生產企業申報常見問題：
1、沒有從徵管系統傳遞過來的增值稅納稅申報表。
原因：未完成納稅申報或報稅剛完成時間過短。
2、退稅率（？16.00）與商品碼庫中的（？13.00）不等。
原因：通常為退稅率文庫未升級。
3、申報出口商品代碼（xxxxxxxx）為特別關注商品，關注級別為（1/2/3/4）級，需要加強審核。
原因：特別關注商品，申報資料需附送對應的自查表。
4、報關單（xxxxxxxxxxxxxxxxx）為非保稅區運入保稅區和保稅區退區。
原因：出口至保稅區或物流園，需附送備案清單。
5、申報商品碼（xxxxxxxx）與海關數據中的（xxxxxxxxx）不等，需填報《海關出口商品代碼、名稱、退稅率調整對應表》。
原因：如排除申報有誤，則企業錄入的商品編碼已經改變，需要填報《海關出口商品代碼、名稱、退稅率調整對應表》
6、總局代理證明數據中無此代理證明號（xxxxxxxxxx）。
原因：代理出口業務，代理證明尚未傳遞信息成功。請等待。
7、申報出口日期（xxxx/xx/xx）與海關數據中的（xxxx/xx/xx）不等。
原因：企業申報錯誤。請到電子口岸核實。
8、報關單號（xxxxxxxxxxxxxxx）剩餘數量（xxxx）小於企業申報出口數量（xxxx），其中報關出口（xxxx)申報退稅（0.0000？）代理（0.0000）退運（0.0000)。
原因：曾辦理退運。
9、美元離岸價（xxxx）超過海關（xxxx），企業需提供《出口貨物離岸價差異原因說明表》。
原因：企業申報錯誤，或者匯率差異導致離岸價差價。
10、美元離岸價（xxxx）小於海關（xxxx）。
原因：企業申報錯誤，或者曾辦理退運，或者匯率差異導致離岸價有差額。
11、海關數據中無此報關單號（xxxxxxxxxxxxx）。
原因：該報關單無信息或企業錄入錯誤。另外就是海關與稅務部門電子信息交換的問題或者通過電子口岸重新發送數據。
12、人民幣結匯業務，業務類型應為KJ。
原因：該報關單為人民幣結匯業務，業務類型應當選擇KJ（跨境）。
13、此貿易性質（3010）存在退稅或不退稅情況，請確認後處理。
原因：可能為不退稅商品，請做內銷處理。
外貿企業申報常見問題：
1、「總局發票庫中不存在」。
原因有：企業取得的增值稅專用發票未退稅勾選、或者錄入錯誤。或是當月的發票勾選了，稅務機關尚未採集信息。
2、「非交叉稽核發票」。
原因有：企業已勾選的專用發票尚未通過稽核系統比對。
3、「開票日期與總局信息不一致」。
原因有：企業錄入錯誤。
4、「銷售方稅號錄入錯誤」。
原因：企業錄入錯誤。
5、「發票金額、稅額與總局信息不一致」這裡大多都是與實際發票相差1分。
原因：企業在退稅申報系統錄入時，稅額自動生成大於實際發票註明的稅額。或者增值稅專用發票號碼錄入重複、關聯號使用重複等。
6、「企業申報數量大於總局發票數量」。
原因：企業申報數量錄入錯誤。必須按報關單註明的第一計量單位和數量錄入，至少與報關單中註明的任意一條相符。
7、「供貨方為特別關注企業*級」。
原因：供貨方為特別關注企業，需要進行發票函調協查。
8、審核時提示「關聯號重複」。
原因：企業使用的當前申報關聯號與前期重複（一般情況出現在當月申報多個批次的時），需修改。
9、換匯成本過高或過低。
原因：換匯成本過高，如果不是企業有意高開採購發票金額用於退稅，可以從經營角度說明，例如與客戶籤訂合同的時間較早，後來原材料成本持續上漲，導致工廠將價格上調等；換匯成本過低，說明該筆貨物盈利水平很好，雖然申報時退稅系統會自動顯示，把這個當做疑點之一，但稅務局那裡一般是可以通過的，不必擔心。
來源：國家稅務總局貴州省稅務局