微生物肥料是以微生物的生命活動導致作物得到特定肥料效應的一種製品，是農業生產中使用肥料的一種。其在中國已有近50年的歷史，從根瘤菌劑——細菌肥料——微生物肥料，從名稱上的演變已說明中國微生物肥料逐步發展的過程
微生物肥料是活體肥料，它的作用主要靠它含有的大量有益微生物的生命活動代謝來完成。只有當這些有益微生物處於旺盛的繁殖和新陳代謝的情況下，物質轉化和有益代謝產物才能不斷形成。因此，微生物肥料中有益微生物的種類、生命活動是否旺盛是其有效性的基礎，而不像其它肥料是以氮、磷、鉀等主要元素的形式和多少為基礎。正因為微生物肥料是活製劑，所以其肥效與活菌數量、強度及周圍環境條件密切相關，包括溫度、水分、酸鹼度、營養條件及原生活在土壤中土著微生物排斥作用都有一定影響，因此在應用時要加以注意。
提高化肥利用率的作用：
隨著化肥的大量使用，其利用率不斷降低已是眾所周知的事實。這說明，僅靠大量增施化肥來提高作物產量是有限的，更何況還有汙染環境等一系列的問題。為此各國科學家一直在努力探索提高化肥利用率達到平衡施肥、合理施肥以克服其弊端的途徑。微生物肥料在解決這方面問題上有獨到的作用。所以，根據中國作物種類和土壤條件，採用微生物肥料與化肥配合施用，既能保證增產，又減少了化肥使用量，降低成本，同時還能改善土壤及作物品質，減少汙染。
在綠色食品生產中的作用
隨著人民生活水平的不斷提高，尤其是人們對生活質量提高的要求，全球都在積極發展綠色農業(生態有機農業)來生產安全、無公害的綠色食品。生產綠色食品過程中要求不用或儘量少用(或限量使用)化學肥料、化學農藥和其它化學物質。它要求肥料必須首先保護和促進施用對象生長和提高品質；其次不造成施用對象產生和積累有害物質；三是對生態環境無不良影響。微生物肥料基本符合以上三原則。近年來，中國已用具有特殊功能的菌種製成多種微生物肥料，不但能緩和或減少農產品汙染，而且能夠改善農產品的品質。
微生物肥料在環保中的作用
利用微生物的特定功能分解發酵城市生活垃圾及農牧業廢棄物而製成微生物肥料是一條經濟可行的有效途徑。目前已應用的主要是兩種方法，一是將大量的城市生活垃圾作為原料經處理由工廠直接加工成微生物有機複合肥料；二是工廠生產特製微生物肥料(菌種劑)供應於堆肥廠(場)，再對各種農牧業物料進行堆制，以加快其發酵過程，縮短堆肥的周期，同時還提高堆肥質量及成熟度。另外還有將微生物肥料作為土壤淨化劑使用。
改良土壤作用
微生物肥料中有益微生物能產生糖類物質，佔土壤有機質的0.1%，與植物粘液，礦物胚體和有機膠體結合在一起，可以改善土壤團粒結構，增強土壤的物理性能和減少土壤顆粒的損失，在一定的條件下，還能參與腐殖質形成。所以施用微生物肥料能改善土壤物理性狀，有利於提高土壤肥力。
作物的生長需要營養，氮、磷、鉀是作物生長的三大營養元素，其中氮是作物生長的關鍵營養元素。然而，空氣中含有80％氮氣，卻因為作物不能吸收而無法利用。化肥中含有這些元素，能夠給作物提供營養，化肥的施用能使作物大量增產。但是長期施用化肥帶來很大的副作用，近50年來，世界化肥用量增加了60倍，過量施用化肥不僅破壞了土壤結構，降低了作物品質，汙染了環境，還使土壤和農作物中積累了大量硝酸鹽，進入人體後變成亞硝酸鹽，使血液喪失輸氧功能、導致癌症。
科學家通過研究發現，微生物具有把氮氣固定住的神奇功能，能把空氣中的自由態氮轉化成作物可吸收利用的有效態氮。科學家還發現，微生物中的磷、鉀細菌能分解土壤中固定的磷、鉀元素，並把它們釋放出來，供作物利用。那些繁殖飛快的有效菌還能刺激作物的生長，起到防病作用。於是，科學家選育出能夠人工培養的有益微生物，通過工業發酵生產出微生物活體製品,可以直接用於農業生產。微生物肥料就是以微生物生命活動導致農作物得到特定的肥料效應，達到促進作物生長或產量增加或質量提高的一類製品。
其實，微生物肥並不是什麼新鮮事物，微生物在農業和環境中的應用已經有很長的歷史，利用微生物為農業生產服務一直是尖端科技，在過去的幾十年裡一直處於研究試驗階段。近年來，由於生物技術、發酵技術有了突破性發展，使微生物肥實現了工業化生產，從而在農業生產中得到廣泛應用。
