在20年前的高校大合併當中，最為悲催的應該是醫科大學，很多被綜合大學吞併，由一所大學變成了大學裡的一個學院。那麼，這些被合併到綜合大學中的原來的醫科大學日子過得怎麼樣呢？應該是有人歡樂有人愁吧。
不用說你原來不是豪門而嫁入豪門，即使你原來也是豪門而進入另一個豪門，日子也不見得那麼好過。畢竟你得遵守新入豪門的規矩，這個習慣的改變是需要很長時間的，有的可能一輩子都難以適應。
衛生部原來有11所直管醫科大學，這可是中國頂尖水平的醫科大學啊，其中還有4所211大學，其中的9所被合併了。此外還有許多省屬醫科大學也被合併掉了。
華西醫科大學（211，原屬衛生部）——四川大學。
北京醫科大學（211，原屬衛生部）——北京大學。
上海醫科大學（211，原屬衛生部）——復旦大學。
湖南醫科大學（211，原屬衛生部）——中南大學。
中山醫科大學（原屬衛生部）——中山大學。
白求恩醫科大學（原屬衛生部）——吉林大學。
同濟醫科大學（原屬衛生部）——華中科技大學。
西安醫科大學（原屬衛生部）——西安交通大學。
山東醫科大學（原屬衛生部）——山東大學。
湖北醫科大學——武漢大學。
上海第二醫科大學（211）——上海交通大學。
浙江醫科大學（211）——浙江大學。
南京鐵道醫學院——東南大學……
從合併的情況看，雖然有的傍上了985，也進入世界一流大學大門，有的傍上211大學，也提高了身份，但卻失去了獨立辦學的資格，由雞頭變成了牛尾，自身發展面臨諸多不確實因素。從第四次學科評估中的基礎醫學與臨床醫學評估結果看，對比一下沒有合併前的地位，就可以看出被合併掉的原來的醫科大學現在是一個什麼狀態。具體情況見下表。
從上表可以看出，有的確實進步明顯，有的保持了原來的優勢，有的失去了原來的優勢。從現實情況看，有的發展陷入困境之中，投入不僅沒有增加反而明顯減少，名氣不僅沒有提升反而有所降低，實力不僅沒有增強反而有所下滑。
進步明顯的，比如被合併進同濟大學的原上海鐵道大學醫學院，被合併進武漢大學原湖北醫科大學，都不是211大學，在醫科領域的實力怎麼著也得排在衛生部原來直管的11所醫科大學之後，可在第四次學科評估中表現出色。同濟大學醫學院原來名不經傳，併入之後得到快速發展，短時間之內醫學學科整體水平已躋身全國醫學院校前10%。武漢大學醫學院的口腔醫學被列為「世界一流學科」建設，與北京大學、上海交通大學、四川大學並列，顯然武漢大學對原湖北醫科大學的拉升作用明顯。
保持優勢的，比如被合併進北京大學的原北京醫科大學，被合併進復旦大學的上海醫科大學，被合併進上海交通大學的原上海第二醫科大學，被合併進中山大學的原中山醫科大學等。它們在第四次評估中，基礎醫學仍然處於前列，上海交大、浙江大學、復旦大學的臨床醫學更加靠前。尤其是復旦大學、上海交大、北京大學、中山大學的基礎醫學和臨床醫學雙雙列入「世界一流學科」建設行列。
失去優勢的，比如被合併進中南大學的湖南醫科大學，被合併進華中科技大學的同濟醫科大學等。這兩所被合併掉的醫科大學原來都是衛生部直管的，其中湖南醫大還是211大學，同濟醫科大學曾經是中國醫學科學院分院，可是在第四次學科評估中，基礎醫學都只是B+檔次，被南京醫科大學和天津醫科大學超越，臨床醫學雖然好一些，也只是處於A-檔次。全國共有23所大學在醫學方面入選「世界一流學科」，其中查不到中南大學，這說明從未來發展看，被併入中南大學的原湖南醫科大學可能掉出20名之外，著實可惜。華中科技大學尚有臨床醫學、公共衛生和預防醫學被列入「世界一流學科」建設，實力依然強勁，但學科評估卻呈現下滑超勢。
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