南安市工商業聯合會於1953年2月28日召開第一屆會員代表大會正式成立；1966年「文化大革命」開始後停止活動，1984年12月恢復組織活動。在南安市委、市政府的領導下，工商聯充分發揮橋梁和紐帶作用，在引導會員積極參與政治協商、民主監督、參政議政；加強會員思想政治工作，引導非公有制經濟健康發展；建立健全組織網絡，加強海內外聯絡工作；不斷完善和拓寬服務領域，積極開展商務活動；維護會員合法權益，不斷加強自身建設；引導會員投身光彩事業，積極奉獻社會等方面做了很多工作，受到各級和會員的充分肯定，多次被省委統戰部、省人事廳、省工商聯，泉州市委、市人民政府，南安市委、市人民政府表彰為先進單位。2013年被福建省工商聯評為「福建省縣級工商聯建設示範點」，2015年6月，被中華全國工商業聯合會評為「五好」縣級工商聯。
南安市工商聯（總商會）設：主席（會長）1人，黨組書記1人，常務副主席（常務副會長）1人，專職副主席（副會長）2人，兼職副主席（副會長）45人，常委102人，執委196人。至2016年4月，南安市工商業聯合會（總商會）共有會員企業2萬多家，下屬20個鎮級商會、9個同業公會、1個市場商會、5個市域內異地商會和62個異地南安商會，並且與全國工商聯及國內其它省市的工商聯有著密切聯繫，是南安市極具影響力的重要人民團體和商會組織，是中國內地商會網絡數量最多、覆蓋最廣的縣級市工商聯。
本會加強與海外的交流與合作，於2011年4月29日成立臺南市南安商會，這是大陸在臺灣成立的第一家異地商會組織。時任國臺辦主任王毅在第三屆海峽論壇籌備工作會議上，充分肯定了南安市對臺工作的新舉措。我會還與多個國家和地區的幾十家社團組織建立了經常性的友好聯繫，目前已在境外成立臺灣省臺南、澳門、泰國、加拿大多倫多、北美、新加坡、阿聯、澳大利亞等南安商會，今年5月擬新成立馬來西亞南安商會。
南安市工商聯（總商會）積極引導各基層商會充分發揮黨聯繫非公有制經濟人士的橋梁和紐帶，政府管理非公有制經濟的助手作用，推動聯絡和招商選資工作上新臺階。通過建立南安市工商聯（總商會）官方網站《成功網》和印發會刊《南安商訊》、《南安商訊微信公眾號》等形式，及時宣傳黨和政府關於鼓勵、支持和引導非公有制經濟發展的政策法規，報導各基層商會的重大活動和有關的商務信息，有力地加強了海內南安鄉親的聯絡工作。《南安商訊》現已發行86期共50多萬份。
南安市工商聯（總商會）堅持「致富思源」教育，積極引導異地商會發揚社會主義優良傳統，扶貧濟困獻愛心，熱心社會公益事業，成效顯著。據不完全統計，幾年來，南安市各異地商會捐資社會各項公益事業達4億多元，樹立了良好的社會形象，展現了新時期民營企業家樂施好善的風採，得到了社會各界的讚揚和好評。