微生物肥，是怎樣影響作物生長的呢？種子在土壤中生根發芽後，施入土壤的活體有益微生物就在作物根的周圍大量繁殖，形成了一個旺盛的微生物活動區，這些活動微生物不僅改變了土壤性狀也促進了作物的生長發育進程。 1、改善土壤結構，提高土壤肥力。微生物肥中的一些根瘤菌、固氮菌，可以把空氣中的氮氣轉化成植物可吸收的氮素養分，增加土壤中的氮素來源，多種溶磷、解鉀菌可以將土壤中難溶的磷、鉀分解出來，轉變為作物能夠吸收利用的速效磷、鉀化合物，使作物生長環境中的營養元素供應增加。一些微生物肥料的應用還增加了土壤中的有機質，促進土壤團粒結構的生成，提高土壤肥力。長期使用微生物肥，可使原來比較板結的土質變得更加鬆軟、透氣，而且保水、保肥性能也有了提高。 2、減少病蟲害，增強作物的抗病能力。微生物肥料中的有益微生物在作物根系周圍大量生長繁殖，形成優勢菌群，佔據病原微生物的生存空間，阻擋了病原微生物對作物的侵害。其次，微生物所分泌的殺蟲抗菌類物質，具有一定的殺蟲抗菌作用。這些物質在根部能夠增強了作物的抗病能力，使作物避免土傳性病原菌的侵害，降低發病率。 3、促進生長，增加產量。使用微生物肥料後，微生物產生的如赤黴素、生長素和其他生理活性物質，促進了作物的生長發育，特別是根系發育，發達的根系提高了作物養分吸收能力，使作物的生長發育速度加快。尤其是一些光合細菌製劑，噴灑在作物葉面後，作物枝葉茂盛，葉面積增大，使作物的光合作用顯著增強，作物生長加速，開花早、結果多、產量高。 4、改善產品品質。由於微生物的活動，均衡了土壤中養分的供應，防止了作物對N素肥料的過量吸收，蛋白質、糖分、維生素含量提高，硝酸鹽含量下降，作物品質明顯改善，口味好、保鮮時間延長。據實驗測定，施用微生物肥可使產品中硝酸鹽含量降低20-30％，維生素C含量提高30-40％，可溶性糖提高1-4度。可以有效地改善蔬菜和果品的外觀，提高胺基酸含量、降低重金屬等有害物質含量。 5、減少汙染，改善生態環境。微生物肥有較好的肥效，能夠增強作物的抗病能力，使用微生物肥能夠減少30%的化肥用量，同時減少農藥用量，從而減少環境汙染，降低農藥殘留，促進我國農業可持續發展。微生物肥是一種微生物活體的製品，肥料中含有微生物活體，肥料施入土壤後通過微生物的生命活動，增加植物養分的供應量、促進植物生長。微生物肥分為微生物菌劑、生物有機肥和複合微生物肥三類。微生物菌劑是一種或一種以上的目的微生物經工業化生產增殖後直接使用，或經濃縮或經載體吸附而製成的活菌製品。微生物菌劑分單一菌劑和複合菌劑，單一菌劑是由一種微生物菌種製成的，按產品中特定的微生物種類或作用機理又可分為若干個種類，如根瘤菌菌劑，固氮菌菌劑，解磷類微生物菌劑，矽酸鹽微生物菌劑，光合細菌菌劑，有機物料腐熟劑，促生菌劑，菌根菌劑，土壤生物修復劑等。複合菌劑是由兩種或兩種以上且互不拮抗的微生物菌種製成的。菌劑從外部形態上分為固體和液體，固體菌劑是粉末狀的，為了保存和運輸方便，生產中以生產固體菌劑為主。微生物菌劑主要靠微生物的生命活動來為植物增加營養、改良土壤，用量少，使用範圍廣，使用方法靈活多樣，使用過程中安全環保。 生物有機肥是特定功能微生物與腐熟的有機肥複合而成的一類兼具微生物肥料和有機肥效應的肥料。生物有機肥在外型上是顆粒狀的。生物有機肥有一定的肥效，能夠有效改善農作物品質，用量較大，是一種環保肥料，適合在有機農業生產中使用。 複合微生物肥料是指特定微生物與營養物質和有機質複合而成的肥料，既有微生物的作用，又有化肥的作用。複合微生物肥肥力較高、肥效快，用量大，能夠促進作物增產，使用方法簡便。 微生物菌劑用量少，主要起調節作用。微生物菌劑的使用原則是「早、近、勻」，即：使用時間早、離作物根系近、施用均勻。 1、噴施，液體微生物菌劑含有固氮菌、光合細菌等微生物，可以用作葉面噴施，給植物增加營養，促進光合作用。將液體菌劑與水混合，比例為1：10，使用噴霧器給作物噴施，通常在作物生長前期使用。由於陽光中紫外線有殺菌作用，所以施用時一般要避開中午前後的時間。選在陽光不太強的早晨或傍晚噴施，每畝作物用10-20千克菌劑。 下面介紹固體菌劑的用法：固體菌劑有單一菌劑和複合菌劑，單一菌劑只含有一種微生物菌種，只能針對使用，例如土壤缺氮，可以用固氮菌菌劑；土壤缺磷可以用解磷類微生物菌劑。