M6A(RNA甲基化修飾)課題思路介紹及熱點方向分析

2021-02-07 外泌體之家

作為近年來CNS期刊的熱點和國自然的熱門,RNA的表觀遺傳學研究受到很高的重視,其中最具代表的是N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A),即發生在RNA分子腺嘌呤第6位氮原子上發生甲基化修飾。與m6A相關的論文發表數量近年來顯著升高,且以CNS期刊為代表的高分值文章比例非常高(圖1)。

圖1.m6A文獻發表數(Pubmed資料庫)

研究發現,作為基因轉錄及轉錄後調控的重要作用方式,m6A修飾參與調節生物體中多種生物學過程,與多種疾病發生、發育具有顯著相關。m6A在細胞加速mRNA代謝和翻譯,以及在細胞分化、胚胎發育和壓力應答等過程中起重要作用。m6A除了分布在mRNA中,也出現在很多非編碼RNA中,如:環狀RNA、LncRNA等。

國家自然基金支持情況既代表國家宏觀層面對學術研究的導向性,也可以反映出當前學術研究的熱點方向,我們以國家自然科學基金中標項目分析m6A甲基化研究。調查發現(圖2)在2009年-2016年間,以m6A甲基化研究的標書年均中標數量在3-6項左右,這一數字在2017年增長為22項,增長近4倍;而2018年,m6A甲基化中標項目激增至65項,比2017年又提高了近3倍;與2016年相比,2018年的增長倍數超過了10倍。同時,從中標金額角度來看,2016年中標金額為260萬元,到2017年則增長為1038萬,同樣增長了4倍;2018年的中標金額則達到了2915萬元,比2017年增長了近3倍。

在2年時間內可以達到國自然中標數以及中標金額均增長超過10倍,且可以預期未來其仍然會有進一步增長,這表明了m6A甲基化領域是一個增長迅速、增長勢頭強的新興領域。

圖2.m6A相關國自然中標數目(科學網資料庫)

從研究領域來講(圖3),從2009年到2018年間,m6A甲基化研究與腫瘤相關研究項目達到40項,佔所有m6A甲基化研究項目的47%;其次為遺傳學、分子生物學等基礎學科。這一學科比例分步也體現出m6A甲基化研究在腫瘤研究中的重要意義,也是我們公司選擇MeRIP-seq與RNA-seq數據整合分析在腫瘤相關研究的定位依據。

圖3.m6A與腫瘤相關國自然課題學科分類(科學網資料庫)

 

以上結果看著非常喜人,但是在具體的實施過程中,就會面對很多現實的問題需要取捨。比如:

1.哪些疾病或者研究方向可以設計與m6A修飾的相關研究?

2. 測序費用比較貴,怎麼才能做得更有性價比,更有延伸性?

3.m6A測序和實驗數據如何解讀?具體試驗分組該如何設置?測序後的實驗如何延伸和開展?

4.m6A可以和哪些研究手段進行結合分析?

5.最新的非編碼RNA中的m6A研究該如何開展等?

6. 除了常規的測序實驗之外,m6A研究還能如何開展?

需要了解以上信息,在具體實驗時才清楚如何設計課題,如何開展試驗。鑑於此我們特別邀請到在此方面經驗豐富的專家老師通過兩天的會議給您理清相關思路,補充相關知識。


本次課程主講老師劉老師來自中科院,長期專注於表觀遺傳學等方面研究,對m6A方向的科研思路以及最新研究動態熟悉掌握。從事相關科研課題設計工作多年,發表論文40餘篇,其中10分以上5篇,主持和參與國自然基金項目5項,其中m6A課題相關的4項。主講老師多次應邀為大學、醫院、科研單位進行相關主題講座指導,具有豐富的課題設計和執行經驗,並多次受邀在國際大會上發言,對m6A相關的RIP測序、涉及非編碼RNA的m6A調控機制等相關方向有深刻了解,且具有豐富講課經驗表達能力,本課程內容為原創設計屬於國內創新,通過兩天的課程一定能讓您對RNA表觀遺傳學方面的課題設計及研究執行有很好的理解。


