《柳葉刀》預印本論文:新冠可能最早在印度次大陸傳播

2020-12-13 觀察者網

【文/觀察者網 陳思佳】11月17日,權威醫學期刊《柳葉刀》在科學文獻預印本存儲平臺SSRN上發布了一篇預印本論文。這篇論文題為「新冠病毒在人類宿主中的早期隱秘傳播及進化」,其研究團隊認為,新冠病毒最早可能在印度次大陸發生人際間傳播。

根據這篇論文的信息,三名作者分別是來自中國科學院神經科學研究所的Libing Shen、復旦大學生命科學學院的Funan He及美國德克薩斯大學休斯敦生物科學與分子生物學院的Zhao Zhang。

SSRN網站截圖

SSRN上這篇論文目前是預印本,這代表論文已提交給《柳葉刀》,但還沒接受大多數全面的評議,尚未正式刊登。不過《南華早報》稱,這項研究的部分內容已得到了同行評審,並發表在了《分子系統發育與進化》期刊上。

這篇論文在科學界引起了一些爭議,有印度科學家態度堅決地否定這一結論。論文的作者表示,他們團隊歡迎學術討論,只有經過嚴謹的討論才有可能實現驗證或證偽。

《南華早報》報導截圖

新冠可能最早在印度次大陸傳播?

根據論文內容及摘要介紹,研究團隊在新冠病毒基因組序列中搜索了突變最少的毒株,根據奧卡姆剃刀原則,突變最少的毒株應該是所有毒株系統樹的根。他們根據這一類毒株研究了新冠病毒在人類宿主中的適應性進化過程,並分析了其在不同國家及地區的多樣性。

摘要稱,他們將2019年12月至2020年7月期間從人類宿主身上收集的4571個基因組序列分為2449個毒株。對其進行研究後發現,最早在武漢發現的毒株序列NC_045512並非變異最少的毒株,不是所有毒株的祖先序列,有41個毒株的全局變異更少。研究小組認為,這一結果表明武漢不是新冠病毒最早發生人際間傳播的地點。

研究團隊指出,基於新冠病毒較低的突變性,他們在澳大利亞、孟加拉國、希臘、美國、俄羅斯、義大利、印度和捷克這8個國家發現了變異最少的毒株。由於病毒不可能同時從所有這些地方傳播給人類,他們認為第一次暴發地區的毒株應該有最大的遺傳多樣性,這表明其存在時間更長。

該團隊在統計分析了17個國家及地區的病毒序列及毒株後發現,印度和孟加拉國的毒株多樣性最高。論文指出,印度次大陸可能是最早發生人際間傳播的地區。結合新冠病毒的突變率,研究小組認為最早的新冠病毒人際間傳播可能要追溯到2019年7月或8月。

論文截圖

論文指出,2019年5月至6月,印度中北部和巴基斯坦出現了有記錄以來持續時間第二長的熱浪,在該地區造成水資源匱乏,使得野生動物為爭奪水源而殘殺,增加了人類與野生動物的接觸機會。研究團隊認為,病毒有可能是借著這個機會傳播到世界各地,直到2019年12月在武漢被發現。

三名作者表示,他們希望自己的工作能為新冠病毒研究、防控提供一些線索和新思路,病毒的真正起源依然是個未解之謎,需要不斷通過研究去揭示。

全文目前還只是預印本,發表在權威醫學期刊《柳葉刀》在SSRN的預印本平臺上,這意味著這篇論文尚未得到全面評議,沒有正式在《柳葉刀》上刊登。不過《南華早報》稱,這篇論文的部分內容已經得到了同行的評議,並發表在《分子系統發育與進化》期刊上。

印度科學家矢口否認

這篇論文發表後,很快在科學界中引起了一些爭論。

加州大學洛杉磯分校生物統計學和人類遺傳學教授馬克·蘇查德(Marc Suchard)對研究的嚴謹性提出了一些質疑。他認為,研究的原則和具體方法不太符合其使用的系統發生分析標準,不太可能從任意選取的病毒序列中找出真正的祖先序列。

