醫學技術系下設醫學檢驗技術、醫學影像學兩個本科專業，中西醫結合基礎（免疫學）、臨床檢驗診斷學、影像醫學與核醫學三個碩士點。醫學檢驗技術專業是陝西省首家開設的本科專業，醫學影像學專業是陝西省較早開設的五年制本科專業。
醫學技術系現有教師61人，其中教授13人、副教授18人，醫學博士5人、醫學碩士19人，碩士研究生導師19人。該系曾榮獲「陝西省師德建設先進集體」、校級「管理育人先進集體」、「陝西省暑期三下鄉社會實踐活動先進集體」等榮譽稱號。
醫學技術系設有臨床檢驗學教研室、免疫及檢驗學教研室、病原微生物及檢驗學教研室、醫學影像診斷教研室、醫學影像技術教研室、口腔醫學教研室及醫用物理學教研室；中西醫結合免疫學研究室；醫學檢驗實驗中心、醫學影像學實驗中心及口腔醫學實驗中心；並在陝西中醫學院附屬醫院、第二附屬醫院設有醫學檢驗臨床實驗實訓中心、醫學影像學臨床實驗實訓中心及口腔醫學臨床實驗實訓中心。醫學技術系現有陝西中醫學院附屬醫院、第二附屬醫院、陝西省人民醫院、西安交通大學第一附屬醫院和第二附屬醫院、西安市中心醫院等教學醫院，承擔臨床實踐教學任務。
醫學技術系與陝西中醫學院附屬醫院、第二附屬醫院共同進行教學、科研和學科建設，實力雄厚。醫學檢驗技術專業為陝西省特色專業建設點、陝西省專業綜合改革試點，2013年醫學影像學專業榮獲首屆「萬東杯」全國醫學影像學專業大學生實踐技能大賽團體一等獎，中西醫結合免疫學為校級重點學科，《中西醫結合免疫學》、《臨床微生物學檢驗》、《醫學免疫學》課程為省級精品資源共享課程，《醫學免疫學》課程為校級精品課程。該系近三年先後承擔國家級、省部級、廳局級課題38項，獲國家級、省部級、市級科技成果獎25項，出版專著20多部, 發表論文200餘篇，其中多篇被SCI收錄。
醫學檢驗技術、醫學影像學專業發展前景廣闊，就業率高，學生畢業後能在各級醫院、血站、疾病控制中心、海關及檢疫等部門從事工作。畢業生專業基礎紮實，動手能力突出，普遍受到用人單位的好評，擁有較高的社會認知度，畢業生就業率在全校名列前茅,已成為西北地區醫學檢驗技術、醫學影像學人才培養的重要基地。
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