我市城市軌道網絡遠期共規劃了20條線路，總裡程約748.5公裡（含彈性發展線路約73.7公裡）；同時規劃了5條城際線路，形成約146.2公裡的城際線網，加上國家鐵路，我市軌道交通總裡程遠景規劃將達到1080公裡，軌道規模和密度與東京等國際先進城市基本相當。
根據規劃，我市將繼續保持幹線道路網「七橫十三縱」的總體布局，幹線道路網總裡程約759公裡，比上一輪規劃的路網規模增加了44公裡。
1號羅寶線（已建成，深圳第一條地鐵）
途徑寶安、南山、福田、羅湖4個區，已開通30個站，依次為：羅湖站、國貿站、老街站（龍崗線換乘）、大劇院站（蛇口線換乘）、科學館站、華強路站、崗廈站、會展中心站（龍華線換乘）、購物公園站（龍崗線換乘）、香蜜湖站、車公廟站、竹子林站、僑城東站、華僑城站、世界之窗站（蛇口線換乘）、白石洲站、高新園站、深大站、桃園站、大新站、鯉魚門站、前海灣站（環中線換乘）、新安站、寶安中心站（環中線換乘）、寶體站、坪洲站、西鄉站、固戍站、后瑞站、機場東站。
一期工程於2004年12月28日17時開通，二期西延段於2011年6月15日12點開通。
2號蛇口線（一期已建成，延長未開工）
途徑南山、福田、羅湖，共29個站，依次為：赤灣站、蛇口港站、海上世界站、水灣站、東角頭站、灣廈站、海月站、登良站、後海站、科苑站、紅樹灣站、世界之窗站、僑城北站、深康站、安託山站、僑香站、香蜜站、香梅北站、景田站、蓮花西站、福田站、市民中心站、崗廈北站、華強北站、燕南站、大劇院站、湖貝站、黃貝嶺站、新秀站。
一期工程於2010年12月28日開通。東部延長到蓮塘片區，尚未開工。
截至2014年8月，運營虧損累計4.81億元。
未來20條深圳地鐵線路規劃站點全曝光
3號龍崗線（主體已建成，預留未啟用）
龍崗線由福田的益田至龍崗的雙龍，總長約41公裡，設車站30座。分兩期建設，一期工程由紅嶺至雙龍（草埔站、布吉站、木棉灣站、大芬站、丹竹頭站、六約站、塘坑站、橫崗站、永湖站、荷坳站、大運站、愛聯站、吉祥站、龍城廣場站、南聯站、雙龍站）。二期工程由益田至紅嶺。（益田站、石廈站、購物公園站、福田站、少年宮站、蓮花村站、華新站、通新嶺站、紅嶺站、老街站、曬布站、翠竹站、田貝站、水貝站），預留遠期延長至保稅區的功能。
於2011年6月28日全線通車，平均每天客流量達50.32萬人次。
4號龍華線（已建成，由港鐵運營，故障率高）
沿線各站分別為福田口岸、福民、會展中心、市民中心、少年宮、蓮花北、上梅林、民樂、白石龍、深圳北站、紅山、上塘、龍勝、龍華、清湖。
於2010年7月1日轉交予港鐵（深圳）公司營運，合約直至2040年止。2011年6月16日全線通車，初期配備8輛4節編組列車，加上人流較大，擁擠程度堪稱所有通車線路之最，運行事故故障頻發，引發抱怨。
2014年1月26日，龍華線首批2列6節版列車正式投入運營。2015年1月30日，最後一列4節編組列車退出正線服務。
5號環中線（已建成，延長線已開工）
由南山前海灣至羅湖黃貝。站點依次為：前海灣站、臨海站、寶華站、寶安中心站、翻身站、靈芝站、洪浪北站、興東站、留仙洞站、西麗站、大學城站、塘朗站、長嶺陂站、深圳北站、民治站、五和站、坂田站、楊美站、上水徑站、下水徑站、長龍站、布吉站、百鴿籠站、布心站、太安站、怡景站、黃貝嶺站。
環中線於2007年開工，2011年6月22日建成通車。
按照最新的規劃，將從前海延長到赤灣片區，已開工。
4月20日早晨8時30分許，5號線黃貝嶺站由於一名乘客在站臺暈倒導致人群奔逃釀成事故。
6號光明線（一期已開工在建，延長線未開工）
