1869，日本明治天皇設立「東京招魂社」，目的是為了紀念戊辰戰爭打敗德川幕府軍，恢復了天皇權力的犧牲將士，同時激勵更多的人死心塌地的效忠自己。此時的招魂社類似於世界各國的烈士陵園，出發點是為了祭祀為國捐軀的英雄，倒也無可厚非。
而東京招魂社，正是靖國神社的前身。1979年東京招魂社移交至日本 軍 方後，正式更名為靖國神社，但伴隨著軍國主義的對外擴張，侵略戰爭中沾滿鮮血的「劊子手」也成為了供奉的對象。
給周邊國家帶來沉痛災難的惡魔，卻被日本視為為榮耀而戰、為天皇而戰的英雄，假若其中祭奠的是被侵略保家衛國的英雄，周邊國家恐怕不會有半分不滿，但他們卻是曾經發起非正義戰爭，挑起戰火的惡魔。
伴隨著美蘇之間的對立，日本成為對抗的馬前卒，受到美國扶植並籤訂《日美安全條約》，日本開始肆無忌憚的為二戰戰犯開脫，妄圖洗清歷史罪行，暗自將大量丙級戰犯與乙級戰犯送入靖國神社，加之美國的默許，此後愈發猖獗，1978年，靖國神社管理部門甚至將二戰中14名甲級戰犯送入神社。
1985年，曾根康弘更是不顧受侵略國聲討反對，首次以首相身份帶著一眾內閣成員，在8.15日這一天公開參拜靖國神社。
此後，之前八次弔唁的昭和天皇，以及之後的平成天皇、令和天皇、明仁天皇從未祭奠靖國神社；在侍候昭和天皇的侍從口述、以及相關記載中，均表明昭和天皇將14名甲級戰犯移入神社的行為不滿；而天皇不去祭奠靖國神社的另一面，與君主立憲的體制有關，尤其是在參拜靖國神社逐漸變為「得到選票」的今天。
而靖國神社其實是一個神道教建築，這也是於烈士陵園最大的不同，除了紀念目的外，作用是為了將因「天皇」戰死的英靈召集起來。而後根據天皇許諾，將其封神祭奠，並送往天界成神。
除去靖國神社外，日本還專門為設立神社，常年祭奠著三位中國人；第一位便是徐福。據說秦朝時期，秦始皇命方士徐福帶領3000童男童女，去尋找長生不老藥，而徐福卻一去不復返，東渡日本帶著三千童男童女繁衍至今，成為最初的日本人。
而上個世紀50年代，香港學者衛挺生編著《徐福入日本建國考》，認為徐福便是日本神武天皇，引起日本巨大反響。在日本，從本州島東北部的青森縣至九州島的南部，留有徐福傳說或遺蹟之地多達 20餘處。近年來中日學術界也興起徐福研究熱，山東龍口、嶗山和江蘇贛榆、杭州，日本新宮、佐賀、東京、大阪、京都等地，徐福研究會的活動可稱活躍非常。
儘管徐福東渡只是傳說猜想而已，但還是得到了很多日本人的認同。其中伊紀半島熊野有徐福神社，千餘年間香火不絕，至今每年 2月、8月大祭兩次；在鹿兒島樹有「 方士徐福上陸地」 的標柱，還留有秦人港的地名；在富士山北麓，多傳說徐福在此採仙藥，並繁衍子孫，初稱秦氏，後稱羽田氏等等。京都府與謝郡印根町有新井崎神社祭祀徐福；佐賀縣的諸富町、佐賀市內均建祭祀徐福的金立神社，追憶其傳播農耕、養蠶醫藥之德。
第二位是林淨因，元朝時期日本僧人龍山德見，在浙江普陀等地學佛長達40多年。1350年，龍山德見東渡日本，俗家弟子林淨因和他一起到達了日本奈良。龍山做了京都建仁寺的主持，林淨因便在不遠的奈良開了一家叫鹽瀨的饅頭店維持生計。而當時的日本並沒有掌握髮酵工藝，面點多由米餅代替，而林淨因用中國的饅頭技術，做了一種豆沙餡的饅頭，又在饅頭上描上林字，製成了獨特的「林氏饅頭」，林氏饅頭由於風味極佳，甚至成為天皇專供，後來甚至演變為婚禮習俗。
第三位便是蔣，不僅十分大度放棄對日戰爭賠款，並且反對戰勝國分區控制日本，兩次拒絕羅斯福讓中國管轄琉球的提議，並無條件返還戰俘、僑民。
神社碑文上記載曰：「與人為善」是中華民族的傳統美德，反對分區佔領日本，放棄戰爭賠款，反對罷黜天皇，200多萬軍民即行遣歸日本。由此，才有如今廠之興旺。想來對於戰敗國，這種寬容是各國前所未見的。大恩無以為報，特立斯社於此，以表誠摯感謝，永世不忘。
戰火初歇，千萬同胞冤屈未洗，便已經為日本人民謀取福祉，果然深謀遠慮、寬容大度。要知道，以德報怨出來都不是中國傳統美德，是對孔子學說的斷章取義亂用。論語云：以德報怨，何以報德？以直報怨，以德報德。