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導讀:NumPy是Python的基礎,更是數據科學的通用語言。
本文簡單介紹NumPy模塊的兩個基本對象ndarray、ufunc,介紹ndarray對象的幾種生成方法及如何存取其元素、如何操作矩陣或多維數組、如何進行數據合併與展平等。最後說明通用函數及廣播機制。
作者:吳茂貴,王冬,李濤,楊本法
NumPy為何如此重要?實際上Python本身含有列表(list)和數組(array),但對於大數據來說,這些結構有很多不足。因列表的元素可以是任何對象,因此列表中所保存的是對象的指針。這樣為了保存一個簡單的[1,2,3],都需要有3個指針和3個整數對象。
對於數值運算來說,這種結構顯然比較浪費內存和CPU計算時間。至於array對象,它直接保存數值,和C語言的一維數組比較類似。但是由於它不支持多維,也沒有各種運算函數,因此也不適合做數值運算。
NumPy(Numerical Python 的簡稱)的誕生彌補了這些不足,它提供了兩種基本的對象:ndarray(N-dimensional array object)和 ufunc(universal function object)。ndarray是存儲單一數據類型的多維數組,而ufunc則是能夠對數組進行處理的函數。
NumPy的主要特點:
ndarray,快速,節省空間的多維數組,提供數組化的算術運算和高級的廣播功能。
使用標準數學函數對整個數組的數據進行快速運算,而不需要編寫循環。
讀取/寫入磁碟上的陣列數據和操作存儲器映像文件的工具。
線性代數,隨機數生成,以及傅立葉變換的能力。
集成C、C++、Fortran代碼的工具。
在使用 NumPy 之前,需要先導入該模塊:
01 生成ndarray的幾種方式
NumPy封裝了一個新的數據類型ndarray,一個多維數組對象,該對象封裝了許多常用的數學運算函數,方便我們進行數據處理以及數據分析,那麼如何生成ndarray呢?這裡我們介紹生成ndarray的幾種方式,如從已有數據中創建;利用random創建;創建特殊多維數組;使用arange函數等。
1. 從已有數據中創建
直接對python的基礎數據類型(如列表、元組等)進行轉換來生成ndarray。
(1)將列錶轉換成ndarray
import numpy as np
list1 = [3.14,2.17,0,1,2]
nd1 = np.array(list1)
print(nd1)
print(type(nd1))
列印結果:
[ 3.14 2.17 0. 1. 2. ]
<class 'numpy.ndarray'>
(2)嵌套列表可以轉換成多維ndarray
import numpy as np
list2 = [[3.14,2.17,0,1,2],[1,2,3,4,5]]
nd2 = np.array(list2)
print(nd2)
print(type(nd2))
列印結果:
[[ 3.14 2.17 0. 1. 2. ]
[ 1. 2. 3. 4. 5. ]]
<class 'numpy.ndarray'>
如果把(1)和(2)中的列表換成元組也同樣適合。
2. 利用random模塊生成ndarray
在深度學習中,我們經常需要對一些變量進行初始化,適當的初始化能提高模型的性能。通常我們用隨機數生成模塊random來生成,當然random模塊又分為多種函數:
random生成0到1之間的隨機數;
uniform生成均勻分布隨機數;
randn生成標準正態的隨機數;
normal生成正態分布;
shuffle隨機打亂順序;
seed設置隨機數種子等。
下面我們列舉幾個簡單示例。
import numpy as np
nd5 = np.random.random([3,3])
print(nd5)
print(type(nd5))
列印結果:
[[ 0.88900951 0.47818541 0.91813526]
[ 0.48329167 0.63730656 0.14301479]
[ 0.9843789 0.99257093 0.24003961]]
<class 'numpy.ndarray'>
生成一個隨機種子,對生成的隨機數打亂。
import numpy as np
np.random.seed(123)
nd5_1 = np.random.randn(2,3)
print(nd5_1)
np.random.shuffle(nd5_1)
