《齊木楠雄的災難》很快就要與大家在一片歡聲笑語裡說一句不舍的「撒由那拉」了。完結篇也與TV版一樣，每一集有很多內容不同的的部分。
1.多彩的志願首先就是和標題一樣，大家面臨著高三的選擇，即將分班，填報志願。那麼pk學園的米娜桑都有什麼想法呢？
齊神的想法：擺脫現在循環的世界，邁向未來； 燃堂在把志願單折成千紙鶴前終於寫下了：和橋本環奈結婚，和茅野愛衣結婚…..的「偉大志願」；我們的中二小天使海藤覺得自己會再次被捲入到更大的戰鬥漩渦中去（好擔心他右手的力量啊），然後寫下了三所大學的三個不同專業，然而大家和他說他好像可以去更好的學校…..；熱血的灰呂認為自己喜歡幫助別人，別人也需要他釋放熱血的一系列騷操作，畢竟是一個能把冰塊融化的男子。不過大家很為他未來的學生擔憂，因為他身上教官的氣質絕對要多於老師; 亞蓮以後的志願是當老師，雖然曾經是不良，但他想要拯救與曾經的自己有相同經歷的少年；「神的女兒」照橋心美迅速將志願改成與齊木一樣的，震驚到了知予。心美，真不知道你哥哥會怎麼想。因為感受到了即將分別的氣氛，大家打算紀念最後的高三生活。
2.齊木空助的新招式
與此同時齊木的哥哥空助又使出了新花樣——「仿生的機器人楠雄」，看來又要與齊木較量一番了。機器人楠雄在走廊與灰呂等人相遇了，在一旁隱身的齊木會怎麼做呢？由於空助給仿生機器人下達了「做一個受歡迎的人物」的指令，生性低調、渴望做一個普通人的齊木受到了極大的挑戰。
他們之間的戰爭開始了。讓齊木感到為難的是，本想要在放學後再處理這件事情的計劃被空助的另一個指令打斷了。仿生機器人會在正午前進行全裸跑步！而齊木的抑制器會讓仿生機器人做出攻擊行為。正在他苦思無果之時，一向不正經的通靈少年鳥束來救場了。齊木拜託他把仿生機器人的頭擰了下來，雖然災難告一段落，但空助暗中關注了這個不正經的少年。
3.兄弟倆的戰鬥二回目
果不其然，鳥束被哥哥帶到實驗室，灌輸了一周對齊木的仇恨。令人忍著笑意的是，即使能被一流的格鬥家的幽靈附身，但是鳥束的勇猛一擊，卻被齊木輕鬆揮動拳頭擊破。齊木的身體被鳥束奪走了，但他靈機一動又用原來的方法把身體奪了回來。空助發動了最後的王牌——貓坦克。
彈幕齊齊發出「淚目」是何緣由，原來即使被灌輸了一周對齊木的仇恨，鳥束還是沒能真正恨上齊木。雖然看似好勝的但一直處於下風的空助要製造災難給齊木，並把自己作為賭注，但齊木深知哥哥的品行不壞，一一化解。而且讓人感動的是齊木為了保護鳥束和不打亂他的生活，即使打敗了哥哥，也拔出了右邊的抑制裝置……齊木沒有判斷失誤，最後果然是被哥哥誆了，這也許就是空助對弟弟的「愛」吧！
看似依舊高冷的超能力者齊木楠雄，其實早已經被燃堂等人攻略了，使用超能力保護著這個地球不被毀滅的楠神反差萌巨大，我們不會忘記他還有個脾氣很像的「妹妹」，恩愛的爸爸媽媽，傲嬌的姥爺，時尚的外婆……還有一堆西皮，比如海藤，心美。但是燃堂，你不用想了……米娜桑，我們下期再會~