北海道大學和熊本大學都是日本國內名校，實力也非常強勁，在日本國內影響力和知名度非常高。兩所學校都是日本公辦高校，而且都通日本其所帝國大學略有聯繫，也算是出自名門的兩所高校。相對來講北海道大學建校更早，創辦於1876年，距今也有100多年的歷史，可以稱之為百年名校。
北海道是日本最北的一級行政區，面積相當於日本國土面積22%，而人口還不到600萬，在日本屬於典型的地廣人稀地區。這樣的地區最適合農業發展，因此北海道大學前身是一所農業大學，事實上目前北海道大學農學方面實力依舊屬於領先地位。北海道特產夕張蜜瓜，在日本家喻戶曉，而這些成果都來自北海道大學默默奉獻。另外環保、海洋、化學、材料、土木、化工方面，北海道大學的實力也比較突出。
北海道大學最為拿手的是低溫科學，畢竟這裡是日本最冷的地區。其實這個領域涉及的範圍非常廣，如航空航天、高速重載鐵路、農林牧漁、生物醫藥等等，事實上都需要低溫研究，這些方面北海道大學確實很強。他另外一個本地化的教研方向，就是斯拉夫研究，畢竟他更靠近俄羅斯，而且兩國又有一些爭議，所以更注重對其研究。其實北海道大學的很多優勢，都極其類似國內東北的大學。
熊本大學事實上更類似專類高校，他的前身是熊本醫科大學和第五高等學校合併組建而成，一聽名字，就知道這是一所以生命科學和醫學擅長的高校，其在這個領域內實力極強，如藥學、醫學、生理等方面，都是在日本排名靠前的專業。正是因為他不能算作一所綜合性大學，所以學生人數並不多。整體實力方面，要比北海道大學略微差一點，畢竟僅憑單一方面，很難對撞多學科高校。