首先，從傳播角度來說，《名偵探柯南》明顯就要比《金田一少年事件簿》成功，如今《名偵探柯南》已經有一千多話了，還遠沒有達到完結，並且每一兩年就有一部劇場版上映。而主角的小孩形象，也讓《名偵探柯南》傳播甚遠，橫跨多個年齡段的觀眾。
從推理的嚴謹程度上來看，《金田一少年事件簿》就要比《名偵探柯南》更為出色了，也更為的寫實了，可以算得上是推理漫畫的一個經典，這也是為什麼《金田一少年事件簿》能夠出現多部真人改編電影。
其次要從商業角度和劇情角度兩個方面來說
先說商業角度，《名偵探柯南》在商業方面自然是要比《金田一少年事件簿》成功，柯南的 TV 動畫是日本的國民級作品每周都在播出，而《金田一少年事件簿》除了最開始的 TV 動畫外，這兩年又有一部《金田一少年事件簿 R》，但就人氣和收視來說已經沒法和柯南相提並論。柯南 TV 動畫的常年播出以及每年一部的劇場版動畫，讓粉絲群體從老到少基礎廣泛，多年來持續的聯動以及周邊銷售，也是洗了一波又一波的粉絲。而金田一現在只能是吸引比較核心的觀眾和讀者來看動畫與漫畫。從商業角度來講是柯南勝。
而從劇情，準確來說案情角度來講，我認為是金田一更勝一籌，大家現在普遍想到柯南最恐怖的案件都是集中在連載的早期，例如月光奏鳴曲殺人事件、山莊繃帶怪人殺人事件、天狗傳說殺人事件、圖書館殺人事件等等，青山剛昌在柯南漫畫連載早期走的都是本格推理風的故事，也就是暴風雪山莊模式，在一個封閉的環境下，警察難以進入，沒有高科技的偵測設備，兇手就在身邊。柯南初期的故事從作案動機上講有社會派推理的味道，一些殺人犯的故事往往折射的是社會現實。而殺人手法尤其是在密室詭計構造上也十分精彩。
但是柯南漫畫隨著長期連載，就不可避免的套路化，漫畫裡還好一些犯案詭計設計的還出彩，但是在動畫裡現在真是變成了科幻探案劇了。故事也是越來越散，這一兩年才重新在動畫和漫畫中把劇情拉回到與黑衣組織較量的主線上來。
柯南的感情戲反而比破案戲好看
柯南連載的時間長，動畫播出的時間長，所以就造成了登場角色變多故事變得分散，已經從原來的偵探推理漫畫變成了，言情偵探推理科幻搞笑漫畫，如果為來柯南漫畫要完結的話，青山本人將要解決很多角色的關係和劇情，也是比較棘手
而在金田一的漫畫裡，登場的角色是相當固定的，主要就是金田一、美雪、劍持警部、明智警視，再加上一個最終 BOSS 高遠遙一。金田一的漫畫也連載了20多年，但每起案件包括一些短篇故事中的案件，都是一直堅守本格推理，每個案件都會有全新的犯案詭計，以及悲傷或者令人深思的案件背後的故事與動機，所以金田一的劇情一直吸引人，每個案件渲染的恐怖氣氛以及體現的人性扭曲都十分精彩。
推薦可以看看金田一的《絞首學園殺人事件》、《天草財寶傳說殺人事件》、《獄門塾殺人事件》、《香港九龍財寶殺人事件》、《 人偶島殺人事件》每個案件都是讓人看的汗毛倒立（配圖中的異人館村殺人事件基本是抄襲佔星術魔法殺人事件，所以這是金田一漫畫目前最大的汙點，少年包青天也抄過這個案件的核心詭計）、柯南的劇情越來越散，而金田一倒是因為這麼多年動畫斷檔再加上時不時的休刊，反而讓劇情更加專注在偵探推理這件事請上。所以劇情上是金田一勝
柯南的知識面太廣，可以說是無所不知無所無所不曉，加之柯南的推理破案模式基本上是自圓其說，推理前並沒有將證據線索放在檯面上。所以在這種情況下柯南是立於不敗的，反正都是作者說了算，一切的問題作者都能以柯南之口用各種知識來為觀眾解答。反觀金田一的推理過程，屬於排除誤導向證據的推理，所有證據線索都擺在檯面上，能讓觀眾如同身臨其境一般與主角一同進行推理。
嚴格意義上來看，柯南並不能算是真正的偵探推理動漫，因為所有的線索和謎底在柯南這個「維基百科」面前都是那麼的理所當然，基本上沒有觀眾介入的餘地，只是單純的在聽「柯南」陳述一件又一件的故事而已！