蘇查德表示,三名研究者所採用的系統發生學研究方法確實很有希望幫助人們了解病毒的出現與傳播,但這其中同樣存在較大的不確定性。

格拉斯哥大學教授大衛·羅伯遜(David Robertson)宣稱,研究理論「有很大缺陷」,「對研究新冠病毒沒有幫助」,不過他沒有說明到底有什麼樣的缺陷。

一名印度科學家則堅決否認研究的結果。據《南華早報》報導,印度病毒學家穆克什·塔庫爾(Mukesh Thakur)表示自己不認同論文的結論,稱這看起來「是對結果的誤讀」。但塔庫爾並未作出進一步說明。

這篇論文的作者在接受《南華早報》採訪時表示,他們團隊歡迎科學界審查他們的論文,這是公開學術探討的重點,有助於確立科學結論。他說:「只有這樣,論文的結論才能被正當地駁斥或接受。」

中國首先報告新冠,不代表中國就是源頭

新冠病毒的源頭及其最早的傳播時間現在依然是個謎,但越來越多的研究發現,新冠病毒可能早在武漢出現疫情前就已在全球部分地區傳播。

7月,巴西聖卡塔琳娜聯邦大學專家組宣布,在對巴西聖卡塔琳娜州首府弗洛裡亞諾波利斯市的下水道水樣分析中發現,2019年11月的下水道樣本中存在新冠病毒,比今年1月21日美國報告的美洲大陸首例確診要早了兩個月。

《洛杉磯時報》9月曾報導,加州大學洛杉磯分校醫院和診所的研究顯示,2019年12月新冠病毒就在距武漢千裡之外的洛杉磯出現。研究人員推測,美國首例新冠肺炎出現的時間可能比美國官方確認的要更早。

「在中國報告疫情前洛杉磯可能就已出現新冠病例」,《洛杉磯時報》9月報導截圖

11月16日,義大利米蘭國家癌症研究所(INT)在醫學期刊《腫瘤雜誌》上發表研究報告稱,他們在分析了959名志願者留下的血液樣本後發現,111人在今年2月前就有了新冠病毒抗體,其中有四份樣本是去年10月第一周採集的。這意味著新冠病毒去年9月可能就在義大利傳播,這有可能「重塑疫情的歷史」。

世衛組織衛生緊急項目負責人麥可·瑞安23日也指出,新冠病毒有可能在很早時候,就在世界不同的地點和時間感染了一批人。他表示,新冠病毒可能有不止一個首例病例,因為該疾病很可能源於好幾種動物的傳播。

這一系列科學發現,都狠狠地打了部分炒作所謂「中國病毒起源」論調的西方政客的臉。中國外交部也已多次強調,中國是首先報告新冠肺炎疫情的國家,但並不意味著中國就是新冠病毒的源頭

