神奇寶貝的進化伴隨著無限種可能性，雖然大部分神奇寶貝的進化都是一條直線，但有一小部分神奇寶貝非常獨特，它們能夠分支進化成兩種不同的神奇寶貝，根據訓練家飼養的方式不同、進化渠道不同等等，神奇寶貝會發生不一樣的變化，就連噴火龍的超級進化都能根據鑰石的不同，分別能在戰鬥中進化成超級噴火龍X和超級噴火龍Y。那能進化成兩種形態的神奇寶貝都有哪些呢？接下來就讓我們一起盤點一下吧！
臭臭花
在走路草進化為臭臭花之後，它開始散發出奇臭無比的味道，不過據說這種味道每一千個人裡面也會有一個人覺得很好聞，這也使得敵人在接近它之前就遠離了，而臭臭花的進化有兩個方式，使用葉之石能進化成霸王花，使用日之石能進化成美麗花。
蚊香蛙
蚊香蛙是水屬性神奇寶貝，它同時擅長在水中和陸地上生活，它通過水之石可以進化成快泳蛙，同時兼具水系和格鬥系，在動畫中的大多數時間都是和格鬥系的彪形大漢們聚在一起，蚊香蛙如果戴上了王者之證就能進化成牛蛙君，和之前發生非常巨大的變化。
呆呆獸
另一種攜帶王者之證進化的神奇寶貝是呆呆獸，它如果頭上戴著王者之證同時被大舌貝咬住腦袋就會進化為河馬王，一掃之前的呆滯，變成非常具有智慧的神奇寶貝。如果沒有道具，呆呆獸被大舌貝咬住尾巴，就會進化成呆河馬，因為呆呆獸經常用尾巴釣魚，因此很容易就會不小心進化。
奇魯莉安
這是在芳緣地區首度出現的神奇寶貝，奇魯莉安形態非常優雅美麗，身上就像穿著芭蕾舞的裙子一樣，正常情況下奇魯莉安會進化成超能力系的沙奈朵，但如果雄性的奇魯莉安使用了覺醒之石就能進化成艾路雷朵，成為既會超能力又擅長格鬥的戰士。
雪童子
這種神奇寶貝只會出現在寒冷的地方，在這裡它們被譽為祥瑞之兆，傳說它們進入過的家裡會變得興旺，因此人們非常喜歡雪童子。雪童子的進化情況剛好和奇魯莉安相反，通過積累它能夠進化成冰鬼護，小智的雪童子就是進化成了冰鬼護，而雌性的雪童子使用覺醒之石能進化成雪妖女。
刺尾蟲
芳緣地區刺尾蟲的存在相當於關東地區的綠毛蟲，它實際上是實力非常弱小的，只能靠躲在森林深處躲避鳥類神奇寶貝的追捕。刺尾蟲的進化是根據一個獨特的指標，就是性格值，這個在動畫中是看不出來的，因此小遙的最終進化成了狩獵鳳蝶，武藏的那隻進化成了毒粉蝶。
珍珠貝
對於珍珠貝和之前的大舌貝有過一個對比，珍珠貝產出珍珠的價值是大舌貝的十倍以上，不過它一生僅能產出一顆珍珠。它被貝殼包裹的身體會逐漸長大，成長到一定程度就會達到進化的臨界點，它的進化是需要攜帶特殊道具的，使用深海之牙會使它進化為獵斑魚，使用深海鱗片則會進化成櫻花魚。
科斯莫姆
阿羅拉地區的神獸，也就是小智得到的那隻小星雲的初次進化形態就是科斯莫姆，然而在最終進化之前，小智他們完全不知道自己親手照顧的神奇寶貝居然是阿羅拉地區傳說中的神獸。科斯莫姆可以在白天和黑夜分別進化成兩種形態，在白天它可以進化為太陽神索爾迦雷歐，在夜晚可以進化為露奈雅拉，兩種形態都有著巔峰的實力。