據說由於經濟窘迫的原因，有人建議法國賣掉《蒙拉麗莎》這幅名畫，要價500億歐元，對於達文西的這幅名畫來講，這不算貴，不過普通人估計要1000年左右才能掙到這筆錢，但無論多高的價格總有人想買，當然這只是開個玩笑，就算有人想買羅浮宮也不會賣，因為《蒙娜麗莎》是羅浮宮的鎮館之寶，是人類的瑰寶。
蒙拉麗莎被放在一個防彈玻璃盒裡面，玻璃的厚度有25釐米厚，可見羅浮宮對這幅名畫的重視程度，這幅名畫出自達文西之手，其中藏有25個未解之謎，最著名的是她的微笑之謎，這幅畫無論從哪個角度觀賞，畫中那位女人的視線總是正對著你的眼睛，看著你微笑，為什麼她會笑？幾百年來無數人試圖解釋這位貴婦為何而笑，1993年，加拿大美術史學家蘇珊吉魯提出了蒙娜麗莎微笑的嘴唇，是一個男子脊背線條形狀的結論，認為這反映出了畫家對壯美力量的呼喚。
2005年，荷蘭專家用情感識別軟體對蒙娜麗莎的表情進行了分析，得出畫中人表情成分的比例：高興佔83%，厭惡佔9%，恐懼佔6%，憤怒佔2%，蒙娜麗莎的表情可真夠豐富的。人們對這幅畫的研究一直在繼續，比如還有研究認為她有孕在身，因感悟生命的神秘而微笑，甚至有人認為她沒有門牙，所以笑不露齒。
第二個神秘之處：她的身世之謎，這幅畫問世至今，人們對蒙娜麗莎的真實身份一直存在爭議，一些歷史學家認為蒙娜麗莎是達文西的自畫像，達文西的感情生活不為人知，所以他把自己畫成了女人的形象，而美國作家丹布朗他所寫的《達文西密碼》一書中說道，蒙娜麗莎這個名字可能就是字謎，暗指一位埃及神明，最靠譜的說法是認為蒙娜麗莎是佛羅倫斯一名富商的妻子，但這個平淡的觀點並沒有引起人們太多的興趣。
一直到2005年德國海德堡大學的手稿研究專家施萊希特博士，在圖書館裡找到了一本1503年的書，這本書的主人是達文西的好朋友，他在書的一個空白頁裡寫道：達文西正在創作三幅畫，其中一幅是一位富商妻子的畫像，名字叫「麗莎」，但是令人不解的是：這是顧客請他畫的肖像畫，完成後應當交付給顧客，但達文西卻將這幅畫一直隨身攜帶。
專家用x光照射這幅畫，發現蒙娜麗莎嘴部的顏料多達40層，每一層都很薄，只有幾微米厚，專家認為這不是用筆所畫，而是作者把顏料塗在手上然後畫在上面，每一層顏料需要幾個月的時間才能風乾，當時達文西可能對畫作不滿意，一直在更改，花費了很多時間，所以有人推測：其實蒙娜麗莎是一幅還沒有完成的畫作。
第三就是符號之謎，義大利人使用顯微鏡對其放大30倍，觀察油畫當中蒙娜麗莎的眼睛，發現畫中含有細微的字符，右眼球上有字母LV，這是達文西的名字的首字母，左眼有S的字樣，畫中還隱藏著7和2兩個數字，這是達文西特別鍾愛的數字，似乎達文西在用符號和數字向後人傳遞著某些信息，它們被稱為達文西預言，達文西寫過一冊手稿《大西洋古抄本》，最後一頁少了一張圖，後來這張圖被找到，學者認為它有可能是解開那些預言的一把鑰匙。
還有一個未解之謎就是它的真偽，1911年8月21日，蒙娜麗莎被盜，使這幅畫家喻戶曉，法國人一度認為蒙娜麗莎再也不會回到法國了，時隔兩年後，1913年它出現在義大利，警方立馬將這個名叫佩魯賈的偷盜者抓獲，佩魯賈在法庭上說達文西是義大利人，自己把屬於義大利的東西拿回來，最後法官將佩魯賈當庭釋放，在蒙娜麗莎被盜的兩年裡，市面上出現了很多幅蒙拉麗莎，收藏家們都聲稱自己收藏的是蒙娜麗莎的真品，就連頂級的鑑定師也無法分辨真偽，有人甚至懷疑羅浮宮的蒙娜麗莎是被替換的仿造品。