本文系觀察者網獨家稿件,未經授權,不得轉載。

相關焦點

  • 《柳葉刀》新論文:新冠可能最早在印度次大陸傳播
    2020.11.30 08:11【《柳葉刀》新論文:新冠可能最早在印度次大陸傳播】國際權威醫學雜誌《柳葉刀》的預印本平臺ssrn.com近日發表一篇論文,指出印度次大陸可能是新冠病毒最早發生人與人之間傳播的地點。
  • 《柳葉刀》刊發新論文,新冠最早或在印度次大陸,印度:無法接受
    當地時間11月17日,權威醫學期刊《柳葉刀》在科學文獻預印本存儲平臺SSRN上,刊發了一篇題為"新冠病毒在人類宿主中的早期隱秘傳播及進化"的預印本論文。署名的三位科學家認為,新冠病毒最早可能在印度次大陸率先傳播。目前論文的部分內容,已經得到了同行的評審。但是尚未接受大多數同行的全面評議,也沒有正式刊登。
  • 新論文:新冠可能最早在印度次大陸傳播
    【環球時報記者 於文】國際權威醫學雜誌《柳葉刀》的預印本平臺ssrn.com近日發表一篇論文,指出印度次大陸可能是新冠病毒最早發生人與人之間傳播的地點。香港《南華早報》稱,這項研究的一部分經過了同行評審,並發表在《分子系統發育與進化》雜誌上。
  • 柳葉刀論文:新冠病毒最早傳播的地點可能在印度、次大陸
    美國國家過敏症和傳染病研究所所長安東尼·福奇11月29日說,美國疫情形勢不可能「突然」變好,單日新增確診病例數可能呈現「一波又一波」上升趨勢。印度新增確診病例超3.8萬例,新冠可能最早在印度次大陸傳播據印度衛生部30日公布的最新數據,印度新冠肺炎確診病例升至9431691例。
  • 因低劣新冠論文泛濫,最大預印本網站開始拒稿新冠論文
    截至 5 月 11 日,作為主要的新冠研究預發布平臺,medRxiv 和 bioRxiv 收錄相關預印本論文 3174 篇,其中有 2546 篇收錄在 medRxiv,628 篇收錄在 bioRxiv。
  • 中美團隊提出新冠溯源新方法!病毒源頭在印度次大陸
    利用收集到的全球4571條SARS-CoV-2序列,重新劃定出病毒分類子集並指出:印度次大陸最有可能是新冠病毒最早發生人與人之間傳播的地點,且最早的病毒時間可以追溯到2019年的7月-8月。 對不同國家/地區SARS-CoV-2毒株多樣性的統計分析表明,印度次大陸(Indian subcontinent)的毒株多樣性最高。此外,根據SARS-CoV-2的突變率,研究人員推算最早的SARS-CoV-2在人類宿主中的傳播可以追溯到2019年7月或8月。
  • 印度才是真正的罪魁禍首?索賠大軍沒話說了
    作者:書南/編輯:弘文 全文816字,閱讀約需2分鐘 新冠疫情仍舊在全世界傳播,秋冬季的到來使得疫情的蔓延進一步加劇,不少地區都迎來了第二波疫情高峰,並且第二波比第一波更加兇猛。
  • 新冠論文爆發,眼花繚亂背後,隱藏著一些有趣結論
    1.數據來源論文發表日期:2019 年 12 月 1 日到 2020 年 5 月 17 日。論文發表來源:Nature 及其子刊、Science 及其子刊、The Lancet 及其子刊、生命科學預印本平臺 Biorxiv、醫學預印本平臺 Medrxiv、化學預印本平臺 Chemrxiv 和中國科學院科技論文預發布平臺 Chinaxiv。
  • 我幫大家解讀了一下68篇新冠病毒論文
    於是這兩天我扒完了關於新冠病毒的所有學術文章!扒完後發現,事情跟大家想的還是有很大出入的。今天就來幫大家好好吃一吃學術瓜,分析一下新冠病毒究竟出了多少論文、該不該在這時候發這麼多論文、中國科學家的表現如何。現在究竟發了多少篇論文?新冠病毒的文章數量在持續增長。
  • 科學家光寫論文不抗疫情?我幫大家解讀一下68篇新冠病毒論文
    於是這兩天我扒完了關於新冠病毒的所有學術文章!扒完後發現,事情跟大家想的還是有很大出入的。今天就來幫大家好好吃一吃學術瓜,分析一下新冠病毒究竟出了多少論文、該不該在這時候發這麼多論文、中國科學家的表現如何。 01.現在究竟發了多少篇論文?
  • 新冠肺炎論文爆棚,全球190篇中國115篇,科學家們都發現了什麼?
