胺基酸結構的記憶方法

2021-03-01 生醫小R

這篇文章改編自我之前在知乎上「有沒有什麼便於記憶胺基酸結構的好方法？」的回答，原答案連結如下：https://www.zhihu.com/question/386476057/answer/1140941444

首先你得把胺基酸的分類給記住，比如哪些是非極性、極性、酸性、鹼性，還有芳香族，這些東西包括三字母縮寫，也沒啥好辦法，東西也不多，強記也不難

以下是胺基酸的分類表（出自Lehninger Principles of Biochemistry, 7e）：

然後就是記結構

甘氨酸(Glycine, Gly, G)是最簡單的胺基酸，就可以想到R基就是一個氫原子

甘氨酸

丙氨酸(Alanine, Ala, A)，名稱裡面就有一個「丙」字，說明是有3個碳原子，除去羧基碳和α碳，R基就是一個比較簡單的基團——甲基

丙氨酸

纈氨酸(Valine, Val, V)R基上有一個碳然後分出兩個甲基，強記一下吧

纈氨酸

亮氨酸(Leucine, Leu, L)和異亮氨酸(Isoleucine, Ile, I)，比纈氨酸多一個碳，二者又是同分異構體，聯繫起來記憶比較容易，注意側鏈和分支的位置

亮氨酸

異亮氨酸

脯氨酸(Proline, Pro, P)，唯一一個亞胺基酸，所以N是以亞氨基的形式存在，然後有一個五元環，不算難記

脯氨酸

甲硫氨酸(Methionine, Met, M)含有硫元素，名稱中含有「甲硫」，可以聯想到硫原子上伸出一個甲基

甲硫氨酸

絲氨酸(Serine, Ser, S)、蘇氨酸(Threonine, Thr, T)和酪氨酸(Tyrosine, Tyr, Y)，是蛋白質磷酸化的常見位點，可以聯想到三個含有羥基的胺基酸，特別提一下酪氨酸，是芳香族胺基酸，也可以記成苯丙氨酸β碳連接苯環的對位上氫原子替換成羥基

絲氨酸

蘇氨酸

酪氨酸

半胱氨酸(Cysteine, Cys, C)就是絲氨酸羥基替換成巰基，聯繫含硫胺基酸和二硫鍵來記憶

半胱氨酸

兩個酸性胺基酸——天冬氨酸(Aspartic acid, Asp, A)和穀氨酸(Glutamic acid, Glu, E)，都含有羧基，可以聯繫三羧酸循環、尿素循環和胺基酸代謝來記憶：天冬氨酸轉氨基作用生成蘋果酸，穀氨酸轉氨基作用生成α-酮戊二酸，就可以聯想到天冬氨酸有4個碳原子，而穀氨酸有5個碳原子

天冬氨酸

穀氨酸

從天冬氨酸和穀氨酸能聯想到天冬醯胺(Asparagine, Asn, N)和穀氨醯胺(Glutamine, Gln, Q)，就是R基上的羧基被醯胺基取代

天冬醯胺

穀氨醯胺

三個鹼性胺基酸是我認為最難記的三個，三個胺基酸的R基上都含有氨基，所以呈鹼性，其中賴氨酸(Lysine, K)結構相對最簡單，精氨酸(Arginine, Arg, R)含有胍基，組氨酸(Histidine, His, H)含有咪唑基，至於碳原子的情況還得死記硬背……

