關於臺灣的問題，我曾經寫下過《作為中國不可分割的一部分，臺灣是什麼時候納入中央王朝版圖的》《臺灣是不是明朝的疆域？朱元璋曾經將這裡設為不徵之國》《臺灣是如何納入到中國版圖的？清朝的貢獻不可磨滅》的文章進行介紹。不過，最近有明粉裝著看不見我的文章（實際上他們總是盯著我的文章），搬出什麼彭湖巡檢司、鄭成功甚至鄭和來證明臺灣明朝管轄著臺灣。因此，我決定重新寫下本文，專門來說說明朝是否管理過臺灣。注意，本文引用的史料較多，慎入。
一，關於彭湖巡檢司
許多明粉認為：明朝設置了彭湖巡檢司，因此臺灣島隸屬於明朝。我在這裡必須明確說道，彭湖巡檢司設置在彭湖島，不是設置在臺灣島。現在的主要爭議是彭湖巡檢司的管理範圍是否包括臺灣島？
首先，我們必須來了解下澎湖巡檢司是怎麼一回事。在南宋時期，澎湖被記載為「平湖」。南宋的泉州長官汪大猷派軍民屯戍澎湖，標誌著澎湖群島正式納入中國版圖。趙汝適的《諸蕃志》寫道：「泉有海島曰澎湖，隸晉江縣。當時的澎湖並不包括流求（臺灣）。《元史·琉求傳》說：「琉求在南海之東……彭湖諸島與琉求相對。」
元朝建立後，正式設置了澎湖巡檢司。為了招降琉求，忽必烈兩次派遣使團前往。第一次只到達澎湖就返回了，第二次不知道到達了何處，「禽生口一百三十餘人」而還。很顯然，元朝也未能管轄臺灣島。元朝末年的民間航海家汪大淵在《島夷志略》一書有對臺灣的記載，其中有「海外諸國蓋由此始」，也就是從流求開始，就進入了海外各國了。
譚其驤版的元朝版圖
明朝時期，繼承了元朝的澎湖巡檢司，不過到洪武五年（1372），就取消了。《皇明世法錄》記載：「我朝信國，以島中餘民，叛服難諶，故徙之以實內，湖中虛無人矣。」也就是說，朱元璋認為海上的百姓難以統治，於是將澎湖群島的百姓全部遷徙到內地，使得澎湖群島成為了荒島。朱元璋實行該政策，是為了配合海禁。
明朝將百姓遷徙走，海盜就高興了。澎湖群島等自此成為海盜的基地。到了明朝中期，澎湖群島的居民又開始增加，於是嘉靖四十二年（1563），重設澎湖巡檢司，但是很快又撤銷了。《臺灣府志》記載：「明嘉靖間，澎湖屬泉同安，設巡檢守之。旋以海天遙阻，棄之。」
譚其驤的明朝版圖也沒有畫入臺灣島
到了萬曆二十五年（1597），為防倭寇，又設澎湖遊兵。但是明朝對澎湖的管轄十分薄弱，福建巡撫黃承玄在《條議海防事宜疏》中寫道：「（澎湖遊兵）有守之名，無守之實矣。」天啟五年（1625），荷蘭入侵澎湖，明朝被迫增加軍隊，「天啟中，築城於澎湖，設遊擊一，把總二，統兵三千，築炮臺以守。」但是最終「彭湖撤兵移餉」（引用崇禎二年的聖旨），明朝還是放棄了澎湖。
從上文得知，明朝管理澎湖滿打滿算，也只有40年的時間。明朝就連澎湖都管不好，更別說臺灣島了。
二，明朝的小流求的關係
古代所謂的「流求」一般是將臺灣島和琉球群島並稱的。由於琉球群島地處「萬國津梁」之地，因此商業發達，在明朝之前就建立了三個國家。而臺灣島長期以來處於漫荒狀態。這也給中央王朝帶來了錯誤的判斷，如明朝認為琉球國更大，所以稱為「大流求」，將臺灣稱為「小流求國」。
朱元璋時期，頒布《皇明祖訓》，宣布將海外15個國家列為「不徵之國」，其中就包括「小流求國」和「大琉球國」。其中大琉球國，「朝貢不時，王子及陪臣之子，皆入太學讀書，禮待甚厚。」而小琉球國「不通往來，不曾朝貢」。也就是臺灣和明朝基本沒有政治聯繫。朱元璋認為「四方諸彝及南蠻小國，限山隔海，僻在一隅，得其力不足供給，得其民不足使令，吾子孫毋倚富強要戰功。」也就是讓後代子孫不要討伐這些國家，因為沒用。
的確，翻遍了明朝史料，也無法找出明朝對琉球用兵的記載。這說明朝歷代皇帝的確堅守了《皇明祖訓》的原則，另外也反映出，臺灣在明朝眼中就是「四方諸彝」，蠻荒之地。在農耕文明國家的眼裡，能夠種地的地方才是好地方，對海洋小國的並不感興趣。
三，東南海盜勢力以臺灣為基地
臺灣在近代以來的地位不斷顯得重要，這和西方殖民者的入侵以及海盜的開發是分不開的。臺灣雖然在明朝被稱為「小琉球國」，但實際上總體處於原始社會狀態，並沒有國家組織。明朝推行海禁後，東南沿海的「倭寇」（大部分是中國人）、海盜就以臺灣島作為落腳點。
