在動畫中，小智的某些寶可夢是一直都沒有進化的，比如在日月系列動畫中，小智的木木梟就一直都沒有進化，而動畫對此也有做出解釋，那就是小智的木木梟在中期的時候就撿到了一枚不變之石，並且一直不變之石含在嘴巴裡，所以木木梟就一直都沒有進化，不過仔細回想的話，發現小智的很多草系寶可夢都沒有進化，比如五代的藤藤蛇，以及初代的妙蛙種子等等，那麼說到妙蛙種子的話，作為跟著小智很長一段時間的寶可夢，小智的妙蛙種子為什麼沒有進化呢？
PS：本文純屬個人看法，如有錯誤，敬請指正。
對應集數：無印篇第50集《妙蛙種子的不思議花園》
首次出現的拒絕進化：
如果要讓寶可夢一直不進化的話，在遊戲裡有諸多方式，第一個就是上面提到的讓寶可夢攜帶不變之石，第二個則是在寶可夢進化的那一瞬間裡按遊戲中的「B」鍵來取消寶可夢的進化，也就是說，在遊戲中寶可夢的進化與否是由玩家來決定的，這是因為遊戲裡的寶可夢說白了就是一些沒有感情的數據（手動狗頭），但是在動畫中，寶可夢很明顯都擁有自己的情感以及想法，所以在遊戲裡只能由訓練家決定是否進化的情形在動畫就更改了，動畫裡，寶可夢也有自己選擇是否進化的。
對於動畫中來說，大部分的寶可夢是願意進化的，因為進化之後往往代表著可以擁有更強的實力以及地位，但即便如此，還是有一部分寶可夢想要保持自己原來的樣子，這類寶可夢在寶可夢動畫中並不少見，其中不單單是小智的妙蛙種子，還有上面提到的木木梟、小光的波加曼等等，而妙蛙種子在不思議花園中拒絕進化是動畫裡首次出現的寶可夢拒絕進化的場面，在所有的妙蛙種子都進化成為妙蛙草的慶典裡，只有小智的妙蛙種子一直在抗拒進化（一直在給自己按「B」鍵）。
小智的妙蛙種子為什麼拒絕進化？
對於小智的妙蛙種子為什麼拒絕進化，動畫中並沒有給出明確的解釋，對此很多玩家開玩笑說可能是因為妙蛙種子進化成為妙蛙花就太醜了，還是妙蛙種子的形象最萌萌噠，這個小二其實是贊成的，動畫組可能確實考慮到了妙蛙種子在進化成為妙蛙花後顏值會不得行，為了動畫的人氣所以就讓小智的妙蛙種子不進化了，至於動畫劇情，，官方就沒怎麼管了，有另外一個說法是因為妙蛙種子看都小火龍進化之後不服從命令了，所以就怕自己進化之後性格也改變，，小二覺得也說得通。
好了，以上就是小二對於妙蛙種子為什麼拒絕進化的個人看法了，至於傑尼龜為什麼也不進化，，可能是和妙蛙種子串通好了吧，，