賴氨酸

精氨酸

組氨酸

苯丙氨酸(Phenylalanine, Phe, F)，顧名思義，丙氨酸甲基上的一個氫原子被苯基取代，根據苯丙氨酸就可以推出酪氨酸

苯丙氨酸

色氨酸(Tryptophan, Trp, W)可以聯想到植物激素吲哚乙酸，吲哚乙酸的合成前體是色氨酸，二者都含有吲哚基

色氨酸

還有兩種不常見的蛋白質胺基酸：

硒代半胱氨酸(Selenocysteine, Sec, U)，顧名思義，就是半胱氨酸的硫原子被替換成硒原子，也可以理解成絲氨酸羥基上氧原子被替換成硒原子

硒代半胱氨酸

吡咯賴氨酸(Pyrrolysine, Pyl, O)不是很常見，結構也比較複雜，反正我是沒記住……

吡咯賴氨酸

以上說的都是些技巧，對記憶會有一定幫助，但是仍逃不過部分死記硬背

相關焦點

  • 基本胺基酸的一些基本知識:結構、特點與記憶方法
    最近總看到一些記憶胺基酸的諧音口訣，甚至有人編了一些小故事。我一直認為，這不是最好的方法，理解基礎上的記憶總是勝過死記硬背，諧音故事聽多了，也容易搞混。所以，在這裡寫出我對基本胺基酸名稱、功能等方面的一些理解，應該有助於對胺基酸的學習和記憶。
  • 技巧 | 想快速記憶20種胺基酸縮寫,結構,分類等,這篇文章就夠了!
    關於胺基酸，學生競的小夥伴「又愛又恨」，「愛」是因為它是高頻考點，準確記憶後能夠拿下不少分，「恨」的也因為它是高頻考點，記憶起來又難又麻煩。今天質心姐姐給大家匯總了20種胺基酸縮寫，結構，特性，記憶口訣，供大家參考~體內20種胺基酸按理化性質可分為4組：①、非極性、疏水性胺基酸：甘氨酸、丙氨酸、纈氨酸、亮氨酸、異亮氨酸、苯丙氨酸和脯氨酸。
  • 【倒計時44天】組成蛋白質的20種胺基酸的化學結構和分類
    上期答案：【2006-23，生化，A型題】下列哪種胺基酸體內不能合成，必需靠食物供給：AA．纈氨酸半胱氨酸D．組氨酸E．絲氨酸 題目解析考查要點：組成蛋白質的20種胺基酸的化學結構和分類【2014年西醫綜合大綱「生物化學部分（一）生物大分子的結構和功能」中的第1個知識點】
  • 2020年軍隊文職考試專業科目:胺基酸分類的口訣記憶方法
    2020年軍隊文職考試專業科目：胺基酸分類的口訣記憶方法 軍隊文職專業科目是考試的一項內容，甘肅中公教育為考生們匯總了軍隊文職人員備考資料相關的複習內容，以供大家參考學習，助力考生備考軍隊文職考試。
  • 2020軍隊文職醫學備考:胺基酸分類的口訣記憶方法
    2020軍隊文職醫學備考：胺基酸分類的口訣記憶方法 2020-05-13 17:20:24| 福建軍轉網
  • 2019年度中考生物知識點記憶口決胺基酸分類
    2019年度中考生物知識點記憶口決胺基酸分類 胺基酸分類： 天冬谷，賴精組，苯丙色酪芳香族。詩書半擔兩岸有，幹餅限量一鋪無。 [注]天冬、谷是酸性，賴、精、組是鹼性。苯丙、色、酪有苯環。Cu Mo Mn 二 鐵 猛 碰 新 木 桶 Fe Mn B Zn Mo Cu 三 鐵 門 碰 醒 銅 母[驢] Fe Mn B Zn Cu Mo 大量元素 洋 人 探 親，丹 留 人 蓋 美 家 O P C H N S P Ca Mg K People=人 組成蛋白質的微量元素 佟鐵鑫猛點頭 銅鐵鋅錳碘 八種必須胺基酸
  • 摺疊革命,深度學習通過胺基酸序列預測蛋白質結構
    近些年，蛋白質通過自身的胺基酸序列可以實現被預測，在計算方法上有了巨大進步。如果都能使用這些計算方法，那生物醫學研究都可以被轉換成計算公式。然而，現在一些應用則受到了蛋白質規模和範圍的局限而無法決策。近期，來自哈佛醫學院的科學家應用了深度學習的方法，基於胺基酸序列來有效預測蛋白質的3D結構。
  • 天津工生所建立基於胺基酸脫氫酶的β-胺基酸合成新方法
    通過底物結構域掃描突變文庫篩選方法，將底物特異性嚴格的3,5-DAHDHcca改造為β-胺基酸脫氫酶，該酶能將(R)-β-高甲硫氨酸活力提高200倍，並對　　手性胺是許多醫藥、農藥等精細化學品的重要結構單元。
  • 生物化學:胺基酸基礎知識和理化性質
    本題答案ACD考點詳解【2017 西綜大綱 生物化學（一）生物大分子的結構和功能 1. 組成蛋白質的胺基酸化學結構和分類。2.三、胺基酸的分類1、根據側鏈結構和理化性質分類：（1）非極性脂肪族胺基酸：脯氨酸、纈氨酸、異亮氨酸、亮氨酸、丙氨酸、甘氨酸（記憶技巧：飛機紙上譜寫一兩個C肝患者）。
  • 高考生物複習知識點:胺基酸的結構與脫水縮合
    由兩個胺基酸分子縮和而成的化合物，叫做二肽，下面是高考生物複習知識點：胺基酸的結構與脫水縮合，希望對考生有幫助。　　胺基酸分子結合的方式是由一個胺基酸分子的羧基(—COOH)和另一個胺基酸分子的氨基(—NH2)結合連接，同時脫去一分子水，這種結合方式叫做脫水縮合。連接兩個胺基酸分子的化學鍵(—NH—CO—)叫做肽鍵。　　其中生成的水分子中的氫來自於氨基和羧基　　以此類推，有多個胺基酸分子縮合而成的，含有多個肽鍵的化合物，叫做多肽。多肽通常呈鏈狀結構，叫做肽鏈。
