在進行MySQL的優化之前，必須要了解的就是MySQL的查詢過程，很多查詢優化工作實際上就是遵循一些原則，讓MySQL的優化器能夠按照預想的合理方式運行而已。
圖-MySQL查詢過程
註：優化有風險，涉足需謹慎
優化不總是對一個單純的環境進行，還很可能是一個複雜的已投產的系統；
優化手段本來就有很大的風險，只不過你沒能力意識到和預見到；
任何的技術可以解決一個問題，但必然存在帶來一個問題的風險；
對於優化來說解決問題而帶來的問題，控制在可接受的範圍內才是有成果；
保持現狀或出現更差的情況都是失敗！
所以優化工作，是由業務需要驅使的！
在進行資料庫優化時，應由資料庫管理員、業務部門代表、應用程式架構師、應用程式設計人員、應用程式開發人員、硬體及系統管理員、存儲管理員等，業務相關人員共同參與。
在資料庫優化上有兩個主要方面：即安全與性能。
存儲、主機和作業系統方面：
主機架構穩定性；
I/O規劃及配置；
Swap交換分區；
OS內核參數和網絡問題。
應用程式方面：
應用程式穩定性；
SQL語句性能；
串行訪問資源；
性能欠佳會話管理；
這個應用適不適合用MySQL。
資料庫優化方面：
說明：不管是設計系統、定位問題還是優化，都可以按照這個順序執行。
資料庫優化維度有四個：
硬體、系統配置、資料庫表結構、SQL及索引。
優化選擇：
檢查問題常用工具：
1）MySQL
2）msyqladmin：MySQL客戶端，可進行管理操作
3）mysqlshow：功能強大的查看shell命令
4）show [SESSION | GLOBAL] variables：查看資料庫參數信息
5）SHOW [SESSION | GLOBAL] STATUS：查看資料庫的狀態信息
6）information_schema：獲取元數據的方法
7）SHOW ENGINE INNODB STATUS：Innodb引擎的所有狀態
8）SHOW PROCESSLIST：查看當前所有連接session狀態
9）explain：獲取查詢語句的執行計劃
10）show index：查看表的索引信息
11）slow-log：記錄慢查詢語句
12）mysqldumpslow：分析slowlog文件的
不常用但好用的工具：
1）Zabbix：監控主機、系統、資料庫（部署zabbix監控平臺）
2）pt-query-digest：分析慢日誌
3）MySQL slap：分析慢日誌
4）sysbench：壓力測試工具
5）MySQL profiling：統計資料庫整體狀態工具
6）Performance Schema：MySQL性能狀態統計的數據
7）workbench：管理、備份、監控、分析、優化工具（比較費資源）
關於Zabbix參考：
http://www.cnblogs.com/clsn/p/7885990.html
一般應急調優的思路：針對突然的業務辦理卡頓，無法進行正常的業務處理，需要立馬解決的場景。
1）show processlist；
2）explain select id ,name from stu where name='clsn'; # ALL id name age sex；
select id,name from stu where id=2-1 函數 結果集>30；show index from table；
3）通過執行計劃判斷，索引問題（有沒有、合不合理）或者語句本身問題；
4）show status like '%lock%'; # 查詢鎖狀態
kill SESSION_ID; # 殺掉有問題的session。
常規調優思路：針對業務周期性的卡頓，例如在每天10-11點業務特別慢，但是還能夠使用，過了這段時間就好了。
1）查看slowlog，分析slowlog，分析出查詢慢的語句；
2）按照一定優先級，一個一個排查所有慢語句；
3）分析top SQL，進行explain調試，查看語句執行時間；
4）調整索引或語句本身。
Cpu方面：
vmstat、sar top、htop、nmon、mpstat；內存：
IO設備（磁碟、網絡）：
iostat、ss、netstat、iptraf、iftop、lsof；vmstat命令說明：
1）Procs：r顯示有多少進程正在等待CPU時間。b顯示處於不可中斷的休眠的進程數量。在等待I/O。
2）Memory：swpd顯示被交換到磁碟的數據塊的數量。未被使用的數據塊，用戶緩衝數據塊，用於作業系統的數據塊的數量。
3）Swap：作業系統每秒從磁碟上交換到內存和從內存交換到磁碟的數據塊的數量。s1和s0最好是0。
4）Io：每秒從設備中讀入b1的寫入到設備b0的數據塊的數量。反映了磁碟I/O。
5）System：顯示了每秒發生中斷的數量（in）和上下文交換（cs）的數量。
6）Cpu：顯示用於運行用戶代碼，系統代碼，空閒，等待I/O的Cpu時間。
iostat命令說明：
實例命令：iostat -dk 1 5
