火影中的忍術數不勝數，各種招式讓人應接不暇。大部分忍術都有特定的屬性，只要自身的查克拉屬性符合要求就可以修煉。然而，並非所有的忍術都是這樣。有一些忍術非常特殊，有一些甚至在全集中只出現過一次！
時空間類忍術火影中最典型的時空間忍術就是飛雷神之術和神威，兩者都非常特殊，與常規的忍術有著天壤之別。首先是飛雷神之術，釋放時不需要任何結印，只要在適當的地方或是物體上做好標記，隨時可以瞬間移動到標記點。
帶土和卡卡西的神威則是萬花筒自帶的瞳術能力，兩個神威的空間相互連接.但是帶土的神威只能將自身置於神威空間裡，卡卡西的神威則是可以將除自身外的其他物體轉移到神威空間裡。同樣屬於瞬髮型忍術，且僅有帶土和卡卡西會。
塵遁塵遁是超越「血繼限界」的「血繼淘汰」，也是劇中唯一的血繼淘汰，除此之外再無第二個忍術。塵遁由風、火、土三種查克拉屬性相互融合產生，將攻擊和結界相互結合，強大的破壞力無人能及。塵遁限界剝離之術是最強殺招，威力增強的同時破壞力還具有持續性，接近結界的任何物體、敵人都會化為原子狀態，僅一招就能同時滅掉宇智波斑25個木遁分身的須佐能乎。要知道，須佐能乎可是堪稱絕對防禦的忍術。
尾獸玉尾獸玉是少有的S級忍術，是傷害最高的忍術之一，極限釋放的狀態下可以直接毀滅一個忍村。尾獸玉的釋放條件也很苛刻，尾獸自身可以單獨釋放，但是人柱力需要和尾獸相互認可完美結合才能自主釋放。不管在什麼戰鬥中，尾獸玉的威力都不容忽視，釋放尾獸玉的目標在戰場上一定是所有人優先處理的對象。尾獸玉只能通過特殊的時空間忍術來轉移，或是用絕對的實力來硬控，除此之外沒有別的辦法。
螺旋丸系列螺旋丸本身就是一個特殊的忍術，由尾獸玉衍生而來，四代通過對尾獸玉的模仿而開發的術。而最特別的在於，螺旋丸本身不是單一的一個忍術，只要精通螺旋丸就可以在其基礎上不斷地進行開發升級。螺旋丸有一個系列的忍術合集，大型版的大玉螺旋丸、螺旋手裏劍等，都是經過研發後升級出來的。包括後續的戰鬥中出現的各大遁螺旋丸，就是鳴人在其中融入了特殊的查克拉屬性，螺旋丸是個可以不斷升級、強化、融化、改進的術。
靈化之術該術是加藤斷獨有的S級忍術，可以讓靈魂脫離自身肉體，通過靈魂狀態來進行無距離的殺害敵人。也可以進入敵人的精神世界，對其精神造成攻擊或是控制敵人身體的主動權，可以殺人於無形。靈化之術不僅可以用於戰鬥，還能用於傳遞情報信息或是提供自身查克拉給友軍。該術唯一出現的一次就是加藤斷在第四次忍界大戰中為綱手恢復了查克拉，救了綱手一命。此術僅出現這一次，且沒有第二個人會使用。
這些特殊的忍術都是顛覆正常認知的存在。但也正是因為足夠特殊，所以才擁有極強的實戰能力，在戰鬥中可以輕鬆依靠這些術來獲取優勢。