通過整整兩天的學習,了解RNA甲基化修飾(主要是m6A)相關研究的實驗設計思路及具體注意事項,可以更加有效的進行m6A相關課題的研究;了解m6A最新研究進展,強調在非編碼RNA(miRNA和LncRNA)中的m6A調控關係;了解meRIP-seq測序的整合分析思路以及測序報告解讀;meRIP-seq測序後續實驗思路開展及課題延伸。

1. 了解m6A修飾相關研究的疾病類型及具體調控機制。

2. 了解meRIP-seq測序方法以及後續研究思路的延伸的。

3. 掌握m6A修飾相關國自然標書研究思路的總結及寫作重點。

時間安排

課程表

介紹

第一天

8:30~10:00

RNA甲基化的概念及研究的意義

RNA甲基化的概念及甲基化類型;

RNA甲基化的調控機制及生物學功能;

10:20~12:00

M6a相關方案設計方法

M6a甲基化的研究現狀;

常見研究思路及方案設計注意事項;

13:30~15:00

RIP測序及應用

測序技術流程介紹;

測序報告的導讀;

15:20~17:00

測序的後續延伸及數據整合

M6a測序後的項目延伸及多組學整合;

第二天

8:30~10:00

RNA甲基化項目國自然思路概述及標書分析

RNA甲基化相關國自然課題的介紹及趨勢統計;

國自然標書寫作思路介紹;

10:20~12:00

RNA甲基化高分思路延伸

MeRIP測序及RNA-seq整合分析;

非編碼RNA的甲基化分析(miRNA/lncRNA等)

13:30~15:00

案例解讀及思路分析

高分文獻思路示例及總結;

15:20~16:30

討論環節

討論及個性化問題答疑;

       劉老師作為公司技術部主管,為更好的推廣m6A修飾的技術,特此為大家開設小班化課程,5人開班,10人停收學員,保證每名學員有充分的時間和講師進行溝通。注重實戰和答疑,專注於讓每名學員得到質的提升,極大的區別於市場上其他同類的培訓機構。我們不幹講,不看視頻,不背理論,我們真正做到純實戰訓練和充分的互動答疑,我們的目標是您的100%滿意!

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開班時間:6.20-6.21

開班地點:線上直播課

報名費:2499/人(可開具發票,費用包含電子版材料)

優惠政策

1、提前報名及轉帳的,可以提前拿到學習材料,也可抵後續項目費

2、兩人成團報名,每人減100

3、三人成團報名,每人減200

4、參與培訓的老師,課程結束後還可獲得相應線上課程一套

報名信息

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exosomeyz@163.com

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  • 甲基化文獻分享
    m6A RNA 識別選擇性結合 m6A RNA 甲基化修飾的細胞質和細胞核被稱為結合蛋白。 該類蛋白質具有解讀 m6A 修飾信息並識別其功能信號的功能 。組蛋白修飾  :組蛋白的氨基末端(N-末端)可發生多種共價修飾,如乙醯化,甲基化,磷酸化,泛素化等,這些修飾通過影響組蛋白與DNA雙鏈的親和性,改變染色質的凝集狀態,影響DNA序列的轉錄因子與之結合,進而影響基因的轉錄。
  • 甲基化的一些基礎知識
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    N6-甲基腺嘌呤(m6A)是真核生物最常見和最豐富的一種修飾,佔甲基化修飾的80%以上。最近,他們和活體分析化學重點實驗室研究員汪銘課題組合作,首次實現了化學小分子對RNA表觀遺傳修飾的直接幹預。N6-甲基腺嘌呤(m6A)是真核生物最常見和最豐富的一種修飾,佔甲基化修飾的80%以上。m6A修飾廣泛參與調控mRNA的剪接、運輸、穩定性和翻譯效率等,並且與肥胖和腫瘤等多種生理功能異常及疾病相關。發展能夠直接與m6A修飾進行相互作用的小分子化合物,以此實現在細胞水平上特異性識別m6A修飾並且進行選擇性調控,更加精確地描繪RNA的修飾動態過程及其效應,具有十分重要的生物學意義和應用價值。
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