《結城友奈是勇者》第二季分為兩部分。
前一部分(大概1-6集)是鷲尾須美、乃木園子和三之輪銀三個小學六年級學生被神樹選為勇者和巴提克戰鬥。由於這時候勇者系統還不完善,鷲尾須美、乃木園子和三之輪銀只用普通形態和巴提克進行戰鬥。因為還不懂得封印巴提克的手段,只知道硬打。所以每次打完巴提克都是傷痕累累。好在前面每次出現巴提克的數量是一隻,鷲尾須美遠程支援,乃木園子護盾防禦,由攻擊力最強的三之輪銀解決。
《結城友奈是勇者》第二季
鷲尾須美,有著十分強烈責任感和愛國情懷。後來搬家後成為結城友奈的鄰居,與其成為摯友。沒錯!這位就是第一季裡那個砍樹大隊長東鄉美森,只是她改名了。
乃木園子,性格溫和,隨機應變。但在關鍵時刻的有著敏銳判斷力,她是勇者三人組的隊長。
三之輪銀,性格開朗活潑,擅長運動,樂於助人。在她的努力下,促進了勇者系統的更新。
《結城友奈是勇者》第二季
新的勇者系統更新了精靈,使勇者不會在戰鬥中死亡,還能使用「滿開」技能,使勇者的能力提升數十倍。但是使用「滿開」技能後會「散花」,使勇者身體的某一部分失去功能。在最後她們付出極大的代價擊敗12隻巴提克。
《結城友奈是勇者》第二季
第二季的後一部分(大概7-12集),接第一季,也就是第二季前一部分兩年後的事。東鄉美森砍樹之後,勇者系統又一次更新完善。(一個成熟穩健的系統總是在不斷困難和挫折中走出來。)系統勇者人數增加,且勇者使用「滿開」技能後不會有「散花」的副作用,變為了讀條,同時精靈的保護也消失,要等到讀條完畢才恢復。
《結城友奈是勇者》第二季
恢復身體後乃木園子也加入「勇者部」。結城友奈她們本以為可以過平靜的生活,但是有一天,結城-友奈發現她們都把東鄉美森的存在給遺忘了,然後她們找到並救出被獻祭的東鄉美森。
《結城友奈是勇者》第二季
原來,由於東鄉美森破壞結界的一部分,導致外界的火發生了活性化,若是置之不理,外界的火就會吞噬這個世界。想要壓制火勢只有舉行火祭,就是將能夠聽取天意的巫女祭獻給外界的火焰,以此請求天神的寬恕。東鄉美森既是勇者又有巫女的力量,結界又是她破壞的。所以她自願去當祭品了。
《結城友奈是勇者》第二季
在解救東鄉美森的過程中火焰的印記也轉移到了結城友奈的身上。使結城友奈每天都要承受天神作祟的痛苦。
《結城友奈是勇者》第二季
300年來神樹的壽命即將迎來終結,大赦找到裡結城友奈,讓她與神樹結婚。永遠與神共存,使結城友奈成為神,人類成為神的眷屬,得到神的庇護。就是把結城友奈當作貢品獻給神。
《結城友奈是勇者》第二季
「勇者部」的各位知道這消息後都表示反對神婚。他們決定搶親。這時候天上神也不同意有人類成神。來攻擊神樹。最後神樹還是選著相信人類,放了結城友奈,用最後的生命力施展了「開花」技能反擊了天上神。
《結城友奈是勇者》第二季
然後神樹死了。人們在神樹的軀體上發現了石油。以後勇者們估計要拿著冒黃火的噠噠突突和巴提克幹架了。時代變了。