應該說看過柯南的小夥伴非常之多，我們也經常感嘆二十多年了，我們都從幼兒園小寶寶變成了幼兒園小寶寶的爸媽，以前管新一叫哥哥，現在管小五郎叫哥哥，柯南依舊是那個一年級的柯南，據作者說在柯南的世界架構裡，剛剛過去了半年。或許是柯南連載的時間太久了，一個個殺人案絡繹不絕，導致很多人都放棄了追更，更是對主線大劇情失聯多年，所以羅賓俠這次出山為大家把主線通過階段性清晰的線索來做一個大盤點！
第一階段TV001-128
1 雲霄飛車殺人事件
新一和青梅竹馬的毛利蘭，在乘坐雲霄飛車時遭遇了殺人事件。成功解決案件後，新一跟蹤兩個神秘的黑衣男子（Gin和伏特加），並目擊了一名黑衣男子進行現金交易的現場，正當他全神貫注時候，不料另一名黑衣男子突然從背後出現，將新一擊倒，並灌下了組織新開發的毒藥，萬年小學生開始了，97年開始小編入坑，已近20年。
2 董事長千金綁架事件
新一在家門口遇到了阿笠博士，並使他相信自己就是變小了的新一。巧這時小蘭來訪，在被問及名字時新一靈機一動，自己取名江戶川柯南矇混了過去。為了獲得黑衣組織情報，柯南以寄養的身份住進了小蘭的家裡。從此大叔開始了沉睡之旅！
5 新幹線大爆破事件
柯南在火車上遇到了兩名黑衣男子，阻止了兩人引爆新幹線列車殺人滅口的計劃，並成功得知了兩人的代號――GIN和VODKA。
13 奇怪的尋親殺人事件
組織成員宮野明美（化名廣田雅美）為了助妹妹宮野志保脫離組織，策劃了十億元搶劫事件。
43 江戶川柯南誘拐事件
新一的父母從博士處得知其變小，母親化裝成江戶川文代，父親化裝成暗夜公爵，偽裝成黑暗組織成員與柯南開玩笑。這集柯南真的有被嚇到！
48 外交官殺人事件（前篇）
49 外交官殺人事件（後篇）
這集裡服部初登場，在案件過程中，柯南因為感冒病重倒下了首次變回了新一，並且解決了案件，在案件後新一有變回了柯南，與此同時服部也開始懷疑起了柯南。
57 福爾摩斯迷殺人事件（前篇）
58 福爾摩斯迷殺人事件（後篇）
在這集柯南用麻醉槍射中服部進行推理然後被服部識破柯南就是新一的事實，從此好哥倆的JQ就開始了。
118 浪花連續殺人事件
案件與主線情節沒什麼關係，但其中出現的連續殺人犯沼淵已一郎，是組織裡的小角色，是組織培養殺手的失敗作品。
128 黑衣組織10億元搶劫事件
因為之前與漫畫對應的「013奇怪的尋親殺人事件」被改編，存在bug，所以這集重新講述了灰原的姐姐宮野明美被琴酒所殺的情節，為之後灰原出現作鋪墊。臨終前她向柯南透露這是一個籠罩著重重迷霧的龐大組織，組織的顏色是黑色。這集也預示著柯南主線大序幕正式開始了！
在這一階段主要介紹了女主，新一的女朋友，依然相信柯南是個普通小孩的毛利蘭，和他的父親，被射了20年麻醉針的糊塗名偵探，蘭的好朋友，鈴木園子以及她背後涉及日本各大領域的鈴木財團。第一個知道柯南身份，常常幫助柯南和優作的大發明家-–阿笠博士，還有鄰家的少年偵探團。介紹了柯南的父親是國際有名的推理小說家，母親則是贏得眾多獎項的女明星。還有和新一推理能力不相上下，成功推測出柯南就是新一的西部名偵探––服部平次以及他身為日本警示監的父親––服部平藏和青梅竹馬的遠山和葉。還有早早露面的目暮十三警官，白鳥任三郎警官。
關注尋找開膛手傑克，下期主線劇情再會