《新薔薇少女》是這部番劇系列的第三部，在這部番劇裡真正的第七人偶雪華綺晶出現，兩個平行的現實世界同時開啟，為了拯救被禁錮封印的人偶們，擰發條的純與沒有擰發條的純聯手對付雪華綺晶。
番劇一開篇，所有的人偶與純都被禁錮在第七人偶的世界裡。第七人偶是沒有身體載體，只能以靈魂存在的白薔薇雪花綺晶，她靠著吸取人偶主人們的靈魂生存著。一直以來她存在於每一個世界，形成了以太的形式，一直遊蕩的她，內心深處渴望著擁有一個屬於自己的身體，可以選擇雛莓的天真、金絲雀的可愛、真紅的高貴、水銀燈的威嚴、翠星石的活潑、蒼星石的沉穩，集齊所有讓自己成為最完美的愛麗絲。面對第七人偶帶來的危機，拉普拉斯之魔幫助純打開另一世界的門，尋求成年純的幫助。
擰與沒擰是自己主動的選擇，一樣的身體不一樣的人生，但是兩者是緊密關聯著的。在前兩部劇中我們充分了解了擰了發條後的純的生活，而這一部劇中則會帶我們進入沒有擰發條的純的世界。沒有擰發條的純，已經考入了一所三流大學，自己一邊打工一邊一個人生活著，有著陰沉的性格，臉上一直緊繃著沒有表情，常常受到店長的欺壓。這個世界的純依然逃著學不願意與身邊的人接觸，如同與真紅初遇之時讀國中的純。
人生水平如鏡的海面突然泛起漣漪，一本《少女的製作之法》敲開了那沉重的鐵門，緊接著一條條的簡訊打開了純的新世界。成年後的純就這樣與小時候的自己有了聯繫，面對小時候的純提到的荒謬的要求，一開始成年的純以為是騙子，但是或許是寂寞的世界裡呆太久了，也希望一直有人與自己聊會天吧。最終成年的純還是答應了另一邊世界裡的自己提的要求，開始製作人偶喚醒真紅。
過往的記憶，禁錮了完美的天賦，渴望擁有自我選擇。成年後的純回憶起當初因設計人偶服裝而被表揚卻也被徹底嘲笑的往事，看著現在眼前需要完成的薔薇少女的製作，有著雀躍卻也有著羞愧。按照小時候純的指示一步步完成了喚醒真紅的任務，看著只是複製品的真紅，面對她最終會消失的命運，成年的純十分地惱火，渴望擁有屬於自己的人偶，自己的薔薇少女。
被利用的純，第七人偶陰謀籠罩下的些許旭陽。雪華在世界的倒影裡看到了純的能力，明白了純心中的感受，便假扮小時候的純與其溝通，讓成年的純幫助自己獲得身體。一切在都藏於陰影下，成年純的世界沒有隨意開啟的門，真紅與水銀燈都等待著下弦月的到來，因為只有那個時刻能進入n之領域，找到自己想要的，拯救自己珍惜的。在這段時間裡，真紅與純，真紅與水銀燈之間的關係都有了更深的了解與羈絆。
人偶的完成，戲劇的開演，陰差陽錯做了正確的選擇。下弦月的晚上，戲劇的舞臺上，鐘聲響起，那扇門開啟，雪華綺晶憑藉著成年純製作的身體現於人前。在這場大戰前，水銀燈選擇拼盡全力，而突然出現的翠星石選擇了拼死守護雪華的身體，只因那是屬於蒼星石的身軀，真紅面對著兩難的選擇不知如何是好，最終因成年純與蒼星石的戒指契約成功，而成功讓雪華的靈魂與蒼星石的身體分離。
薔薇聖母最後的歸屬，所有選擇塵埃落定。雪華因失去身體而回到以太世界裡，翠星石決定把自己的薔薇聖母獻給蒼星石，讓其復活。面對著雪華哀切的求救，成年純選擇了蒼星石，他明白了想要的不能依靠別人。而小時候的純去尋找冰封的真紅，這期間遇到了公正的裁判遊戲於世界間的拉普拉斯之魔，最終真正的真紅獲救。當看到雛莓的薔薇聖母守護著真紅，並選擇奉獻出自己時，所有人都流下了感動的淚水。尤其是水銀燈心裡收到了極大衝擊，當蒼星石的薔薇聖母在自己身上時萬般拒絕自己，給自己造成了痛苦，而看著雛莓的選擇，她不禁明白了愛麗絲遊戲的真諦……
分叉路口，往左往右，我們各自回歸屬於自己的世界。櫻田家裡再度響起了歡聲笑語，而成年純的學校裡幾根白薔薇的根在蔓延著，似乎預示著下一個故事的開始……
在本劇一開始利用了一集的時間快速地回顧了前兩部的劇情，讓人快速銜接事情的前因後果，但是對於沒有觀看前兩部的觀眾來說，會出現一頭霧水的情況，所以建議大家可以把整一個系列看完哦！