初期規劃由深圳北站至松崗，設站20座，依次為深圳北站、紅山、上塘北、元芬、大浪、石巖、上屋北、長圳、觀光、光明中心、荔林、光明北、樓村、南莊、公明廣場、合水口、薯田埔、山門、溪頭、松崗，其中換乘站6座。連接龍華街道新城、石巖、光明、公明、松崗等片區，並通過龍華線換乘至福田中心區，為聯繫核心城區與中部綜合組團、西部高新組團的城市組團快線。全線多數路段採用高架線路。在2011年5月修改通過的《深圳市城市軌道交通近期建設規劃（2011-2016）》中，光明線為三期線路，建設時間為2011-2016年。2014年12月30日，6號線前期工程舉行開工儀式，前期工程開工也就是管線改遷，交通疏導、綠化遷移，正常的話半年後主體工程應該能開工。
在2012年11月20日公示的深圳市軌道交通發展（修編）指出，將光明線延長至科學館站，與地鐵羅寶線（1號線）換乘。二期工程路線圖：深圳北、白石龍、民樂（與龍華線換乘）、銀湖（與梅林線換乘）、八卦嶺（與西麗線換乘）、通新嶺（與龍崗線換乘）、科學館（與羅寶線換乘），目前尚未開工。
7號西麗線（建設中，計劃明年底通車）
連接布心、田貝、筍崗、華強北、福田南、車公廟、龍珠、西麗等片區，是聯繫特區內主要居住區與就業區的局域線。東西向橫穿深圳市區，是深圳市軌道交通線網中的局域線。
線路由太安至西麗動物園，全長約30.2公裡，設麗湖、西麗、茶光、珠光、龍井、桃源村、深雲、安託山、農林、車公廟、上沙、沙尾、石廈、皇崗村、福民、皇崗口岸、河套、赤尾、華強南、華強北、華新、黃木崗、八卦嶺、梅園、筍崗、洪湖、田貝和太安共28座車站，全部為地下車站，其中13座為換乘站。
2012年10月23日動工，預計將於2016年底通車。
8號鹽田線（制式爭議中，未開工）
以羅湖國貿站為起點，經蓮塘、沙頭角至小梅沙終點站，全長約30.4公裡，暫設國貿、春風路、東門、黃貝嶺、羅芳、新秀、蓮塘口岸、蓮塘西站、蓮塘東站、沙頭角、鹽田區政府、鹽田港西、鹽田路、東海道、鹽田港東站、大梅沙站和小梅沙站共17座車站。整個工期原定於2013年開工，2018年6月建成。連接羅湖區和鹽田區，沿途經過仙湖、弘法寺、梧桐山、大小梅沙、東部華僑城等著名旅遊景點。主線外設蓮塘到仙湖、大梅沙到東部華僑城兩條支線，總長約長9公裡，以高架為主。
8號線在規劃之初打算採用普通輕軌制式，投資約47.2億元。但在2009兩會上，有人大代表極力主張採用磁懸浮技術，認為磁懸浮技術建設工期短，不到三年便可以建設完成，並且安全係數比較高。對於這一建議，市政府曾表示，磁懸浮技術可以作為8號線的備選方案之一，但是否採用還要繼續研究。所以目前尚未開工。
9號梅林線（一期在建中，計劃明年底通車，延長線已開工）
線路起自深圳灣公園站，止於文錦站（又稱向西站），全長25.33km，共設22座車站，其中10座換乘站。9號線全部為地下線路，聯繫文錦、紅嶺、泥崗村、梅林、景田、車公廟、紅樹林等片區，是聯繫特區內主要居住區與就業區的局域線。主要站點：深圳灣公園站、僑城南、濱海醫院、下沙、車公廟、香梅、景田、梅景、下梅林、梅村、上梅林、梅林東、銀湖、泥崗、紅嶺北、園嶺、紅嶺、大劇院、鹿丹村、人民南、春風、文錦等。
遠期將規劃至前海站，與地鐵羅寶線、環中線、機場線、港深西部線(港鐵)綜合換乘。還會在沿途與前南線、南寶線換乘。
一期工程於2012年8月動工，預計2016年底通車。遠期西延線工程總體設計通過專家評審，有望在年內動工建設，預計2020年將建成通車，根據最新消息，西延段已經開工。
10號坂田線
（動工建設中，運營無時間表）
起自福田口岸，終點為平湖中心，線路長度28.88公裡，經福田、龍華新區、龍崗三大區域，共設車站23個(龍崗境內16個)，其中換乘站8座(龍崗境內2座：五和及平湖樞紐)。
2014年12月30日，10號線前期工程（管線改遷，交通疏導、綠化遷移）開工儀式舉行，目前正動工建設中。
10號線的啟動建設將對華為科技城、坂田、南灣及平湖地區的發展具有重要意義。具體運營目前暫無確切時間表，將按照地鐵施工正常周期60個月時間完工並投入試運營。
11號機場線
（主體工程建設中，二期延長未開工）