    預印本平臺:科研文獻最快發布的主戰場據《每日經濟新聞》梳理的文章發布平臺看,除了廣為人知的《柳葉刀》外,bioRxiv和medRxiv的發稿量最大,合佔總稿量的45%。其次是《柳葉刀》,佔比23%,隨後是《新英格蘭醫學雜誌》,佔5%,《自然》排名第四,佔比4%。
  • 新冠源頭有定論了?美疾控中心疑拿到鐵證,全球各國屏息關注
    自從新冠病毒在世界範圍內爆發開始,美國等國家就紛紛指責新冠病毒的源頭在中國,並且,還稱中國應該為此次疫情所帶來的損失負責。然而,事實勝於雄辯,經過科學家們的研究,現如今新冠病毒的源頭可謂是終於蓋棺定論了。
  • 疫情之下,讀預印本論文的正確姿勢
    預印本系統的歷史預印本,顧名思義是還未正式發表在學術期刊上的論文,一般未經同行評議(peer review)之類的質量把控。公益性的預印本平臺目的在於讓學者快速發布論文,因為按照傳統的論文審稿流程,一篇論文從投稿到發布需要數周到數年之久。
  • 「主編講堂」預印本平臺arXiv簡介
    Wiki百科關於arXiv的介紹為,arXiv的發音是archive,其中ch用希臘字母χ替代,是一個在多個學科領域獲取預印本和科技論文的網站。近年來,預印本平臺因其快速高效的發表速度,越來越得到廣大科研工作者的歡迎,很多平臺可以將長達半年到一年的期刊出版時間大幅縮短到以天計算。
  • 多國最早感染新冠時間提前!論文「實錘」法國去年12月已傳播,美意...
    關於新冠病毒的最早感染和傳播病例,近期各國出現了多例時間提前的研究和報導。昨天,美國一位市長自曝去年11月已感染新冠,檢查出體內已有IgG抗體的消息還牽動著人們的視線;今天,又有論文證實法國去年12月已出現病例的報導在各大媒體「刷屏」,引發輿論關注。
  • 新冠病毒最早於2019年10月份在所有國家幾乎同時傳播?
    新冠病毒最早於2019年10月份在所有國家幾乎同時傳播?近日,一篇題為【英國研究:新冠最早始於去年十月,「所有國家幾乎同時傳播」】廣泛傳播。而國內最早報導這一內容的是央視,是對美國CNN一篇報導的摘要。從【英國研究:新冠最早始於去年十月,「所有國家幾乎同時傳播」】這篇網傳熱文的標題,人們很容易被誤導,認為:「新冠病毒最早於去年10月份開始在所有國家幾乎同時傳播」。新冠病毒在「所有國家幾乎同時傳播」?
  • 新冠病毒真的起源於美國嗎?
    最初中國科學家經研究認為新冠病毒可能起源於中華菊頭蝠,中間宿主可能為穿山甲,人類食用這些動物後被傳染,再經過人與人之間的傳染擴散開來。然而,近期一些研究揭示:新冠病毒可能最早起源可能並非中國。根據2月21日,西雙版納熱帶植物園鬱文彬教授等人在中科院論文預發布平臺ChinaXiv發表論文「Decoding the evolution andtransmissions of the novel pneumonia coronavirus (SARS-CoV-2) using wholegenomic data」(全基因組數據解碼新冠病毒的進化和傳播)。
  • 八國專家《柳葉刀》聯署聲明:我們與中國同行站在一起
    與此同時,先前頗有群眾基礎的新冠病毒人為幹預流言也正在被科學事實逐一反駁。例如,新冠病毒乃「合成」。 近日,幾位業內知名科學家就聯合發表了一篇預印本論文,詳細分析了新冠病毒(SARS-CoV-2)中兩個疑似人為幹預的特徵。
  • 關鍵信息出錯,頂級期刊新冠病毒論文鬧「烏龍」
    根據《科學》網站的報導,德國羅伯特·科赫研究所宣布,這篇論文的信息來源存在重大缺陷,論文結論並不成立。需要指出的是,即使這篇論文站不住腳,無症狀傳染的現象仍然很可能存在。根據世界衛生組織的最新觀點,新型冠狀病毒的主要傳播方式仍是有症狀傳染,無症狀傳染可能很罕見。但這次烏龍事件提醒我們思考,在疫情蔓延的特殊時期,應如何確保論文信息的快速與準確性。
  • 預防肺結核的卡介苗可減輕新冠影響?柳葉刀這樣說
    近期不斷有科研人員提出,接種卡介苗或許能保護醫護人員和其他危險人群免受新冠的侵害。權威醫學期刊《柳葉刀》雜誌於近日刊發了澳大利亞墨爾本大學、世界衛生組織、美國西奈山伊坎醫學院、德國波恩大學的通訊文章《對接種卡介苗以減輕COVID-19影響的思考》,表示雖然存在一定的證據證明卡介苗或許有效,但仍需嚴格遵循世衛組織的建議:只能在隨機對照試驗中使用卡介苗,來驗證其對減輕新冠影響是否有效。