主角隊，由拳皇大蛇篇的男主角草薙京和自己的好友——超能力格鬥第二的二階堂紅丸和柔道冠軍大門五郎組成，三人全部來自於日本，是拳皇系列的原創人物。
餓狼隊，由來自餓狼傳說的男主角特瑞和男二號安迪，加上東丈組成。餓狼傳說一代只可以選擇他們三人。他們來自美國南鎮，擁有屬於自己的背景故事。
龍虎隊，由來自龍虎之拳的坂崎良和他的妹妹坂崎由莉及追求者羅伯特組成。與他們有關的還有在拳皇系列中出鏡不少的天狗坂崎琢磨。
怒隊，遊戲名字來自於FC時代的射擊過關遊戲《怒》，拉爾夫和克拉爾兩人就是這個遊戲的兩個主角，至於莉安娜，他也是拳皇系列的原創人物。
超能力隊，鎮元齋為原創人物，椎拳崇和麻宮雅典娜曾經在FC遊戲《超能力戰士》中作為1P和2P的可選角色登場，他們的隊名也來自這個遊戲。
女性格鬥家隊，不知火舞來自餓狼傳說，King來自龍虎之拳，神樂千鶴和拳皇系列原創人物。女性格鬥家隊有過不少次的隊員更換情況，坂崎由莉也經常在這個隊伍中混日子。
韓國隊，由來自餓狼傳說的金家藩帶領自己的兩個徒弟陳國漢和蔡寶健組成，兩個徒弟為拳皇系列原創人物。據說金家藩徒弟遍天下，跆拳道的功夫想來是不錯的。
地獄樂隊，由七枷社、夏爾米和克裡斯三個拳皇系列原創人物組成，覺醒後成為大蛇隊。三人在現實中都有不錯的職業，如果不是覺醒，估計他們會生活的很快樂。
97特別隊，由來自餓狼傳說的山崎龍二、瑪麗和比利組成。在拳皇97新加入人物投票中，三人得票最多，就組成了這個不倫不類的隊伍，而且山崎龍二還被硬按上了大蛇八傑集的設定。
專業坑隊友，坑到沒朋友的八神庵只能一個人參加比賽，至於是為了什麼，不得而知。冷酷依舊的他其實有著一顆溫柔的心。
人生巔峰的矢吹真吾，能夠和八神庵站在同一行成為沒有隊伍的角色，這輩子值了。
最終Boss大蛇，當年人氣最高的角色。以操作簡單，傷害爆炸著稱。