print("隨機打亂後數據")
print(nd5_1)
print(type(nd5_1))
列印結果:
[[-1.0856306 0.99734545 0.2829785 ]
[-1.50629471 -0.57860025 1.65143654]]
隨機打亂後數據為:
[[-1.50629471 -0.57860025 1.65143654]
[-1.0856306 0.99734545 0.2829785 ]]
<class 'numpy.ndarray'>
3. 創建特定形狀的多維數組
數據初始化時,有時需要生成一些特殊矩陣,如0或1的數組或矩陣,這時我們可以利用np.zeros、np.ones、np.diag來實現,下面我們通過幾個示例來說明。
import numpy as np
#生成全是0的3x3矩陣
nd6 = np.zeros([3,3])
#生成全是1的3x3矩陣
nd7 = np.ones([3,3])
#生成3階的單位矩陣
nd8= np.eye(3)
#生成3階對角矩陣
print (np.diag([1, 2, 3]))
我們還可以把生成的數據保存到磁碟,然後從磁碟讀取。
import numpy as np
nd9 = np.random.random([5,5])
np.savetxt(X=nd9,fname='./test2.txt')
nd10 = np.loadtxt('./test2.txt')
4. 利用arange函數
arange是numpy模塊中的函數,其格式為:arange([start,] stop[, step,], dtype=None)。根據start與stop指定的範圍,以及step設定的步長,生成一個 ndarray,其中start默認為0,步長step可為小數。
import numpy as np
print(np.arange(10))
print(np.arange(0,10))
print(np.arange(1, 4,0.5))
print(np.arange(9, -1, -1))
02 存取元素
上節我們介紹了生成ndarray的幾種方法,數據生成後,如何讀取我們需要的數據?這節我們介紹幾種讀取數據的方法。
import numpy as np
np.random.seed(2018)
nd11 = np.random.random([10])
#獲取指定位置的數據,獲取第4個元素
nd11[3]
#截取一段數據
nd11[3:6]
#截取固定間隔數據
nd11[1:6:2]
#倒序取數
nd11[::-2]
#截取一個多維數組的一個區域內數據
nd12=np.arange(25).reshape([5,5])
nd12[1:3,1:3]
#截取一個多維數組中,數值在一個值域之內的數據
nd12[(nd12>3)&(nd12<10)]
#截取多維數組中,指定的行,如讀取第2,3行
nd12[[1,2]] #或nd12[1:3,:]
##截取多維數組中,指定的列,如讀取第2,3列
nd12[:,1:3]
如果你對上面這些獲取方式還不是很清楚,沒關係,下面我們通過圖形的方式說明如何獲取多維數組中的元素,如圖1-1所示,左邊為表達式,右邊為對應獲取元素。
▲圖1-1 獲取多維數組中的元素
獲取數組中的部分元素除通過指定索引標籤外,還可以使用一些函數來實現,如通過random.choice函數從指定的樣本中進行隨機抽取數據。
import numpy as np
from numpy import random as nr
a=np.arange(1,25,dtype=float)
c1=nr.choice(a,size=(3,4)) #size指定輸出數組形狀
c2=nr.choice(a,size=(3,4),replace=False) #replace預設為True,即可重複抽取
#下式中參數p指定每個元素對應的抽取概率,默認為每個元素被抽取的概率相同
c3=nr.choice(a,size=(3,4),p=a / np.sum(a))
print("隨機可重複抽取")
print(c1)
print("隨機但不重複抽取")
print(c2)
print("隨機但按制度概率抽取")
print(c3)
列印結果:
隨機可重複抽取
[[ 7. 22. 19. 21.]
[ 7. 5. 5. 5.]
[ 7. 9. 22. 12.]]
隨機但不重複抽取
[[ 21. 9. 15. 4.]
[ 23. 2. 3. 7.]
