MySQL實例管理器支持許多命令行選項。執行./mysqlmanager --help命令可以簡單列出。有下面的選項：
顯示幫助消息並退出。
綁定地址用於連接。
| ·--default-mysqld-path=name |
在Unix中，如果實例部分沒有路徑，則為尋找MySQL伺服器二進位的地點。例如：default-mysqld-path = /usr/sbin/mysqld
| ·--defaults-file=file_name |
從給定文件讀Instance Manager和MySQL伺服器設定值。所有Instance Manager更改的配置將加入該文件。只能用於Instance Manager的第一選項。
在Windows中，將Instance Manager安裝為Windows服務。
IM日誌文件的路徑。結合--run-as-service選項使用。
| ·--monitoring-interval=Seconds |
監視實例的間隔，單位為秒。Instance Manager將嘗試連接每個監視的實例來檢查它們是否是活動的/沒有掛起。出現故障，IM將重啟幾次(實際上是多次)實例。可以用nonguarded選項為特定實例禁用該行為。如果未給定任何值， 默認使用20秒。
編寫passwd文件並退出。
從該文件中尋找Instance Manager用戶和密碼。默認文件是/etc/mysqlmanager.passwd。
使用的進程ID文件。默認情況下，該文件文件名為mysqlmanager.pid。
用於連接的埠號。(IANA分配的 默認埠號為2273)。
列印當前的默認值並退出。只能用作Instance Manager的第一選項。
在Windows中，刪掉Instance Manager Windows服務。假定前面已經用--install運行了Instance Manager。
使完善進程變為後臺程序並啟動。完善進程很簡單，不易崩潰。出現故障後它將自己重啟IM。
Unix中用於連接的套接字文件。默認情況下，文件名為/tmp/MySQLmanager.sock。
在Windows中以單機模式運行Instance Manager。
啟動並運行mysqlmanager的用戶名。建議使用運行mysqld伺服器的用戶帳戶來運行mysqlmanager。
輸出版本信息並退出。