音巢最初的首腦是一名叫：nests的老頭，也就是伊格尼斯的父親，最初是經營和平事業的貿易組織。但是在大蛇篇中，音巢意識到人類在「神」面前是如此的渺小，於是想利用目前人類已經掌握的基因改造技術，打造數量龐大的武裝力量用來對抗未來可能再次出現的大蛇。
而在封印大蛇的現場，音巢組織趁亂帶走了草薙京，想通過他的基因製造相同體質的複製人，並掌握他的草薙之炎。伊格尼斯自稱是「生命造物主」，是基因改造技術的核心成員，本來已經五十六歲的他看起來非常年輕。
音巢篇章中出現的擁有草薙之炎的人有兩種：
一種是複製人，草薙京一號、草薙京二號這種，他們是完全通過草薙京的基因複製出來的成品，擁有草薙京的記憶和絕大部分能力，而且相貌和草薙京幾乎一模一樣。但是在拳皇99之後草薙京脫逃，之後的複製人只能通過複製人來克隆，因此相貌發生了很大的改變，其中就有K9999和無名
其次就是K'這種改造人，本身就擁有最完美的體質，被強行植入了最原始的草薙之炎，不過這股力量短時期內無法完全掌控。
而我們可以看到，音巢的高層BOSS都是沒有火焰能力的，通過音巢的戰鬥服和音巣対流拳進行戰鬥。他們自然不會在自己身上植入什麼基因，將自己打造成改造人，這玩意有沒有副作用都還不知道。
遊戲中的幾位主角都是自帶火焰的，似乎這是主角的標配。不過K'在這裡就顯得比較尷尬了，因為他的火焰是來自草薙京，而且自己在沒有手套的情況下還不能完全掌握這股力量。而阿修、草薙京和八神的火焰都是來自本身。
在劇情中，八神闖入音巢營救草薙京，期間遭遇了大量的草薙京複製人，不過都被八神輕鬆搞定。「一群雜碎竟敢使用草薙之炎，你們比草薙京差得遠了。」
因此雖然在遊戲中出現的草薙京2號和1號比較厲害，但其實就是為了紀念草薙京之前的形象和招式而已。真正的實力在八神面前不值一提。
當然了，還有很多小編沒有提到的，歡迎大家補充，小編會在之後繼續整理。
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