嚴重腳臭患者要使用專業除臭類藥物和衛生用品，利用抗菌藥物（如濃度 70% 以上酒精），抑制腳上細菌繁殖，從而達到除臭的目的。臨床上，針對黴菌感染患者，會給予抗黴菌藥膏，需持續使用半年或一年，或是服用口服藥物 3 個月等。
如果是細菌性感染，就得使用抗生素藥物或藥膏。如果是慢性疾病引起的腳臭，就得先將原有疾病控制好，才能避免腳臭發生。
另外，祛除腳臭，首先要保持腳乾爽，在日常生活中要注意以下事項：
1. 平時洗完澡後，腳一定要擦乾，可用吹風機或幹毛巾輔助。
2. 穿鞋時一定要穿襪子，因為鞋子無法吸收太多汗液，出汗量大者，還要每天在出門前再備一雙襪子，以便替換著穿。
3. 穿涼鞋有助於透氣，但要慎選材質。
4. 出門前，不妨塗抹含鋁成分的足部止汗劑，或噴灑除臭爽身粉，可以減少腳汗發生。
中醫認為，腳臭與脾虛相關，脾虛的人會手腳多汗、體味重，屬於溼熱體質。另外，脾虛也跟個人飲食習慣相關，如喜歡進食生冷或冰的食物，或是油炸、辛辣、高糖等食物。所以，腳臭問題在中醫上，多用滋陰補氣的食物進行食療，以助斂汗除臭。如有脾虛問題者，可以多吃蓮子、蓮藕等食物以降心火，或是視個人體質吃些黃芪、西洋參、高麗參等補氣。通常只要經過適當治療，再配以飲食習慣的改變，效果會極為顯著。
附：除腳臭中藥 4 小方
麻黃根 30 克，丁香、木香、黃柏各 15 克，水煎，每日用以洗腳 3~4 次。一般連用數日即效。
白礬、葛根各 15 克，研末後水煎，每日洗腳並浸泡。一般連用 10 餘日可愈。
明礬 30 克，乾薑 6 片，水煎，用汁泡腳，每日 2 次，每次浸泡 30 分鐘，3~5 天可見效。
防風、白芷各 60 克，川芎、細辛、蒼朮、白礬各 30 克。共研細末裝瓶，用時將藥粉撒入鞋內，隔日用藥 1 次。或取藥末 20 克，放入腳盆內，用沸水衝泡，待溫度適宜時洗腳浸泡 15 分鐘。一般連用 1 周后可有明顯療效。
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