自福田站至碧頭站，線路總長51.936公裡。全程51公裡只設17個車站，設計時速達到120公裡。機場線具備快速聯繫城市中心區與西部片區的功能，同時兼顧機場快線功能，串聯了福田中心區、南山、前海、機場、福永、沙井、松崗等片區。由於航站樓位於前方西部的海面上，地鐵線路也從陸地「下水」跟著向西拐建在海面上。由於設站少、速度高，機場線從深圳市中心到機場只需要29分鐘，不僅如此，這條線路還將實現深圳到東莞的軌道連接。
2015年1月13日，11號線最長的單線盾構法區間——寶安至碧海區間全線貫通，開始全面鋪軌。目前，地鐵11號線全線14座地下車站主體結構已基本完成，預計今年4月底前，地鐵11號線將完成所有土建工程主體結構施工，12月底前完成所有附屬工程施工；2016年1月31日前安裝裝修全部完成。今年3月份全面開工軌道工程，7月1日實現短軌通，9月30日實現長軌通，11月30日前軌道工程全面完工。2016年3月20日前完成全線設備總聯調。
另外，根據最新消息，11號線二期工程將從水晶島延長到上海賓館，目前尚未開工。
12號南寶線
（規劃階段，建設時間未定）
南寶線原為10號線。2007年7月深圳市規劃局編制的《深圳市城市軌道交通建設規劃（2011～2020）》中，10號線屬於近期建設線路（三期線路），建設時間為2011-2020年。在2011年5月修改通過的《深圳市城市軌道交通近期建設規劃（2010-2016）》中，10號線未進入三期線路，建設時間推遲到四期工程。
2012年11月，深圳市規劃與國土資源委員會發布了《深圳市軌道交通規劃（修編）》，10號線走向進行了重大更改。線路被「腰斬」，由海上世界至桃源居，全長20.7公裡，暫定名南寶線。相關更改引起寶安老城區居民不滿。隨後，深圳市軌道辦表示，地鐵10號線有可能按原規劃方案進行施工。
2013年，地鐵16號線編號改為10號線，並計劃將其納入三期工程，提前建設。深圳市寶安區城市軌道交通工作領導小組辦公室表示：深圳原地鐵10號線沒有取消，原10號線一定會開工建設，但將調整建設時序。
2015年初，寶安區軌道辦主任張聰傑在寶安兩會上表示，原10號線已更名地鐵12號線，納入市四期軌道建設規劃中，最快也要在2016年以後才能動工。
2015年4月，南山區向市裡協調將12號線延長至太子灣。
但據市民諮詢得到的回覆是：目前，軌道12號線尚未列入我市軌道近期建設項目，具體建設時間未定；因尚處於線網規劃階段，沿途站點設置尚未明確。
13號石巖線
（規劃階段，建設時間待定）
根據我市軌道交通規劃修編方案，原軌道15號線更名為軌道13號線，起點為深圳灣口岸，經科技園至石巖，並預留進一步北延條件。目前，我委會同市發改委正開展軌道4期建設規劃，將深入研究軌道15號線建設的必要性和緊迫性，儘量爭取早日建設軌道15號線。
14號東部快線
（規劃中，建設時間未定）
又稱作地鐵東部快線，它是目前地鐵遠期規劃中唯一的一條連通關內與整個龍崗的地鐵線。在大龍崗片區，連通坪山新區、寶荷片區、龍崗中心城、橫崗、布吉丹竹頭、布吉石芽嶺片區、布吉老街片區從八卦嶺方向進入市內，終點為市民中心。
15號前南線
（規劃中，建設時間未定）
起終點均為前海，17號線在「在前海畫了一個圈」，該線路主要包圍了前海，後海，南山，寶安新安大部分地區。 與前海灣相依相偎的17號線，顧名思義就是圍繞著前海片區。身為「環線」，意味著其終點和起點「合為一體」。
根據公示的地形圖分析，17號線最西北端已抵達寶安西鄉大道，最南至南山區工業八路，朝東抵達科技園北區的沙河東路附近，最特殊的，是還有一段是橫跨前海灣。
17號線與其餘19條地鐵線路中的多條有著交集，其中包括市民們熟知的羅寶線、環中線、蛇口線，以及尚未建成的南寶線、梅林線、石巖線等。此外，作為珠三角交通樞紐的所在地，前南線還與起點均為前海媽灣站的穗莞深城際線、深珠城際線有交集，對於來往深圳珠海以及東莞的市民，將更為便利。
16號龍坪線
（規劃中，建設時間未定）