[ 13. 5. 6. 1.]]
隨機但按制度概率抽取
[[ 15. 19. 24. 8.]
[ 5. 22. 5. 14.]
[ 3. 22. 13. 17.]]
03 矩陣操作
深度學習中經常涉及多維數組或矩陣的運算,正好NumPy模塊提供了許多相關的計算方法,下面介紹一些常用的方法。
import numpy as np
nd14=np.arange(9).reshape([3,3])
#矩陣轉置
np.transpose(nd14)
#矩陣乘法運算
a=np.arange(12).reshape([3,4])
b=np.arange(8).reshape([4,2])
a.dot(b)
#求矩陣的跡
a.trace()
#計算矩陣行列式
np.linalg.det(nd14)
#計算逆矩陣
c=np.random.random([3,3])
np.linalg.solve(c,np.eye(3))
上面介紹的幾種方法是numpy.linalg模塊中的函數,numpy.linalg模塊中的函數是滿足行業標準級的Fortran庫。
numpy.linalg中常用函數:
04 數據合併與展平
在機器學習或深度學習中,會經常遇到需要把多個向量或矩陣按某軸方向進行合併的情況,也會遇到展平的情況,如在卷積或循環神經網絡中,在全連接層之前,需要把矩陣展平。這節介紹幾種數據合併和展平的方法。
1. 合併一維數組
import numpy as np
a=np.array([1,2,3])
b=np.array([4,5,6])
c=np.append(a,b)
print(c)
#或利用concatenate
d=np.concatenate([a,b])
print(d)
列印結果:
[1 2 3 4 5 6]
[1 2 3 4 5 6]
2. 多維數組的合併
import numpy as np
a=np.arange(4).reshape(2,2)
b=np.arange(4).reshape(2,2)
#按行合併
c=np.append(a,b,axis=0)
print(c)
print("合併後數據維度",c.shape)
#按列合併
d=np.append(a,b,axis=1)
print("按列合併結果:")
print(d)
print("合併後數據維度",d.shape)
列印結果:
[[0 1]
[2 3]
[0 1]
[2 3]]
合併後數據維度 (4, 2)
按列合併結果:
[[0 1 0 1]
[2 3 2 3]]
合併後數據維度 (2, 4)
3. 矩陣展平
import numpy as np
nd15=np.arange(6).reshape(2,-1)
print(nd15)
#按照列優先,展平。
print("按列優先,展平")
print(nd15.ravel('F'))
#按照行優先,展平。
print("按行優先,展平")
print(nd15.ravel())
列印結果:
[[0 1 2]
[3 4 5]]
按列優先,展平
[0 3 1 4 2 5]
按行優先,展平
[0 1 2 3 4 5]
05 通用函數
NumPy提供了兩種基本的對象,即ndarray和ufunc對象。前面我們對ndarray做了簡單介紹,本節將介紹它的另一個對象ufunc。
ufunc(通用函數)是universal function的縮寫,它是一種能對數組的每個元素進行操作的函數。許多ufunc函數都是在C語言級別實現的,因此它們的計算速度非常快。
此外,功能比math模塊中的函數更靈活。math模塊的輸入一般是標量,但NumPy中的函數可以是向量或矩陣,而利用向量或矩陣可以避免循環語句,這點在機器學習、深度學習中經常使用。以下為NumPy中的常用幾個通用函數:
1. 使用math與numpy函數性能比較
import time
import math
import numpy as np
x = [i * 0.001 for i in np.arange(1000000)]
start = time.clock()
for i, t in enumerate(x):
x[i] = math.sin(t)
print ("math.sin:", time.clock() - start )
x = [i * 0.001 for i in np.arange(1000000)]
x = np.array(x)
start = time.clock()
np.sin(x)
print ("numpy.sin:", time.clock() - start )
列印結果:
math.sin: 0.5169950000000005
numpy.sin: 0.05381199999999886
由此可見,numpy.sin比math.sin快近10倍。
2. 使用循環與向量運算比較
