grep用法大全

在Linux系統中， 提取命令有很多，比如我們熟悉的cut（列操作），sed（行操作），awk（強大的文本分析操作），以及另一個使用頻率非常高的grep命令。今天小編來說道一下grep指令。

grep命令可對文本文件進行模式查找。如果找到匹配模式，grep列印包含模式的所有行。grep檢索的條件是多種多樣的，甚至還可以和正則表達式合作來檢索。

grep [-abcEFGhHilLnqrsvVwxy][-A<顯示列數>][-B<顯示列數>][-C<顯示列數>][-d<進行動作>][-e<範本樣式>][-f<範本文件>][--help][範本樣式][文件或目錄...]

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-a 或 --text : 不要忽略二進位的數據。 
-A<顯示行數> 或 --after-context=<顯示行數> : 除了顯示符合範本樣式的那一列之外，並顯示該行之後的內容。 
-b 或 --byte-offset : 在顯示符合樣式的那一行之前，標示出該行第一個字符的編號。 
-B<顯示行數> 或 --before-context=<顯示行數> : 除了顯示符合樣式的那一行之外，並顯示該行之前的內容。 
-c 或 --count : 計算符合樣式（匹配行）的行數。 
-C<顯示行數> 或 --context=<顯示行數>或-<顯示行數> : 除了顯示符合樣式的那一行之外，並顯示該行之前後的內容。 
-d <動作> 或 --directories=<動作> : 當指定要查找的是目錄而非文件時，必須使用這項參數，否則grep指令將回報信息並停止動作。
-e<範本樣式> 或 --regexp=<範本樣式> : 指定字符串做為查找文件內容的樣式。 
-E 或 --extended-regexp : 將樣式為延伸的普通表示法來使用。 PATTERN 是一個可擴展的正則表達式(縮寫為 ERE)
-f<規則文件> 或 --file=<規則文件> : 指定規則文件，其內容含有一個或多個規則樣式，讓grep查找符合規則條件的文件內容，格式為每行一個規則樣式。 
-F 或 --fixed-regexp : 將樣式視為固定字符串的列表。 
-G 或 --basic-regexp : 將樣式視為普通的表示法來使用。 
-h 或 --no-filename : 在顯示符合樣式的那一行之前，不標示該行所屬的文件名稱。 
-H 或 --with-filename : 在顯示符合樣式的那一行之前，表示該行所屬的文件名稱。 
-i 或 --ignore-case : 忽略字符大小寫的差別。 
-l 或 --file-with-matches : 列出文件內容符合指定的樣式的文件名稱。 
-L 或 --files-without-match : 列出文件內容不符合指定的樣式的文件名稱。 
-n 或 --line-number : 在顯示符合樣式的那一行之前，標示出該行的列數編號。 
-o 或 --only-matching : 只顯示匹配PATTERN 部分。 
-q 或 --quiet或--silent : 不顯示任何信息。 
-r 或 --recursive : 此參數的效果和指定"-d recurse"參數相同。 
-s 或 --no-messages : 不顯示錯誤信息。 
-v 或 --revert-match : 顯示不包含匹配文本的所有行。 
-V 或 --version : 顯示版本信息。 
-w 或 --word-regexp : 只顯示全字符合的列。 
-x --line-regexp : 只顯示全列符合的列。 
-y : 此參數的效果和指定"-i"參數相同。 

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最開始要講的是雙引號引用。在使用grep命令時，輸入的字符串最好將用雙引號括起來。例如：「my interest」。如果不用雙引號將其括起來，那麼單詞interest將被誤認為是一個文件，查詢結果將返回「文件不存在」的錯誤信息。不過在調用模式匹配時，使用單引號。

1、查詢多個文件

 grep 「sort」 *.txt   （在當前目錄下所有的txt文件中查找字符串「sort」）

2、grep "SLC8A1" circRNA_info.txt  （檢索circRNA_info.txt文件中包含字符串」SLC8A1「的行）

-c參數表示：計算符合樣式的行數（即統計包含字符串」SLC8A1「的行數）；

-n參數表示：顯示滿足匹配模式的所有行的行數；

-v參數表示：顯示非匹配行（即不包含字符串」SLC8A1「的行）

3、-A參數的使用：對於fasta文件特別好用

4、精準匹配

大家已注意到，在上面的例子中，抽取字符串「10」。返回結果包含很多包含「10」的其他字符串，實際上應精確抽取只包含10的行，應該是最後一條命令操作（在每個匹配模式中抽取字符串（前）後有一個<Tab>鍵）。

 -P參數表示：PATTERN 是一個Perl正則表達式，（你會發現如果你不加該參數，無法精準確定該行）。

另外，使用grep抽取精確匹配的一種更有效方式是在抽取字符串後加「\>」。（註：上圖第二條指令，不過好像只是把匹配模式位於特殊位置的字符串取出來了。我也是第一次用，如果有更好的解釋，留言告訴我。）

5、grep和正則表達式

 匹配任意字符：（[]來指定字符串範圍；如要精準匹配，類似第二條命令）

匹配行首：

使用grep匹配「與」或者「或」模式：

一個簡單的入門介紹就到這裡啦，想要了解更多Linux操作命令，請持續關注我們呦~~