廣東擁有眾多醫學院校，有些綜合性大學也開設了醫學院。廣東省獨立建制的醫科院校中，不乏辦學水平位居同類院校前列的高校，例如南方醫科大學和廣州醫科大學。
南方醫科大學創建於1951年，是廣東省高水平大學重點建設高校中唯一的醫學院校，是廣東省獨立建制的醫科院校中綜合實力最強、學科實力最深厚的高校。辦學主體位於廣州，在佛山也有開設校區。
南方醫科大學有5個國家重點及培育學科，12個首批國家一流本科專業建設點，8個國家特色專業，10個廣東省特色專業，6個廣東省名牌專業。有8個博士後流動站，10個博士學位授權一級學科。南方醫科大學現有7個學科進入ESI排名全球前1%，ESI綜合排名位居全國高校58名。
全國第四輪學科評估，南方醫科大學有基礎醫學、公共衛生與預防醫學、中西醫結合等3個一級學科評估為B+，生物醫學工程、臨床醫學、藥學、護理學等4個一級學科評估為B，中藥學、口腔醫學等2個一級學科評估為C-。
南方醫科大學師資力量雄厚，有院士3人、雙聘院士4人，長江學者11人，國家自然科學基金傑出青年基金獲得者15人，國家自然科學基金優秀青年基金獲得者9人等眾多高水平人才。擁有眾多國家、省部級科研平臺，含1個國家重點實驗室、1個國家臨床醫學研究中心、1個國家國際科技合作基地等。
南方醫科大學近年表現優秀，2019年國家自然基金立項數排名位居全國獨立醫科院校第2位，連續4年躋身全國高校30強。摘得多項省部級獎項，其中以第一完成單位獲2019年度國家自然科學二等獎。碩果纍纍的南方醫科大學有希望入選下一輪世界一流學科建設高校。
廣州醫科大學創辦於1958年，是廣州市屬重點高校，是廣東省高水平大學重點學科建設高校、廣州市高水平大學建設高校。坐落於廣東省省會廣州市，有番禺、越秀兩個校區，校園佔地面積37.23萬平方米。
廣州醫科大學擁有1個國家重點學科，7個省部級重點學科；有9個國家臨床重點專科，43個省（部）級重點專科。擁有1個博士後流動站，2個一級學科博士授權點，8個一級學科碩士授權點，5個碩士專業學位授權。現有5個學科進入ESI排名全球前1%，ESI綜合排名位居全國高校96名。
全國第四輪學科評估，廣州醫科大學有臨床醫學等1個一級學科評估為B-，基礎醫學、藥學、護理學等3個一級學科評估為C；公共衛生與預防醫學等1個一級學科評估為C-。
廣州醫科大學擁有1個國家醫學中心，1個國家重點實驗室，1個國家臨床醫學研究中心，1個國家大學科技園培育基地，11個省部級重點實驗室等眾多省部級科研創新平臺。近年來廣州醫科大學發展迅速，在國家級科研項目立項上屢創佳績，其中國家自然科學基金立項數連續六年位居全國百強。
南方醫科大學和廣州醫科大學都是廣東省獨立建制的醫科院校中綜合實力較強的高校，具有一定的知名度和影響力，都是值得報考的高校。