複合菌劑含有兩種以上的微生物菌種，作用比單一菌劑全面，能夠促進作物生長，改良土壤，還能起到一定的防病作用，對各種作物都適用。使用菌劑時根據土壤肥力的不同可以選擇不同類型的菌劑，使用方都是一樣的： 2、拌種，把適量菌劑倒入盆中，再倒入清水，菌劑與清水按1：1的比例混合，然後放入糧食作物種子，攪拌均勻，菌劑均勻地附著在種子表面，放置在陰涼地陰乾後播種，這樣能促進種子生長，減少病蟲害，這種方法適合各種糧食種子。3、浸種，把適量菌劑倒入盆中，再倒入清水，菌劑與水按1：2的比例混合，攪勻後把種子放入菌液中，攪拌，浸泡8--12小時，撈出陰乾後播種。這樣能提高種子發芽率，增強抗病能力。 4、蘸根，以紅薯苗為例，將適量菌劑倒入盆中，再倒入清水，菌劑與水按1：2的比例混合，和成漿糊狀，將紅薯根放入菌劑中浸泡10分鐘左右，在栽植穴中澆水，再把醮根後的紅薯苗植入穴內，覆土。這種方法適用於有根的作物，在移栽時使用比較好，能夠促進作物早生根、多生根，根系發達。 5、拌肥，微生物菌劑可以和農家有機肥混合，作基肥或追肥使用。先將腐熟過的有機肥堆在地裡，將適量菌劑倒在有機肥上，微生物菌劑與有機肥的比例為1：10，將菌劑與有機肥拌勻。每畝可用菌劑10-20千克。要注意的是有機肥必須充分腐熟後才能使用，否則會殺死菌劑中的微生物。將拌勻的肥料均勻撒在地裡，然後翻耕入土作基肥，這樣能提高土壤肥力。 6、拌土，微生物菌劑可以拌土使用，菌劑與土的比例為1：2。將適量菌劑倒入盆中，將篩過的細土按照兩倍的量與菌劑混合，攪拌均勻，製作成營養土，可以撒施作基肥，也可以溝施作種肥。溝施時在整好的地裡開溝，把營養土施入溝內，然後澆水，覆土，然後點種或下苗，這樣能培肥地力，促進種子或苗木生長。每畝可用菌劑10-20千克。 7、有機物料腐熟劑，有機物料腐熟劑是一種能夠加速各種有機物料分解、腐熟的微生物活體製劑，可以用來製作堆肥。製作堆肥時，在田邊地角選擇一個合適的位置，把農作物秸稈、畜禽糞便混合堆積起來，長寬分別為1-2米，堆一層物料，灑一層腐熟劑，堆積高度為1-1.5米，腐熟劑的用量為物料的千分之一，通常發酵一噸有機肥只需用1千克腐熟劑。堆好後倒水，水分控制在50%-60%。冬天，用塑料薄膜封堆保溫，當溫度升高到40℃左右時，進行一次翻堆，自然堆積發酵30-40天，即可使用。這種發酵腐熟後的肥料含作物所需的各種微量元素，同時含有固氮、解磷、解鉀功能菌，能夠防止土壤板結、培肥地力。
要通過正規渠道購買聲譽好的、正規廠家的產品。正規產品包裝上應有：農業部的微生物肥料登記證號、產品執行的標準、生產日期、保質期，購買時要注意核實。為了避免上當受騙，應選擇那些在當地試驗示範後，證明確實有效且質量穩定的肥料品種。
微生物肥一定不要與農藥殺菌劑同時施用。因為微生物肥中含有微生物活體，如果與農藥殺菌劑同時使用會殺死微生物從而降低肥效。運輸和存放時應避免和殺菌劑類農藥混放，否則會殺死有益微生物而使生物肥降低作用。
由於作物生長的機理不同，土壤、環境、氣候的差異，微生物肥的施用效果也不一樣。通常情況下，在有機質豐富、地力肥沃的土地上施用效果要比貧瘠的土地上效果好。近根施用比撒施效果好。在作物生長過程中早施比晚施效果好。溫暖季節施用效果要比嚴寒低溫季節施用效果好。
微生物肥並不能完全代替化肥，但施用微生物肥後可以減少30%的化肥用量，從而減少化肥汙染，提高作物品質。
隨著人們生活水平的提高和對健康的日益關注，人們對食品安全也提出了更高的要求。安全食品必須以安全的生產資料為基礎，生物肥料是綠色農業種植的基礎。目前，環境問題是世界性問題，人們連年施用化肥，導致農作物品質降低，瓜不甜、果不香，大量施用化肥導致了土壤板結、水體汙染、湖泊富營養化等環境問題。傳統化學肥料造成的生態危機已經使人們深刻認識到必須開發新的環保型肥料，發展生物農業、生態農業已經刻不容緩。國家《生物產業發展「十四五」規劃》指出：生物產業將成為繼信息產業之後世界經濟中又一個新的主導產業。從保護環境、節約能源、降低成本的角度來看，微生物肥料的應用前景十分廣闊。【往期回顧】
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