在已知的17種類別的神奇寶貝裡邊兒。有一些什麼寶貝的數量是非常多的，比較常見，比如說我們的皮神。在剛開始火箭隊想要搶走皮卡丘的時候，小智就對他們說過，皮卡丘這種神奇寶貝非常的多，就像路邊的野狗一樣，多不勝數。為什麼會偏偏看中他這一隻？今天我們先不說皮卡丘為什麼這麼特殊。就說一些在神奇寶貝世界裡邊比較罕見的神奇寶貝。這些神奇寶貝平常人很難見到。一般都只存在於傳說之中，好多人都不相信有這種神奇寶貝。可是我們的主角小智卻都見過。
在神奇寶貝的第一集裡邊兒，因為小智誤傷了烈鳥。導致一大群烈鳥的報復，小智和皮卡丘都收到了，很嚴重的傷害。在他們宿舍，雨過天晴的那一瞬間，從天空飛過了一個神奇寶貝，就是鳳王。鳳凰的外形比較像孔雀和鳳凰。據說當鳳王飛過的地方會形成彩虹，這也不難解釋，為什麼小智和皮卡丘，醒來之後看到鳳凰的時候，剛好天邊有彩虹。鳳凰還具有復活逝者的神奇力量。所以就有傳說看到鳳凰的人會獲得永遠的幸福。鍾之塔燒毀之前風王一直都在鈴鈴塔頂棲息。後來一直在天空飛行，想要找到一個內心純潔的神奇寶貝訓練師。
在第62集裡邊，小智他們又一次來到了常磐市，要進行最後的一次挑戰，獲得最後的一枚勳章。在武道館門口遇到了小茂，然後小茂就先小智一步去進行了挑戰，就是在這一次的挑戰中，小茂遇到了超夢神奇寶貝，大家都知道超夢是人為製造出來的，是以夢幻為母本加以改造並且克隆而來的神奇寶貝，不過超夢的體型和夢幻相去甚遠。超夢應該屬於超能力系，可以通過精神力幹擾實現飛行。具有很強的自我再生能力，能迅速從瀕死狀態恢復過來。不過在這一集裡邊，超夢明顯還沒有自己的自我意識，完全被火箭隊的老闆給控制住了。就算如此超夢確實非常的強大，在他面前，小茂的神奇寶貝完全沒有反手之力。
火焰鳥也是傳說中的神奇寶貝，據說只要火焰鳥出現，春天就會來了。火焰鳥的頭冠和尾巴都是由火焰組成的。翅膀上面也有火焰狀的羽毛覆蓋。在神奇寶貝特別篇中火焰鳥唄納茲獲得。後來那次被小智，小茂和小藍的三位一體技能打敗之後，火影要從新獲得了自由，回到了野外。在春天來臨之前，火焰鳥會向雪國遷徙，能讓這些寒冷的地方先一步進入春天，是一種很少見的傳說神奇寶貝。
此君是極光神奇寶貝，乘著北風在世界各地巡迴清潔汙水。它擁有在水上行走和淨化水質的能力。之所以說它乘著北風，是因為水君現身的時候，會莫名的吹起北風，然後在大地上四處奔跑。可以讓汙水重新清澈。在神奇寶貝特別篇裡邊，水軍於150年前與燒焦塔中喪生，後來因為鳳王的力量而重生。一直在成都和關都地區四處奔波，尋找能打敗面具男的訓練家，想要解救鳳王，報答鳳王的救命之恩。最終水君和小霞結對。