哈哈，這個問題有意思了，火影忍者裡邊如果小南和自來也打的時候佩恩不出手小南會被打敗嗎？個人認為小南兇多吉少，當然如何這個階段小南已經在準備六千億起爆符的情況下還有一線生機，下面具體說明一下。
自來也知曉小南的能力特點，因此一對一的話小南想要利用紙片化特殊能力規避物理傷害基本上是不可能的。
火影忍者裡邊曉組織成員小南的得意技能就是紙片化忍術，能夠利用這招免疫大部分的物理攻擊。當然火影中沒有無敵的技能，因此小南的特殊能力也有弱點：①小南查克拉耗盡就無法維持紙片化的形態，這一階段小南是無法規避物理攻擊的，最後被帶土偷襲成功就是因為小南發動六千億起爆符耗儘自身的查克拉。②怕油：小南的紙片化過程如果遇到油性物質就無法順利分離和進行形態變化，同樣無法抵禦物理輸出。
而自來也在以前輔導小南，長門和彌彥期間其實已經對小南的特殊能力有所了解了。因此在戰鬥的初始階段就利用蛤蟆油讓小南無法順理使用自己紙片化的能力，而小南的攻防行動都需要以紙片化變形為基礎。被油覆蓋以後的小南基本上廢了沒有佩恩幫忙的話只能被自來也蹂躪了。
如果這個階段小南已經在準備六千億起爆符還有活命的機會。
劇情中雖然是小南和帶土對決的時候才出現了六千億起爆符，但是個人猜測其實是帶土成為曉組織幕後操縱者以後小南和長門為了防備帶土做的後手準備。六千億起爆符的準備周期應該是比較長的，因此在自來也和小南對抗的時候如果小南以使用大規模起爆符為威脅是有可能讓自來也住手的，自來也去雨忍村的目的是打探佩恩的能力情報，因此在之前是不會拿自己性命開玩笑的。
所以如果小南以起爆符威脅自來也有可能讓自來也放棄進攻小南，當然這種推測也是建立在自來也不削弱曉組織實力的情況下，如果自來也狠一點是完全有機會在小南被蛤蟆油覆蓋以後進行攻擊的，本身自來也的技能攻擊能力就不弱，一個組合忍術來一發估計小南就完了。這就看小南敢不敢賭了，不賭的話自來也如果不能從小南這裡得到佩恩的情報小南基本上是活不了的，拼一把還有活命的機會。
最後總結一下，如果只討論忍者技能之間的相剋關係，小南基本上是打不過自來也的，自來也能夠利用蛤蟆油讓小南無法使用紙片化變形，分析不到位地方請見諒，各位有其他想法歡迎留言討論。