東北地區有著如哈爾濱工業大學、吉林大學、東北大學這樣的全國知名的高校，但是因為東北地區近幾年的經濟衰退，很多原本實力強勁的高校不再像之前那樣在國內都有著很高的知名度。而且東北對別的省市的考生的吸引力逐漸下降。但是東北還是不缺實力不俗的高校，下面介紹的這兩所高校，雖然在國內的知名度不算高，但是其某一學科的實力在業內有著極高的認可度。
1、哈爾濱工程大學
哈爾濱工程大學簡稱「哈工程」，位於黑龍江省哈爾濱市，是世界一流學科建設高校以及「211工程」高校。哈爾濱工程大學創建於1953年，1981年成為首批具有博士、碩士學位授予權單位；1994年，更名為哈爾濱工程大學。
哈爾濱工程大學的船舶與海洋工程成功入選世界一流學科建設學科，在第四輪學科評估中船舶與海洋工程獲得了A+的評級排名並列全國第一，控制科學與工程獲得A-的評級，其中核科學與技術位列並列全國第三，但因為參評院校較少的緣故，只獲得B+的評級。雖然哈爾濱工程大學在全國範圍內的知名度不算高，不過在船舶等行業內的認可度還是非常高的。
2、大連海事大學
大連海事大學位於美麗的海濱城市遼寧省大連市，是交通運輸部所屬的全國重點大學，是國家「雙一流」世界一流學科建設高校、國家「211工程」建設高校。大連海事大學最早可以追溯到1909年創辦的郵傳部上海高等實業學堂船政科。在1953年由東北航海學院、上海航務學院、福建航海專科學校合併成立大連海運學院，並在1994年更名為大連海事大學。
大連海事大學的交通運輸工程成功入選世界一流學科建設學科，不過在第四輪學科評估中表現不佳，僅交通運輸工程取得了B+的評級，沒有一個學科獲得A級。目前大連海事大學有航海技術、輪機工程、電子信息工程等六個國家級特色專業建設點。大連海事大學在交通領域的認可度還是非常高的。