以色列西邊是埃及、東北部是敘利亞，這兩個阿拉伯國家都是以色列頭痛的，摩薩德沒少往這兩個國家派間諜。埃及還好說點，以色列自古以來就和埃及有著說不清的聯繫，猶太人在埃及也比較多，不稀奇；敘利亞就難搞定了，他們國家對外來人員審查特別厲害，無所不能的摩薩德也沒有辦法在敘利亞有效開展工作，除了伊萊·科恩以外。伊萊·科恩之所以成為以色列最成功的間諜，是他作為間諜居然結識了敘利亞的總統及眾多高層，這讓他得到大量無價的情報；但也正因為他結識了太多高層，註定了他被逮後不得不死的命運。
伊萊·科恩出生在埃及，年輕時因為參加過猶太復國主義青年組織，因為開展地下活動，結識激進組織的領導，在埃及坐過牢，好在他語言天賦好，能言善辯，再加上埃及不掌握證據，就把他放了。埃及待不下去，到他32歲時回舉家遷回以色列。回到以色列後，伊萊·科恩雖然有強烈的報國之心，並且智力過人、處事冷靜敏銳，但為了生活，不得不幹些諸如翻譯、會計這樣的工作，生活的平靜安定。1951年，以色列的間諜組織摩薩德正式成立，他們到處物色適合人做特工，伊萊·科恩進入了摩薩德的視線，因為伊萊·科恩會阿拉伯語、在埃及的阿拉伯世界生活了三十多年，參加過猶太復國主義青年組織，有強烈的愛國心，接受過基本的隱蔽活動訓練，這些條件仿佛就是為摩薩德特意準備的。
伊萊·科恩當然加入摩薩德，經過艱苦訓練，他成為一個合格的能執行特種任務的優秀的摩薩德特工：英俊瀟灑風度翩翩、會多國語言、冷靜敏捷智力過人。為了使用好伊萊·科恩，摩薩德精心設計了一套完美的方案：伊萊·科恩的身份是出生於貝魯特的敘利亞人，移居阿根廷的布宜諾斯艾利斯，現在是一個成功的商人。在阿根廷，這樣的敘利亞商人還是比較多得，伊萊·科恩到布宜諾斯艾利斯後，很快在敘利亞富商圈子裡打開局面，得到大家的信任，還結識了敘利亞武官哈菲茲·阿薩德，這人就是後來敘利亞的總統，還認識了一個在敘利亞有影響的叫阿爾赫申的人，就是這人幫他在大馬士革站穩腳跟的。
1962年，伊萊·科恩來到大馬士革，他帶著許多敘利亞商人的推薦信，再加上阿爾赫申的引薦，很快在大馬士革認識了許多重要人物，被敘利亞社會接納。他在敘利亞武裝部隊總參謀部對面租了房子，一面開展進出口貿易，一面進行自己的隱蔽工作，還時刻注意敘利亞軍隊參謀部的動靜。由於生意成功，為人謙遜熱情，伊萊·科恩結識的人越來越多，其中包括敘利亞新聞出版局局長和敘利亞突擊隊司令等厲害的政軍界人物，這讓他得到大量絕密情報；他甚至進入戒備森嚴的戈蘭高地，公開拍攝武器裝備；他還建議在工事堡壘邊種樹以遮蔽太陽，居然被敘利亞軍隊採納，後來以色列就是以這些樹為目標，炸毀戈蘭高地的；他還是第一個詳細知道敘利亞準備截斷以色列水源計劃的情報並傳回以色列；他還是提前一年準確告知摩薩德，敘利亞要進攻以色列，1963年3月，以色列早有防備，讓敘利亞大敗而歸；……
1963年6月27日，敘利亞復興社會黨掌握政權，哈菲茲·阿薩德當上總統，伊萊·科恩因為在阿根廷和哈菲茲結識，更是如魚得水，他也幫助哈菲茲解決了許多棘手的事，更的總統信任，成了總統的助手。這一時期伊萊·科恩的情報工作如同開掛了一樣，敘利亞在以色列面前沒有任何秘密。有傳言他快將擔任政府重要職務，比如部長、總參謀長之類。事實上，只要願意，伊萊·科恩隨時都可以擔任要職。但是，因為印度人的緣故，伊萊·科恩被發現了。
伊萊·科恩是通過發報的方式和摩薩德聯繫的，也許以前太順了，他發報的次數越來越多，還都集中在固定的時間，而離他住所不遠就是印度的大使館，印度人向敘利亞方面抱怨，他們總是在某一時段收聽收音機時，聲音不清楚，有幹擾。這引起了敘利亞安全部門的注意，經過秘密偵查，終於鎖定伊萊·科恩，伊萊·科恩被捕了。
摩薩德有個好傳統，就是不放棄任何一個人。雖然伊萊·科恩暴露了，也就是說從此伊萊·科恩作為特工將一錢不值，但以色列幾乎用了所有的資源來援救伊萊·科恩，他們發動了美歐各國總統、教皇、哈菲茲·阿薩德的救命恩人等向哈菲茲·阿薩德求情，希望保住伊萊·科恩的性命；以色列還在海法逮捕了為敘利亞搞諜報活動的5名敘利亞特工人員，以色列立即公布了他們的名字，並提出希望用他們5人再加上以前些逮捕並判了刑的一名敘利亞間諜來換取伊萊·科恩但敘利亞就是抓住科恩不放，並於1965年5月19日凌晨絞死了伊萊·科恩。實際上，正是因為伊萊·科恩認識了太多敘利亞高官，包括他們的總統，所以他必須死，要不然這些人還有什麼臉面在敘利亞繼續幹下去。
對於伊萊·科恩的遺體，說法眾多，有的說被冰凍在某個絕密地方，有的說在一個秘密的地方埋葬了，有的說其實1982年以色列尋找失蹤戰士的遺體，其中有一具從敘利亞帶回的棺材內裝的就有伊利·科恩的遺體。不過最可信的是根據以色列媒體的報導：伊利·科恩的遺體被埋藏在拉塔基亞省加爾達市附近的一個山洞裡，距離現任敘利亞總統巴沙爾·阿薩德的出生地不遠。