《妖精種植手冊》這是一部玄幻、穿越、後宮相結合類型的動畫，是由DAZUI創作的超人氣同名漫畫改編。主要為我們的主角園丁的視角，他是一枚離家出走的宅男，來講述穿越到朵雅大陸，踏上收集妖精旅途發生的一系列奇幻故事。看到這個《妖精種植手冊》這部動畫名字的時候，想到的是妖精種植，覺得應該是部很萌很可愛的動畫作品。
園丁本來是打算坐飛機去動漫樂園看漫展的，也是一位愛好動漫的人物。本以為自己在想像可以穿越什麼的，他戴著耳機閉著眼睛準備上飛機，沒有注意到身邊環境的變化，自己誤打誤撞來到了朵雅大陸。在朵雅大陸園丁見識了美麗的朔月學院、地龍拉著的馬車、天空中使用魔法決鬥的學員，這一切都不同於自己生活的地方，我們的主人公園丁將如何快速地適應這裡的呢？
來到朵雅大陸之初，沒有意識到自己穿越了，以為自己來到了動漫樂園，這裡合個影那裡拍張照。後來反應過來之後，覺得自己是主角有開掛的人生，可以走上人生巔峰，迎娶白富美，正沉浸在幻想裡的園丁被一位老伯打斷了思緒。老伯帶著他去了入學測試的地方，覺得應該是測試什麼靈力之類的，自己應該是萬眾矚目的。
沒想到測試出來的真相是他被淘汰了，因為他的光是白色的。原來朵雅大陸的世界是由魔法和鬥氣組成，鬥氣為金，魔法為彩。木者綠、水者藍、風者青、火者紅，每一種魔法原力都對應一種顏色。發出白光的園丁同學，完全沒有魔法和鬥氣，屬於廢材的資質。
在老伯的安慰下，成為了朔月學院的花園園丁，老伯送給了他一顆妖精種子，一次意外解封了妖精的種子，覺醒了體內馭使妖精的力量。墨緋破封的時候吸乾了園丁的生命力，用魅魔的生命獻祭後，園丁才得以復活，復活後的園丁集擁有木水雙屬性的極高資質、魅魔的誘惑能力，想收集齊所有的妖精。
園丁種植了許多的妖精，墨緋是園丁種植的第一隻妖精，對應花朵「彼岸花」，在前世被園丁設計，因此願望是親手殺死園丁，還有「並蒂蓮」連霜也是特別痛恨園丁，她們在瀕死前被改造成妖精。原來前世的園丁為了創造妖精和妖精手冊，做事不擇手段，為了創造妖精使許多無辜的人失去生命，導致現在有不少妖精想向園丁報仇。
穿越的故事情節、現實世界與冒險世界的強烈衝突，形成巨大反差，這些都能夠吸引更多觀眾。《妖精種植手冊》同樣是穿越劇，宅男園丁去到異世界，本以為能夠走上人生巔峰，拯救世界，沒想到這部動畫打破了傳統的套路，是一個廢材主人公，成為一個種花的園丁。無意中激活了妖精種子，本以為又是妖精出場要報答恩人，沒想到卻是要殺死主人公這樣的設定。
男主和妖精之間的恩怨糾葛，隨著故事的發展出現越來越多的妖精物語。園丁只有頭髮絲裡只有一丟丟木屬性的魔法能力，註定了園丁是園丁，魔法是種植魔法。種植妖精是一個非常新鮮的動畫類型，妖精是故事裡的最強生物，主人公可以種植妖精，但是種植的卻是要取自己性命的妖精墨緋，故事根本不按照套路出牌，這是這部動畫作品的有趣設定。