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根據百度百科上內容解釋：「APTX-4869」是一種無條件促成人體細胞自死的藥物，詳細情況不明。APTX4869可以殺人於無形，但偶發作用下會使服藥者的身體恢復成幼年。
工藤新一、宮野志保（代號雪莉，即灰原哀）和赤井瑪麗（即「領域外的妹妹」）均因服用此藥而身體縮小。除這三人外，此藥其他的已知服用者都因服用此藥而死亡。
在《柯南》的第一集工藤新一與青梅竹馬毛利蘭在遊樂園約會，乘坐雲霄飛車時，遇到了一起殺人事件。工藤新一破解案件後，發現跟他們一起乘坐雲霄飛車的黑衣人急匆匆的跑了，偵探的敏感度讓他跟蹤了黑衣人，發現與某公司董事長的巨額交易，他卻被黑衣人的同夥從背後而來一棍打暈，黑衣人想要用槍解決了新一。
同夥怕被附近巡邏的警察發現就掏出了組織新開發的毒藥給他灌下，想神不知鬼不覺的處理了新一，也算是給這個新毒藥做了第一次人體試驗。
工藤新一醒來後卻沒有死亡，而是身體被藥效導致細胞凋亡，縮小到了十年前的7歲小學生樣子。被警察發現時他趁機逃離，跑到了自己家門口，被隔壁的發明家阿笠博士發現。工藤新一說出漂亮的推理和阿笠博士的秘密，從而得到了阿笠博士信任，穿上了小時候的衣服。
根據線索，我們知道是灰原哀製作了這種毒藥，但她一開始製作「APTX4869」並不是為了把它製成毒藥。那麼她一開始到底是因為什麼才製作「APTX4869」？想要知道其中的奧秘，那麼至少我們要知道「APTX4869」到底是什麼做的。
首先我們先從藥的名字來看，APTX4869，乍看一下，只是4個英文和4個數字，難道這就只是隨便瞎起名字?很顯然，不是！一般實驗室在研究新藥物的時候，給藥物起名，無非就是根據藥物的功能，藥物的主要成分之類的來命名。
英文「APTX」其實是"APOPTOXIN"的縮寫，"APOPTOXIN"是由"apoptosis"(程序性細胞死亡)和"toxin"(毒素)所組合成的混成詞。也就是說這個毒藥的作用是讓細胞程序性死亡。
程序性細胞死亡簡單點來說就是樹葉自然凋落那樣，凋亡的細胞散布於正常組織細胞中，沒有任何不良反應，也不會留下任何痕跡，不影響其他細胞的正常功能。這也就解釋了為什麼工藤新一在被餵下毒藥後會感覺身體在發熱，自身的骨頭好像在融化一樣，而醒來就縮小到了小學生的樣子。
其次再來看它的藥效，根據黑衣人的說法是服用過後讓人死亡，但不會檢查到任何致死原因，更不會查到這種藥的任何殘留成份。而黑衣人不知道的是，由於製造者（灰原哀）的私心，藥效發生了改變，沒能殺人於無形而是讓人身體縮小。
那APTX4869到底是什麼？小編覺得應該是整部漫畫重要線索，接下來的劇集雖說都是獨立存在的，但與此也息息相關。也正是由於APTX4869的陰差陽錯，才讓這位「平成年代的福爾摩斯」「日本警察的救世主」，天才偵探工藤新一沒有一命嗚呼，而是變成了小學生江戶川柯南繼續探尋真相，慢慢解開一個個謎團。
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