《臺灣府志》記載最早在臺灣經營的是萬曆年間的海盜顏思齊。顏思齊本來是漳州海澄縣人，後來因為犯了殺人罪流亡日本，開始經營中日間的走私貿易（明朝嘉靖之後，中日之間的貿易始終是不合法的），淪為海盜。後來，他密謀在日本推翻德川幕府，遭到失敗，流亡臺灣北部。從此，他在中日都失去了立足點，於是只有在臺灣進行開發。他多次派遣船隻悄悄到福建招募移民，帶來了先進的生產技術、生產工具。他為臺灣的開發做出了重要的貢獻，被稱為「第一位開拓臺灣的先鋒」。
鄭芝龍
1626年，福建地區發生了嚴重的旱災，飢殍遍野。有一位叫做鄭芝龍的海盜就帶領招撫了泉州饑民數萬人赴臺拓墾。此舉完全違背了明朝的「海禁」，泉州的官員許心素主張聯合荷蘭東印度公司共同對付鄭芝龍，但東印度公司未允，於是鄭芝龍擊敗了福建軍隊，殺死許心素，從此在臺灣定居，投靠顏思齊。不過，後來鄭芝龍的勢力越來越大，逐漸成為了東南沿海的海盜頭目。
四，海盜集團和西方殖民者的角逐
在明朝的敵對勢力開發臺灣的時候，西方的殖民者也開始進入臺灣。最初是西班牙佔據了臺灣南部，隨後是荷蘭的到來。荷蘭能夠發現臺灣，這完全歸功於明朝。1624年，荷蘭攻佔了澎湖，以此作為遠東貿易的據點。之後，明朝派遣官員和荷蘭進行了交涉，福建的官員告訴荷蘭，在澎湖的東邊，有一個比澎湖更大的島，希望荷蘭放棄澎湖，攻佔這個島。這個島就是臺灣，在明朝末年被稱為「東番」。
中國使節向荷蘭人提議：荷蘭人如願放棄澎湖群島。而遷往臺灣，則可準其通商；該公使亦曾向我方提議，如我方願往臺灣，亦可同樣通商。——東印度公司檔案
明朝這是做了一個划算的買賣，也就是讓荷蘭去攻佔臺灣，幫助明朝除掉臺灣的海盜。但是對於中國來說，這確實是一個昏招。但是荷蘭最初並未聽取明朝的建議，於是發生料羅灣大海戰，這次海戰中，明朝以「兵船兩百艘，擁眾萬人之勢」對付荷蘭的軍艦十三艘，士兵九百餘名。最終明朝損失慘重，荷蘭也孤立無援。於是再次經過談判，荷蘭人撤退到臺灣。此後，荷蘭擊敗了西班牙，獨佔臺灣南部。
後來荷蘭的勢力不斷發展，直接威脅著鄭芝龍海盜集團，雙方多次發生了衝突。不過，初期，由於荷蘭的人數較少，鄭芝龍佔據優勢。但是隨著荷蘭人數的增加，鄭芝龍越來越感覺自己無立足之地了。因此，1628年，鄭芝龍表示以「剪除夷寇、剿平諸盜」，歸順了明朝，並且開始到福建發展勢力。1633年，鄭芝龍在金門海戰中擊敗了荷蘭，從此「海氛頗息，通販洋貨，皆用鄭氏旗號」 ，掌握了東海的貿易霸權。
鄭氏軍閥的勢力範圍
我們能說鄭芝龍歸順於明朝，就說明朝管轄了臺灣嗎？鄭芝龍歸順明朝只是表面的，實際上是利用明朝來發展自己的勢力。現在的鄭芝龍不僅是一個海盜，他還成為了地方的軍閥。這個軍閥就各大勢力之間搖擺，也從不屬於任何一大勢力。該軍閥對開發臺灣做出了巨大貢獻，但是如果長期任由其發展，則必定成為獨立的一國。
清朝設立的臺灣府
明朝滅亡後，鄭芝龍投降清朝，而臺灣也被荷蘭全部佔據。鄭芝龍的兒子鄭成功在福建發展勢力，利用「南明」旗號發動反清鬥爭。失敗後，鄭成功於1661年渡過海峽，以巨大的犧牲才奪回了臺灣，史稱「鄭成功收復臺灣」。注意，鄭成功收復臺灣，是收復其鄭氏的臺灣，鄭氏也是中國人，也可以說中國人收復臺灣。但是絕不能說是明朝收復臺灣，因為明朝早就滅亡了。就比如，民國倒臺後，國民黨殘餘勢力竄逃到了「金三角」，稱霸一方，能說中華民國佔據金三角嗎？
結語
從史料來看，明朝從未對臺灣用兵，臺灣也對明朝「不通往來，不曾朝貢」，可見不管是實際上，還是名義上，明朝都不曾擁有臺灣島。從法律上，朱元璋已經明確規定明朝歷代皇帝不允許進攻臺灣（小琉球國）。明朝設置的澎湖巡檢司只能管轄澎湖一帶，並且只存在了40年。因此，明朝並未管轄臺灣。
而被明朝打擊，與明朝為敵的海盜集團卻以臺灣為基地，進行移民，開發臺灣，使得臺灣開始成為中國的一部分。這些海盜集團在在抗擊西方殖民者中發揮了中流砥柱的作用。
後來，清朝滅鄭氏集團，設置臺灣府，這是中國歷史上首次在臺灣設置機構進行管轄。因此，清朝滅鄭氏，標誌著臺灣正式納入到了中國中央王朝的版圖。如果清朝不滅鄭氏，那麼鄭氏集團就會發展成為越南、朝鮮、琉球那樣的藩屬國，最終帶來的損失不可挽回。因此，清朝的歷史功績不可否定。