充分使用Python的NumPy庫中的內建函數(built-in function),實現計算的向量化,可大大提高運行速度。NumPy庫中的內建函數使用了SIMD指令。例如下面所示在Python中使用向量化要比使用循環計算速度快得多。
import time
import numpy as np
x1 = np.random.rand(1000000)
x2 = np.random.rand(1000000)
##使用循環計算向量點積
tic = time.process_time()
dot = 0
for i in range(len(x1)):
dot+= x1[i]*x2[i]
toc = time.process_time()
print ("dot = " + str(dot) + "\n for loop Computation time = " + str(1000*(toc - tic)) + "ms")
##使用numpy函數求點積
tic = time.process_time()
dot = 0
dot = np.dot(x1,x2)
toc = time.process_time()
print ("dot = " + str(dot) + "\n verctor version---- Computation time = " + str(1000*(toc - tic)) + "ms")
列印結果:
dot = 250215.601995
for loop Computation time = 798.3389819999998ms
dot = 250215.601995
verctor version---- Computation time = 1.885051999999554ms
從程序運行結果上來看,該例子使用for循環的運行時間是使用向量運算的運行時間的約400倍。因此,深度學習算法中,一般都使用向量化矩陣運算。
06 廣播機制
廣播機制(Broadcasting)的功能是為了方便不同shape的數組(NumPy庫的核心數據結構)進行數學運算。廣播提供了一種向量化數組操作的方法,以便在C中而不是在Python中進行循環,這通常會帶來更高效的算法實現。廣播的兼容原則為:
以下通過實例來具體說明。
import numpy as np
a=np.arange(10)
b=np.arange(10)
#兩個shape相同的數組相加
print(a+b)
#一個數組與標量相加
print(a+3)
#兩個向量相乘
print(a*b)
#多維數組之間的運算
c=np.arange(10).reshape([5,2])
d=np.arange(2).reshape([1,2])
#首先將d數組進行複製擴充為[5,2],如何複製請參考圖1-2,然後相加。
print(c+d)
▲圖1-2 NumPy多維數組相加
列印結果:
[ 0 2 4 6 8 10 12 14 16 18]
[ 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12]
[ 0 1 4 9 16 25 36 49 64 81]
[[ 0 2]
[ 2 4]
[ 4 6]
[ 6 8]
[ 8 10]]
有時為了保證矩陣運算正確,我們可以使用reshape()函數來變更矩陣的維度。
07 小結
閱讀完本文,你已get到如下技能:
√ 如何生成NumPy的ndarray的幾種方式。
√ 如何存取元素。
√ 如何操作矩陣。
√ 如何合併或拆分數據。
√ NumPy的通用函數。
√ NumPy的廣播機制。
如果想進一步了解NumPy,大家可參考:
http://www.numpy.org/
關於作者:吳茂貴,BI和大數據專家,就職於中國外匯交易中心,在BI、數據挖掘與分析、數據倉庫、機器學習等領域有超過20年的工作經驗,在Spark機器學習、TensorFlow深度學習領域大量的實踐經驗。
王冬,任職於博世(中國)投資有限公司,負責Bosch企業BI及工業4.0相關大數據和數據挖掘項目。對機器學習、人工智慧有多年實踐經驗。
李濤,參與過多個人工智慧項目,如研究開發服務機器人、無人售後店等項目。熟悉python、caffe、TensorFlow等,對深度學習、尤其對計算機視覺方面有較深理解。
楊本法,高級算法工程師,在機器學習、文本挖掘、可視化等領域有多年實踐經驗。熟悉Hadoop、Spark生態圈的相關技術,對Python有豐富的實戰經驗。
本文摘編自《Python深度學習:基於TensorFlow》,經出版方授權發布。
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(*本文僅代表作者觀點,轉載請聯繫原作者)
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