截至2020年11月，山南市轄1個市轄區（乃東區）和11個縣（扎囊縣、貢嘎縣、桑日縣、瓊結縣、曲松縣、措美縣、洛扎縣、加查縣、隆子縣、錯那縣、浪卡子縣）。
市轄區
1.乃東區
乃東區，隸屬於西藏自治區山南市，位於西藏自治區中南部、岡底斯山南部、雅魯藏布江中遊，總面積2208.85平方公裡，是山南市人民政府所在地。藏語中意思是「象鼻山尖前」。
縣
2.扎囊縣
扎囊縣隸屬於西藏自治區山南市，地處西藏中南部、雅魯藏布江中遊，面積2163平方公裡。
名特產品有土豆、雜玉陶器、敏竹林藏香、藏桌藏櫃、壁畫雕塑、扎囊疆穩、吉汝氆氌等。
3.貢嘎縣
貢嘎縣是中華人民共和國西藏自治區山南市下轄縣，位於西藏自治區南部，貢嘎縣總面積2386.11平方公裡。
貢嘎縣手工毛紡工藝歷史悠久，「傑德秀圍裙」享譽中外。貢嘎縣是拉薩貢嘎國際機場的所在地，是西藏著名的航空大縣。
4.桑日縣
桑日縣隸屬西藏自治區山南市，位於西藏自治區東南部，山南市北部，總面積2633.62平方公裡。
主要景點有丹薩梯寺、沃卡溫泉、達古峽谷、馬鹿自然保護區等。
5.瓊結縣
瓊結縣位於西藏自治區東南部，山南市中部，總面積約1030平方公裡。瓊結縣地處西藏南部、雅魯藏布江中遊南岸的瓊結河谷地。
6.洛扎縣
洛扎縣隸屬西藏自治區山南市，藏語意為「南方大懸崖」，地處西藏自治區南部，總面積5570.3平方公裡，全縣中部就是一條大峽谷——洛扎溝，為西藏自治區的區邊境縣之一。
7.加查縣
加查縣為西藏自治區山南市轄縣，位於西藏自治區南部，總面積4646平方公裡。加查，系藏語「漢鹽」之意。
8.隆子縣
隆子縣，隸屬於西藏自治區山南市，位於山南市南部，總面積10566平方公裡。隆子，藏語意為「萬事順利，實力雄厚」、「須彌山頂」。古稱「涅」。
9.曲松縣
曲松縣隸屬於西藏自治區山南市，總面積1967平方公裡，曲松，藏語意為「三河」。因色布河、江扎河、貢布河貫穿全縣境內，該三條河藏語譯音為「曲松」，曲松縣因此而得名。
10.措美縣
措美縣是西藏自治區山南市的下轄縣，位於山南市西南部，西藏自治區南部，總面積4549平方公裡。措美縣古堆鄉是藏獒的原生地，古堆鄉有「藏獒之鄉」之稱。
11.錯那縣
錯那縣，意為「湖的前面」，山南市下轄縣，是西藏自治區的邊境縣之一，總面積35191.23平方公裡。
12.浪卡子縣
浪卡子縣隸屬於西藏自治區山南市，位於山南市西南部，全縣國土總面積8109.23平方公裡。是山南市海拔最高的縣，也是西藏自治區的邊境縣之一。