在大部分主系列作品中，給新人訓練師（也就是玩家及其勁敵）的御三家寶可夢都由當地的寶可夢博士提供，主角的圖鑑也是他們給予。
除了照顧新人訓練師以外，寶可夢博士還擔任寶可夢研究的先鋒，他們都有不同卻又息息相關的研究領域，每個寶可夢博士之間也都有往來。
在《Ｘ／Ｙ》中登場的布拉塔諾博士，是首度擁有「寶可夢博士」這個訓練家類型的博士。此後第七世代的庫庫伊博士也擁有這一訓練家類型。
大木博士
大木博士名為大木雪成，是最早出現也是在遊戲中登場次數最多的寶可夢博士，居住在關都地區的真新鎮，他也是寶可夢圖鑑的主要製作人之一。
在第一世代遊戲他會讓玩家和勁敵選擇御三家寶可夢，也會在之後帶領主角進入名人堂。
四天王之一的菊子曾和大木博士是好友，直到他研究起神奇寶貝後，菊子認為他實力太弱無需對戰。
在第一世代的遊戲存在與大木博士對戰的漏洞，但怎麼觸發我就不知道了=。=
大木博士的主要研究領域是寶可夢與人類的關係。
2.空木博士
空木博士是大木博士的學生，居住在城都地區的若葉鎮。
在金銀水晶心金魂銀中他會提供御三家寶可夢。
他的研究領域是寶可夢的繁殖習慣，同時大木博士也說過他是研究寶可夢進化的尖端人才。
3.小田卷博士
小田卷博士居住在豐緣地區的未白鎮，但總是在野外研究。
在紅藍綠寶石Ω紅α藍中他會提供御三家寶可夢。
小田卷博士的主要研究領域是寶可夢的棲息地。
4.山梨博士
山梨博士是住在神奧地區真砂鎮的寶可夢博士，他曾經和大木博士一起研究寶可夢，但後來對神奧地區產生了濃厚的性卻就搬到了這裡。
珍珠鑽石白金中的御三家寶可夢是他落下的，也算是提供，反正是給玩家的。
山梨博士是研究寶可夢進化的權威。
5.紅豆杉博士
紅豆杉博士的居住在合眾地區鹿子鎮的寶可夢博士，她是遊戲中第一位女性博士。
在黑白中她會提供御三家寶可夢。
紅豆杉博士的研究領域是寶可夢起源。
6.布拉塔諾博士
布拉塔諾博士是居住在卡洛斯地區密阿雷市的寶可夢博士，他曾是山梨博士的學生，布拉塔諾博士是一個很有魅力的人。
他的研究領域是寶可夢超級（mega）進化。
7.庫庫伊博士
庫庫伊博士是居住在阿羅拉地區美樂美樂島好奧樂市郊的寶可夢博士，他同時還是個摔角手。
在太陽月亮中他會帶主角去選擇御三家寶可夢。
他的研究領域是寶可夢的招式。
除了這些出現在主系列遊戲中的主要寶可夢博士以外，在旁支系列、特別篇、動畫中還有很多其他的寶可夢。
合歡博士的名字只在《心金／魂銀》中阿露福遺蹟的研究所電腦上提及；
索藍斯博士是一位在豐緣地區秋葉鎮研究隕石的博士；
足跡博士（這稱呼好隨意）是一位在神奧地區研究寶可夢腳印的博士；
紅豆杉博士的爸爸是在合眾地區的寶可夢博士
真菰是合眾三曜市的博士，她是紅豆杉博士的大學時期的朋友，目前在研究有關寶可夢的夢境
公園博士是傳送工廠中登場的博士，研究神奇傳送的相關（原來你就是綠寶石提到的那個科學狂人啊）
阿克羅瑪是研究如何使寶可夢變強的博士，他也是等離子隊的老大之一
芭內特博士最早是在寶可夢ＡＲ搜尋器中登場的博士，研究夢之縫隙。她也在阿羅拉地區研究究極之洞，她是庫庫伊博士的妻子
成也大木是在阿羅拉地區研究寶可夢的地區形態的博士。
莫恩博士是在阿羅拉地區研究究極之洞和究極異獸的博士
還有一些只在旁支系列登場的博士
新原教授是在寶可夢巡護員系列遊戲中登場的博士。
暮陰博士和姜荷博士是ＸＤ中登場的博士。
P教授是寶可夢益智方塊中登場的博士。
方塊博士是寶可夢繪圖方塊中登場的博士。
維羅博士是Pokémon GO中登場的博士。
動畫原創的博士也有不少
秋葉原博士是在關都地區研究寶可夢寄放系統的博士，他創造了名為零號機的多邊獸，也就是造成「3D龍事件」的那一集。
西野森五世是住在關都地區比努的博士，負責撰寫寶可夢圖鑑資料。
內木博士是在橘子群島研究寶可夢差異的博士，她也是第一個女性寶可夢博士，在動畫中先於遊戲的紅豆杉博士。
倫多博士是住在豐緣地區拉魯斯市的博士。
芥子蘭博士是在神奧地區的博士，也是竹蘭的祖母。
富士博士是在關都地區創造超夢的博士。
南波博士、席拉奴博士、塞格博士是火箭隊的博士。
楊古博士研發了幻影寶可夢的幻影系統的博士。
冰柱博士是合眾地區的犯人「幾何雪男」的真實身份
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本期內容多數直接摘自寶可夢維基百科。