  • 聊聊20種胺基酸的結構與命名來源
    以前總是臨考前背口訣，脫離結構和原理談任何反應、變化就是歪門邪道。還不如歸零，先梳理一下胺基酸ba ，作為蛋白質組成的最基本單位。首先聊聊胺基酸的分類，主要就是-R基的分類。第一類：非極性不帶電胺基酸談到非極性就不得不回到有機化學複習一下極性的概念，極性即分子中正負電荷中心不重合，導致電荷的分布不均勻。所以非極性就是該分子電荷分布均勻，因此既不丟失也不容易得到質子。
  • 酸性胺基酸
    上期答案：【1997-19，生化學，A型題】含有兩個羧基的胺基酸是：AA．穀氨酸 B．絲氨酸 C．酪氨酸D．賴氨酸 E．蘇氨酸題目解析：考查要點：酸性胺基酸。解題思路：屬於識記的題目，不過還是有一些口訣可以幫助大家記憶的。知識匯總：1.含有兩個羧基的胺基酸即酸性胺基酸，所有胺基酸裡面只有兩個酸性胺基酸，即穀氨酸和天冬氨酸。2.含有兩個羥基的胺基酸就是鹼性胺基酸，包括賴氨酸、精氨酸、組氨酸。這
  • 綜述 | DescribePROT:胺基酸水平蛋白質結構和功能預測資料庫
    然而，D2P2的最新更新時間是2012年，兩個存儲庫都涵蓋的假定結構和功能特徵集較為狹窄，主要側重於疾病預測（表1）。更具體地說，D2P2僅涵蓋三個描述符（一個結構和兩個功能），包括通過九種不同方法預測的內在障礙描述符。同樣，當使用十種內在障礙的預測因子時，MobiDB包括四個推定描述符（兩個結構描述符和兩個功能描述符）。
  • 2019山東醫療衛生招聘醫學基礎知識:胺基酸代謝及維生素的口訣記憶...
    2019山東醫療衛生招聘醫學基礎知識：胺基酸代謝及維生素的口訣記憶方法 在醫基小科目生物化學考試中，胺基酸代謝及維生素是考查的重點，更是考查的難點，但是由於大家對生化比較陌生，記憶起來很困難，山東中公衛生人才網的醫療專家講師將該部分內容編寫成了口訣
  • DeepMind推出AlphaFold,可通過胺基酸序列預測蛋白質結構
    比賽的目的是根據胺基酸列表來預測蛋白質的結構，這些胺基酸列表會在幾個月內每隔幾天發送給參賽團隊。這些蛋白質的結構最近已經通過傳統方法破解，作為比賽的正確答案。儘管是首次參加比賽，AlphaFold 就在 98 名參賽者中名列榜首，準確地從 43 種蛋白質中預測出了 25 種蛋白質的結構。而同組比賽中獲得第二名的參賽者僅準確預測出了 3 種。
  • 胺基酸圖鑑
    我寫它的原因，是發現自己無論如何也搞不清所有的胺基酸，但在研究蛋白結構時，不能根據結構式反應出對應的胺基酸會帶來很多不便。這篇圖鑑收集了20種胺基酸的基本信息和常見用途，希望能通過拉近和它們的距離，更方便地記住它們。形而上地說，一個胺基酸就是一個同時包含了羧基和胺基的分子。所有生物的蛋白質水解出的胺基酸都是L-α-胺基酸，也就是它們的胺基都位於α碳上，並且α碳的手性呈L構型。
  • Science:新型電子顯微鏡首次揭示胺基酸的納米結構
    2019年2月16日 訊 /生物谷BIOON/ --美國能源部橡樹嶺國家實驗室的科學家在《Science》雜誌上首次描述了使用電子顯微鏡直接識別納米級胺基酸中的同位素而不損壞樣品的結果。這種新的電子顯微鏡技術可以檢測納米級蛋白質重量的細微變化，同時保持樣品的完整性，這可以為更深入，更全面的生命基本構建研究開闢新的途徑。
  • 健身必須要懂,支鏈胺基酸BCAA的重要性和使用方法
    健身必須要懂，支鏈胺基酸BCAA的重要性和使用方法 支鏈胺基酸雖然不像常見的蛋白粉那樣被所有人所熟知
  • 密碼子結構與胺基酸側鏈析性之間也有一定關係
    ，它們位於mRNA5′末端，同時它也是蛋氨酸的密碼子，因此原核生物和真核生物多肽鏈合成的第一個胺基酸都是蛋氨酸，當然少數細菌中也用GUG做為起始碼。密碼子UAA，UAG，UGA是肽鏈成的終止密碼，不代表任何胺基酸，它們單獨或共同存在於mRNA3』末端。因此翻譯是沿著mRNA分子5′→3′方向進行的。（2）密碼無標點符號：兩個密碼子之間沒有任何核苷酸隔天，因此從起始碼AUG開始，三個鹼基代有一個胺基酸，這就構成了一個連續不斷的讀框，直至終止碼。
  • 解決生物學50年來的重大挑戰,AI能根據胺基酸序列精確預測蛋白結構?
    DeepMind 的名為 AlphaFold 的程序在兩年一次的稱為 CASP 的蛋白質結構預測挑戰賽中勝過其他 100個 團隊，CASP 是結構預測的關鍵評估的縮寫。 在某些情況下，AlphaFold 的結構預測與使用「金標準」實驗方法（例如 X 射線晶體學和近年來的冷凍電子顯微鏡）確定的結構預測沒有區別。