這是兩所層次相當，重點學科各不相同的省屬重點大學，三峽大學的水利工程學科比較牛，南華大學的核工程和核技術相當強。先來看看兩所大學的
區域位置，三峽大學位於湖北省地級市宜昌市，南華大學位於湖南省地級市衡陽市，兩所大學都不在省會城市。宜昌位於湖北西南部，湖北省域副中心城市，綜合實力僅次於省會武漢。衡陽是湖南省域副中心城市，湘南地區經濟文化中心城市，重要的交通樞紐城市。
圖為南華大學夜景。
兩年大學
排位參考
：在校友會大學排行榜中，三峽大學位於全國第219位，南華大學位居全國第273，辦學層次均為區域高水平大學。
在軟科中國最好大學排行榜中，三峽大學位居全國第150位，南華大學位居全國第250位。
在中國大學錄取分數五年總排行（2013-2017）中，三峽大學的錄取總分排名全國第276位，南華大學排名全國第280位。就總的排行來看，三峽大學在三個排行榜上表現都領先一籌。
兩所大學
辦學規模
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三峽大學
是2000年由原武漢水利大學（宜昌）和原湖北三峽學院合併而成，水利部和湖北省共建大學，卓越計劃高校，湖北省國內一流大學建設高校。學校有30個學院，72個本科專業，國家級特色專業5個，有全日制在校本科生22293人，博士碩士研究生4266人，留學生1365人。專任教師2040餘人，博士學位813人。學校有4個一級學科博士點，25個一級學科碩士點，1個博士後流動站。
圖為三峽大學圖書館。
南華大學
是工信部，國防科工局，中核工業集團和中核建設集團與湖南省共建高校，湖南省屬重點大學，卓越計劃高校，2000年由原中南工學院，衡陽醫學院合併組建南華大學。學校有全日制本科生30000人，研究生4000人，專任教師1420人，開設23個直屬學院，本科專業77個，有一級學科博士學位授權點5個，一級學科碩士學位授權點24個，博士後流動站3個。
圖為南華大學校園風光。
兩所大學優勢學科：
三峽大學的優勢學科是水利水電工程和土木工程類學科。其中水利水電工程，電氣工程及其自動化，工商管理，醫學影像學是國家級特色專業，水利工程和土木工程是湖北省重點優勢學科。
南華大學的優勢學科是核科學與技術，醫學實力也很強。其中核工程與核技術，臨床醫學，工商管理，預防醫學，礦物資源工程，給排水工程是國家第一類特色專業，核工程與核技術是國防重點專業。
總體說來，從綜合排位上看，三峽大學略為領先，但總體上來說兩所大學是同一檔次大學，關鍵在於專業的選擇。回答至此，圖片源自官網百科，謝謝。