mega進化是一種特殊的進化方式，進化後的寶可夢會暫時釋放隱藏的力量，發揮強大的能力。其中能mega進化的水系寶可夢只有5隻，但實力都非常厲害，一起來看看吧！
水箭龜
水箭龜是一隻體型龐大的烏龜，它背上有一個厚重的龜殼，肩上扛著兩門水炮，不用的時候也可以把水炮收進龜殼裡。mega進化之後，水箭龜的每隻手臂上都長出了一個類似盾牌的小龜殼，小殼裡面也各有一門水炮，而背上則變成了一根長在中間的巨大炮臺。三門水炮一起攻擊，可以給敵人造成成噸的傷害！
在XY特別篇動畫中，卡洛斯地區四天王志糜就有一隻可以mega進化的水箭龜，它的這隻水箭龜曾經把艾嵐的mega噴火龍X按在地上打，也讓艾嵐知道了什麼叫天外有天！
呆殼獸
呆殼獸和呆呆獸長得很像，最明顯的區別就是尾巴上的大舌貝。呆殼獸mega進化之後，全部的能量都給了大舌貝，使其變得無比堅硬，保護著呆殼獸抵禦外界的攻擊。搞笑的是進化之後，呆殼獸是用它的尾巴站立行走的，樣子也非常滑稽，像是一隻快被大舌貝吃掉的呆呆獸。
巨沼怪
巨沼怪是豐緣地區水系御三家的最終進化型，它的體型非常龐大，力氣也非常驚人，甚至可以拖拽著大船遊動，戰鬥時只要大胳膊一揮就能打倒對手。mega進化之後，它變得更加強壯，渾身的肌肉好像要爆出來一樣。力氣也增強了許多，和它對戰的寶可夢一定要當心它的鐵拳！
巨牙鯊
巨牙鯊是一隻兇惡的鯊魚，但只有前半身，沒有尾巴，像一顆魚雷。它是兇狠狡猾的海中王者，嘴裡的鋼牙連鐵板都能咬碎。mega進化之後它頭上長滿了很多像牙齒一樣的尖刺，變得更加兇惡好鬥，搞得身上傷痕累累。因為它好鬥的本性和強大的實力，它成了許多反派喜歡使用的寶可夢。
暴鯉龍
暴鯉龍是由笨笨的鯉魚王進化而來的，它的外形像一條水龍，總是一臉兇惡的樣子，像是在恐嚇他人。它脾氣很暴躁且破壞力驚人，即使並沒有人惹它，也會平白無故的攻擊他人。mega進化之後，暴鯉龍變得更加帥氣，可以用超音速的在水面上滑行，橫衝直撞的非常危險！
動畫中小霞就有一隻可以mega進化的暴鯉龍，在《日月》中，在小智回到關東地區的時候，小霞用它和小智對戰。雖然mega暴鯉龍輸給了皮神，但表現也非常驚豔。