頂上戰爭是海賊王中規模最大的戰爭，戰爭爆發的焦點是海賊王羅傑的血脈艾斯被公開處決。海軍本部與四皇白鬍子海賊團發生了全面戰爭，海軍本部佔據巨大優勢，海軍本部出動了三大將，王下七武海，十萬海軍精英，全力迎戰白鬍子海賊團。這場戰爭最終以白鬍子和艾斯雙雙戰死而終結，海軍本部取得了全面的勝利。
頂上戰爭爆發的關鍵焦點是黑鬍子擊敗了艾斯，並作為交易籌碼送給了海軍本部，黑鬍子得到了七武海的稱號。海軍本部早就知道了艾斯是海賊王羅傑的兒子，艾斯在新世界闖出名聲，海軍本部就察覺了，並邀請艾斯成為七武海，進而把艾斯除掉。海軍本部沒有出手的機會，因為艾斯也被白鬍子暗中保護了，並親自帶走了艾斯，艾斯的身份是他親自告訴白鬍子的，從此以後，白鬍子一直想要把艾斯培養成為下一代海賊王。
頂上戰爭非常激烈，海軍本部出動了全部的實力來對付四皇白鬍子海賊團，白鬍子和艾斯雙雙隕落，紅髮香克斯出現後，戰爭才結束。頂上戰爭不可能再發生了，也沒有誰能讓海軍公開處決，除了路飛這種與艾斯一樣繼承了世界最兇惡犯罪的血脈，才會受到公開處決的對待，其他大海賊都只是關押在海底大監獄裡。在和之國篇章中，四皇大媽與百獸凱多的確結為了海賊同盟，他們結盟的消息已經被海軍本部知曉，海軍本部陷入了一片混亂中。
大媽和凱多結盟，他們要對付的是草帽一夥，光月家族的反叛勢力，凱多和大媽才不會主動去攻擊海軍本部，他們在和之國安心對付草帽一夥。兩個四皇團結盟實屬罕見，要是他們去攻打海軍本部，打贏的機率也不大，海軍本部擁有三大將，卡普戰國退居二線，他們還是擁有強大的實力，即使是沒有七武海的幫助，海軍本部也足夠戰勝兩個四皇團，海軍才是海上真正的王者。