作為連載了21年的動漫《名偵探柯南》，由於其作品定位為推理，是一部極為燒腦，同時又案件虛無縹緲，讓很多的人為其痴迷。藉由之前漫畫連載到1000話這個契機，《少年SUNDAY》發起了一個投票的活動，讓粉絲們選出他們本人心目中著名的案件。投票結果出爐了，那麼你更為喜歡哪一部呢？
第一名：緋色篇
共有8489位讀者為這一章節奉獻了本人的選票。「緋色篇」的最大看點除了在於它是《柯南》裡難得一見的主線劇情外，還正式揭曉了赤井秀一「死亡」的謎團，並讓安室透（波本）的真實身份得以曝光，其中層層盤繞緊扣的線索和各陣營角色鬥智鬥勇的橋段都可謂經典。
第二名：人魚篇
票數為5835票。事先遠山和葉在《柯南》裡屬於出場不久戲份不多的新角色，而她與平次之間的關係正是經過「人魚篇」得以確認的。在找尋人魚墓的進程中，平次與和葉不慎滑落懸崖，好在平次牢牢抓住和葉的手防止了進一步下墜。為了保全平次的生命，和葉不惜扎傷了握住本人的那隻手，而此時平次的一番真情告白更是打動了許多人。
第三名：月光奏鳴曲殺人事情
共5742票，又是一個令人最可惜的案件，這也給柯南的內心留下了難以磨滅的創傷。這場案件最重要的中央除了犯人男扮女裝行兇之外，他在熊熊熄滅的房子裡漠然彈奏《月光曲》的場景也刷新了《柯南》裡兇手慣有的殘酷抽象。
經過這件事，柯南在今後的辦案進程中改動了本人的推理作風，在戳穿犯案手腕和線索的同時給兇手留下一條自首的路，防止相似的他殺行為再次呈現。
第四名：福爾摩斯的默示錄
共5474票，關於廣闊新蘭黨來說，這次的故事可謂是最值得慶祝的——倫敦大本鐘下，新一初次向小蘭正式告白，著實為讀者們發了一把糖。不過相比於開頭處這段高能劇情，案件自身的殺人魔反倒變得平淡了……
第五名：震動警視廳1200萬人質
票數為5258。在這個案件裡，已經因排爆失敗而不幸殉職的松田陣平警官初次退場，雖然戲份不很多但成功降服了讀者的心。除此之外，人質事情讓高木警官和佐藤警官的關係進一步開展，柯南在電梯裡與高木的那段「臨終對話」異樣令人感受頗深。