺軍心寒，也引起民眾的不滿。
國民黨文傳會主委王育敏：「這次軍方事發之前軍紀渙散，事發之後荒腔走板，謊話連篇。作為『三軍統帥』，怎麼可以『甩鍋』甩得一乾二淨，覺得好像事不關己。」
自臺海軍磐石艦染疫事件暴發以來，島內譁然，外界都在問到底該由誰來負責？我們看到蔡英文終於道歉了，但是還不忘扯上大陸，她到底想表達什麼？
賴祥蔚：因為過去幾天，臺灣民眾對於整個臺海軍的染疫風波越來越不耐煩、越來越不高興，因為他們看到很多軍方人員對外的說法都充滿謊言，連蔡英文自己都講了，她呼籲臺海軍要誠實以對。在這樣一個趨勢當中，國民黨的很多民意代表就紛紛開始批評，要求蔡英文要出面道歉，我們就看到在整個攻擊力道正要上來，還沒有到底的時候，蔡英文就迅速道歉了。更何況蔡英文道歉的聲明裡面又點出了、又強調了，她說兩岸現在局勢緊張，這就是把她過去的一個「反中牌」，這張牌再次拿出來打，所以我們說蔡英文方面非常有技巧在回應民意、在轉移方向、國民黨真的要加強，不然的話恐怕國民黨未來還是會被民進黨壓著打。