iostat -d -k -x 5 （查看設備使用率（%util）和響應時間（await））
1）tps：該設備每秒的傳輸次數。「一次傳輸」意思是「一次I/O請求」。多個邏輯請求可能會被合併為「一次I/O請求」。
2）iops ：硬體出廠的時候，廠家定義的一個每秒最大的IO次數
3）"一次傳輸"請求的大小是未知的。
4）kB_read/s：每秒從設備（drive expressed）讀取的數據量；
5）KB_wrtn/s：每秒向設備（drive expressed）寫入的數據量；
6）kB_read：讀取的總數據量；
7）kB_wrtn：寫入的總數量數據量；這些單位都為Kilobytes。
你認為到底負載高好，還是低好呢？在實際的生產中，一般認為Cpu只要不超過90%都沒什麼問題。
當然不排除下面這些特殊情況：
Cpu負載高，IO負載低：
1）內存不夠；
2）磁碟性能差；
3）SQL問題--->去資料庫層，進一步排查SQL 問題；
4）IO出問題了（磁碟到臨界了、raid設計不好、raid降級、鎖、在單位時間內tps過高）；
5）tps過高：大量的小數據IO、大量的全表掃描。
IO負載高，Cpu負載低：
1）大量小的IO寫操作：
autocommit，產生大量小IO；IO/PS，磁碟的一個定值，硬體出廠的時候，廠家定義的一個每秒最大的IO次數。
2）大量大的IO 寫操作：SQL問題的機率比較大
IO和cpu負載都很高：
定位問題點吮吸：硬體-->系統-->應用-->資料庫-->架構（高可用、讀寫分離、分庫分表）。
處理方向：明確優化目標、性能和安全的折中、防患未然。
主機方面：
根據資料庫類型，主機CPU選擇、內存容量選擇、磁碟選擇：
1）平衡內存和磁碟資源；
2）隨機的I/O和順序的I/O；
3）主機 RAID卡的BBU（Battery Backup Unit）關閉。
CPU的選擇：
CPU的兩個關鍵因素：核數、主頻
根據不同的業務類型進行選擇：
1）CPU密集型：計算比較多，OLTP - 主頻很高的cpu、核數還要多
2）IO密集型：查詢比較，OLAP - 核數要多，主頻不一定高的
內存的選擇：
OLAP類型資料庫，需要更多內存，和數據獲取量級有關。
OLTP類型數據一般內存是Cpu核心數量的2倍到4倍，沒有最佳實踐。
存儲方面：
1）根據存儲數據種類的不同，選擇不同的存儲設備；
2）配置合理的RAID級別（raid5、raid10、熱備盤）；
3）對與作業系統來講，不需要太特殊的選擇，最好做好冗餘（raid1）（ssd、sas、sata）。
4）raid卡：
主機raid卡選擇：
實現作業系統磁碟的冗餘（raid1）；
平衡內存和磁碟資源；
隨機的I/O和順序的I/O；
主機raid卡的BBU（Battery Backup Unit）要關閉。
網絡設備方面：
使用流量支持更高的網絡設備（交換機、路由器、網線、網卡、HBA卡）注意：以上這些規劃應該在初始設計系統時就應該考慮好。
1）物理狀態燈
2）自帶管理設備：遠程控制卡（FENCE設備：ipmi ilo idarc）、開關機、硬體監控。
3）第三方的監控軟體、設備（snmp、agent）對物理設施進行監控。
4）存儲設備：自帶的監控平臺。EMC2（hp收購了）、 日立（hds）、IBM低端OEM hds、高端存儲是自己技術，華為存儲。
Cpu：
內存：
SWAP：
MySQL儘量避免使用swap。
阿里雲的伺服器中默認swap為0。
IO ：
raid、no lvm、ext4或xfs、ssd、IO調度策略。
Swap調整(不使用swap分區)
/proc/sys/vm/swappiness的內容改成0（臨時），/etc/sysctl. conf上添加vm.swappiness=0（永久）
這個參數決定了Linux是傾向於使用swap，還是傾向於釋放文件系統cache。在內存緊張的情況下，數值越低越傾向於釋放文件系統cache。
當然，這個參數只能減少使用swap的概率，並不能避免Linux使用swap。
修改MySQL的配置參數innodb_flush_ method，開啟O_DIRECT模式：
這種情況下，InnoDB的buffer pool會直接繞過文件系統cache來訪問磁碟，但是redo log依舊會使用文件系統cache。
值得注意的是，Redo log是覆寫模式的，即使使用了文件系統的cache，也不會佔用太多。
IO調度策略：
#echo deadline>/sys/block/sda/queue/scheduler 臨時修改為deadline
永久修改
vi /boot/grub/grub.conf
更改到如下內容:
kernel /boot/vmlinuz-2.6.18-8.el5 ro root=LABEL=/ elevator=deadline rhgb quiet
Linux系統內核參數優化：
vim/etc/sysctl.conf