全長39．8公裡（其中地下段31．1公裡，高架段8．7公裡），設站26座。由福田區到龍崗中心城片區，連接福田南、福田中心區、梅林片區、中部（平湖）物流組團、龍崗中心城等。該線南起益田，東北至深圳東莞交界。設站有：益田站（換乘龍崗線）、水圍村站、福民站（換乘龍華線、西麗線）、崗廈站（換乘羅寶線）、崗廈北站（換乘蛇口線）、蓮花村站（換乘龍崗線）、有線電視臺站、福田黨校站（換乘梅林線）、豐澤湖站、雅寶站、雅園站、五和站（換乘環中線）、吉華站、華為站、雪象站、雪象北站、甘坑站、上李朗站、黃牛湖水庫站、木古站、華南工業城站、新南站、平湖站、大望站、龍平路站、油甘埔站、官井頭站、回龍埔站（換乘坪山線）
17號平湖線
（建設時間未定，延長規劃未定）
大致沿平湖大街布線，在穿越龍舟百貨後，脫離平湖大街，偏向東走向，最後與10號線的平湖中心站匯合。18號線從深圳體育館出發，終點位於平湖站以北。在未來的地鐵網絡中，與已經投入使用的龍崗線交叉，同時與尚未建成的梅林線、南寶線、坂田線、龍坪線均有交集。此外，未來的東部快線與其在白泥坑社區附近有交集，東部快線可抵達深圳東站，而白泥坑社區正是目前深圳市最大菜籃子——平湖海吉星農產品物流園的所在地。
深圳地鐵18號線跨越福田、羅湖、龍崗區三個大片區，是布吉、南灣、平湖前往羅湖和福田的最近、最便捷的一條地鐵路線。布吉、南灣、平湖人非常盼望早日開建。
18號沙井線
（遠期規劃，建設時間未定）
地鐵18號線（原13號線），大致沿平龍西路布線，與10號線的平湖樞紐站匯合。起點濱江新城，終點平湖樞紐，途經沙井、光明、觀瀾、平湖等地，定位為快速服務線路，屬我市遠期規劃線路。
19號坪山線
（規劃中，建設時間未定）
從坪山碧嶺出發的19號線，朝著東北方向延伸，終點抵達坑梓。與市區內多條線路重疊的便利相比，該線路將同規劃中的龍坪線一起填補坪山地鐵交通的空白。還將把坪山和坑梓串聯在一起，可更好地方便兩地居民出行。值得一提的是，該線路與位於坪山的原深圳東站（屬廈深鐵路）相距較近，將有力支撐這一深圳東部交通樞紐。
20號福永線
（規劃中，無縫接駁東莞地鐵，建設時間未定）
起點正好是羅寶線的終點——機場東，之後向西北延伸，有利於福永街道塘尾、橋頭等社區居民的出行。大空港特殊的地理位置，也決定了該線路不僅與尚未建成的機場線、沙井線有交集，重點是與連接深圳與茂名的深茂鐵路有交集。特別的是，東莞市的地鐵R2線也與深圳20號線無縫接駁，對於兩地交流更加便利。
21號
（傳說中的寶安快線，規劃和建設時間均沒有確切信息）
在南寶線改線引起的爭議過程中，寶安區軌道辦主任張聰傑表示：2014年，在區發改局的支持下，區軌道辦委託市軌道中心（市四期軌道規劃單位），結合寶安區的交通現狀做了一份《寶安區軌道交通規劃》。設計了一條寶安快線，在寶安區內設置有24個站點，以彌補11號線、6號線在寶安區站點較少的缺點；此外，該線路還能配合107國道市政化，只有道路改造和軌道交通齊頭並進，對周邊的經濟帶動才會有突飛猛進的效果。
「寶安快線還是只一個設想，暫時被列為地鐵21號線，區裡也正在力爭。」張聰傑稱，寶安現就此規劃正在與市交委溝通，希望由寶安區政府、市交委、前海管理局三個部門一起向市政府爭取，呼籲將寶安快線納入深圳市四期軌道規劃，能和地鐵12號線同期建設。
綜合各方面的規劃信息繪製的遠期規劃圖，應該是目前第一份20線方案的線路圖
1、未開通線路的表示色和站名並未完全按照規劃用色及用名。
2、港鐵和國鐵接駁線路都沒表示出，待後續完善。
整體預覽圖：
線路說明圖：
局部詳細圖：
寶安光明
寶安西鄉
寶安前海
南山蛇口
福田羅湖中心區
福田南山
南山龍華
光明龍華觀瀾
龍華坂田
坂田布吉
羅湖
平湖龍崗
布吉龍崗
鹽田羅湖
龍崗坪山
龍崗中心
坪山坑梓
坪山新區
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