在大多數人眼裡，能擁有過人才能是一件非常幸運的事情，然而「天才」的人生或許並如我們想像的那般輕鬆，《神聖之門》中便有這樣六位被賦予「天才」頭銜的人，他們所付出的是「失去」的代價。
【炎才·巴甫洛夫】
巴甫洛夫是《神聖之門》主角之一赤音的父親，在一次試驗事故後，他消失在世人的視線中，所有人都以為他葬身在火海中。但實際上，巴甫洛夫失去一隻手臂，加入了世界評議會的研究所，秘密研究第五代自律型兵器。背負著天才名號，為了達到目的，巴甫洛夫甚至不惜利用了自己的兒子，但他同時也在鍛鍊赤音，將自己對未來的希望寄托在赤音身上。
【水才·薛丁格】
薛丁格在《神聖之門》中，像是一種純粹惡的存在。他不相信言語的意義，因此將自己的嘴巴用義口型裝置封住。但在那個藍色聖誕節的夜晚，他在飛舞的刀刃中，找到了自己認為可以超越言語交流的初戀，並與其展開了一場瘋狂地屠殺。事後，名義上被逮捕的薛丁格，卻出現在了世界評議會的研究所中，進行著第五代自律型兵器的研究。
【風才·拉普拉斯】
只因擁有過高的才能，就被視作高危分子，拉普拉斯被折斷雙翼，驅逐出天界，甚至連名字都被從記錄中抹除。懷著對天界的仇恨，妖精化身成惡魔。墜入常界的少女成為聖歷天才的一員，在世界評議會中進行著研究。義翼型裝置完成後，拉普拉斯重新擁有了翅膀。憑藉自己的能力再一次在天界展翅翱翔。
【光才·卡涅阿德斯】
卡涅阿德斯本身生活在魔界的魔物，她的右眼能看到的全是世間的幸福，左眼卻只能看到無盡的悲傷。面對這種分割的悲劇，她選擇用義眼型裝置遮住自己的左眼。尋求著幸福的卡涅阿德斯，提出了一種以幸福代替懲罰的刑罰，她試圖用幸福讓犯人忘卻惡意，於是一間充滿幸福的「第七監獄」在《神聖之門》中誕生。
【暗才·亨佩爾】
身為魔物的亨佩爾暗戀著閃耀光輝的美麗妖精，各自害羞的兩人，讓這場戀情成為了悲劇。亨佩爾的心臟隨著破碎的戀情一同消失，義髒型裝置則代替心臟填補了胸腔的空洞。失去希望的亨佩爾受到「上位者」的邀請，加入了世界評議會，在世界評議會的支持下。反覆做著試驗，第五代自律性兵器由此誕生。
【無才·莫比烏斯】
莫比烏斯的出現令世界一片歡騰，因為她可以聽到未來的聲音，因此避免了許多事故和天災的發生。然而當她作出與「神聖之門」有關的預言並應驗時，世界陷入空前的混亂，世人將她視為「惡魔之子」，無數的指責和謾罵衝入莫比烏斯的耳中，被世界背叛的她用義耳型裝置將耳朵封閉，與無數自立型監視裝置一起，開始了第五代自律兵器型兵器的研究。
這六位角色都取材自不同時代的歐洲科學家，俄國生理學家巴甫洛夫，奧地利理論物理學家薛丁格，法國數學家拉普拉斯，雅典哲學家卡涅阿德斯，德國邏輯學家亨佩爾以及德國數學家莫比烏斯，現實中在各自領域有高深造詣的科學家們，在《神聖之門》中依舊背負了「天才」之名，為各自而戰。