福建醫科大學醫學技術與工程學院成立於2002年，前身為始建於1984年的醫學檢驗系，為全國第二批招生的醫學檢驗專業。學院堅持以培養高層次醫學技術應用型人才為主要辦學方向，以本科教育為主體，大力開展研究生教育，辦好成人教育和繼續教育，打造醫教研產用五位一體的學科體系。
學院現有3個專業學系（醫學檢驗系、眼視光學系、醫學影像技術學系），1個醫學技術實驗教學中心。設有四年制醫學檢驗技術、醫學影像技術和眼視光學以及二年制醫學檢驗高職專升本等4個本科專業，現有全日制普通本科在校生857名，畢業生均授予理學學士學位。擁有全國首批醫學技術一級學科碩士學位授權點，以及臨床檢驗診斷學（1993年）和眼科學（1998年）等2個臨床醫學二級學科碩士學位授權點。學院在省內15家三甲醫院建立專業實踐教學基地，依託實踐教學基地和臨床師資的強大力量，提升學生專業技能。
學院現有專兼職教師347人，其中教授、副教授196人，博士生導師11人,碩士生導師47人。享受國務院政府特殊津貼專家4人，省級高校教學名師1人，省級優秀專家1人，省科技創新領軍人才4人，福建省「百千萬人才工程」4人。近年來，專兼職教師共承擔國家、省、部及廳級科研項目60多項；獲福建省科技進步一等獎4項、二等獎5項、三等獎27項；獲福建省醫學科技一等獎3項、二等獎12項、三等獎13項；在國內外各級雜誌上發表論文700多篇。
學院始終以教育教學改革和提高人才培養質量為核心，不斷加強學科建設，並取得良好成績。學院醫學檢驗技術獲批福建省應用型學科建設項目；醫學檢驗專業獲批省級專業改革綜合試點、省級特色專業；醫學技術實驗教學中心、醫學檢驗技術實驗教學中心獲評省級實驗教學示範中心；醫學技術虛擬仿真實驗教學中心獲批省級虛擬仿真實驗教學中心；眼科學與視光學教學團隊獲評省級教學團隊；《臨床血液及血液檢驗》、《臨床免疫學和免疫學檢驗》2門課程榮獲省級精品課程。教學成果獲省級一等獎1項、二等獎2項，校級特等獎1項、一等獎3項、二等獎1項；大學生創新創業訓練項目百餘項。
學院與多個國家和地區的高校及知名專家教授建立了良好的學術交流機制。聘請美國康奈爾大學等多所海外院校的知名教授為學院客座教授，定期來學院交流講學。學院還與荷蘭自由大學、臺灣元培醫事科技大學、臺灣中山醫學大學、臺灣輔仁大學、香港大學等建立良好的交流合作關係，每年選送十餘名學生赴臺灣元培醫事科技大學交流學習。