清關只有在履行各項義務，辦理海關申報、查驗、徵稅、放行等手續後，貨物才能放行，貨主或申報人才能提貨。同樣，載運進出口貨物的各種運輸工具進出境或轉運，也均需向海關申報，辦理海關手續，得到海關的許可。貨物在結關期間，不論是進口、出口或轉運，都是處在海關監管之下，不準自由流通。
流程：
確認發貨日期
確認訂單——確認貨物價格，貨量。
確認合同——確認好合同的成交條款，最終發貨量，貨物價格，最晚出運船期。
通知聯繫貨代
通知國內代理，聯繫國內貨代準備清關單證。
清關單證：B/L，發票，裝箱單，合同，原產地證，質檢證書，包裝聲明等（單證需根據具體的品名，進口國家等具體而定）
清關流程
一.換單——去貨代或船公司換籤D/O。（根據手中提單來確定是到何處換單。H B/L貨代提單M B/L船東提單）
二.電子申報——電腦預錄、審單、發送、與海關聯繫/放行。
三.報檢——電子申報放行後，憑報關單四聯中的一聯去商檢局辦理報價手續，出通關單或敲三檢章。
四.現場交接單——海關現場交接單
五.查驗——海關根據貨物申報品名的監管條件，與當日查驗概率給予查驗，如有查驗會開出查驗通知書
六.放行——海關放行有以下幾個步驟：
一次放行
開出查驗通知書或無查驗直接2次放行
查驗後，做關封后放行。
運輸
運輸前需注意是否商檢局開具衛生檢疫、動植物檢疫（簡稱動衛檢）查驗聯繫憑條。如有動衛檢查驗，則需提前半個工作日預約。動衛檢查驗必須去查，逃檢所產生的費用是RMB2-5萬之間或暫停其單位報檢資格。車隊需在港區排提貨計劃，如：港區計劃，理貨，放箱計劃等。一般情況是提前1個工作日 排計劃。
入庫.分銷
收貨人收到貨物後安排倉儲、分銷出運。將稅單送到稅務局抵扣增值稅。進口海關監管貨物則在其監管期限內不得轉讓，如需轉讓則需向海關再次申報。
申報：
出口貨物的發貨人在根據出口合同的規定，按時、按質、按量備齊出口貨物後，即應當向運輸公司辦理租船訂艙手續，準備向海關辦理報關手續，或委託專業（代理）報關公司辦理報關手續。
需要委託專業或代理報關企業向海關辦理申報手續的企業，在貨物出口之前，應在出口口岸就近向專業報關企業或代理報關企業辦理委託報關手續。接受委託的專業報關企業或代理報關企業要向委託單位收取正式的報關委託書，報關委託書以海關要求的格式為準。
準備好報關用的單證是保證出口貨物順利通關的基礎。一般情況下，報關應備單證除出口貨物報關單外，主要包括：託運單（即下貨紙）、發票一份、貿易合同一份、出口收匯核銷單及海關監管條件所涉及的各類證件。
申報應注意的問題：報關時限：報關時限是指貨物運到口岸後，法律規定發貨人或其代理人向海關報關的時間限制。出口貨物的報關時限限為裝貨的24小時以前。不需要徵稅費、查驗的貨物，自接受申報起1日內辦結通關手續。