net.ipv4.ip_local_port_range = 1024 65535：# 用戶埠範圍
net.ipv4.tcp_max_syn_backlog = 4096
net.ipv4.tcp_fin_timeout = 30
fs.file-max=65535：# 系統最大文件句柄，控制的是能打開文件最大數量
用戶限制參數（MySQL可以不設置以下配置）：
vim/etc/security/limits.conf
* soft nproc 65535
* hard nproc 65535
* soft nofile 65535
* hard nofile 65535
業務應用和資料庫應用獨立；
防火牆：iptables、selinux等其他無用服務（關閉）：
chkconfig --level 23456 acpid off
chkconfig --level 23456 anacron off
chkconfig --level 23456 autofs off
chkconfig --level 23456 avahi-daemon off
chkconfig --level 23456 bluetooth off
chkconfig --level 23456 cups off
chkconfig --level 23456 firstboot off
chkconfig --level 23456 haldaemon off
chkconfig --level 23456 hplip off
chkconfig --level 23456 ip6tables off
chkconfig --level 23456 iptables off
chkconfig --level 23456 isdn off
chkconfig --level 23456 pcscd off
chkconfig --level 23456 sendmail off
chkconfig --level 23456 yum-updatesd off
安裝圖形界面的伺服器不要啟動圖形界面runlevel 3。
另外，思考將來我們的業務是否真的需要MySQL，還是使用其他種類的資料庫。用資料庫的最高境界就是不用資料庫。
SQL優化方向：執行計劃、索引、SQL改寫。
架構優化方向：高可用架構、高性能架構、分庫分表。
調整
實例整體（高級優化，擴展）：
thread_concurrency：# 並發線程數量個數
sort_buffer_size：# 排序緩存
read_buffer_size：# 順序讀取緩存
read_rnd_buffer_size：# 隨機讀取緩存
key_buffer_size：# 索引緩存
thread_cache_size：# (1G—>8, 2G—>16, 3G—>32, >3G—>64)
連接層（基礎優化）
設置合理的連接客戶和連接方式：
max_connections # 最大連接數，看交易筆數設置
max_connect_errors # 最大錯誤連接數，能大則大
connect_timeout # 連接超時
max_user_connections # 最大用戶連接數
skip-name-resolve # 跳過域名解析
wait_timeout # 等待超時
back_log # 可以在堆棧中的連接數量
SQL層（基礎優化）
query_cache_size：查詢緩存 >>> OLAP類型資料庫,需要重點加大此內存緩存，但是一般不會超過GB。
對於經常被修改的數據，緩存會立馬失效。
我們可以實用內存資料庫（redis、memecache），替代他的功能。
default-storage-engine
innodb_buffer_pool_size # 沒有固定大小，50%測試值，看看情況再微調。但是儘量設置不要超過物理內存70%
innodb_file_per_table=(1,0)
innodb_flush_log_at_trx_commit=(0,1,2) # 1是最安全的，0是性能最高，2折中
binlog_sync
Innodb_flush_method=(O_DIRECT, fdatasync)
innodb_log_buffer_size # 100M以下
innodb_log_file_size # 100M 以下
innodb_log_files_in_group # 5個成員以下,一般2-3個夠用（iblogfile0-N）
innodb_max_dirty_pages_pct # 達到百分之75的時候刷寫 內存髒頁到磁碟。
log_bin
max_binlog_cache_size # 可以不設置
max_binlog_size # 可以不設置
innodb_additional_mem_pool_size #小於2G內存的機器，推薦值是20M。32G內存以上100M