其實對於高達SEED的結局至少個人來說還是比較滿意，02年當時的TV版還不算完整之後官方還在後來DVD套裝的時候加插製作了幾分鐘的短篇——星之間作為真正的結局，當然也修正穆最後戰死的一幕，畢竟之後的種命還要用得上，但實際上SEED當時結局的話絕對是讚譽一片總比後來硬生生是拉出個種命要好得多。
當時阿斯蘭的父親被殺後指揮現場亂成一片，但即使是臨死的時候也要再鎖定使用創世紀掃射地球軍，當然阿斯蘭用正義高達去核爆這個大殺傷力武器，而基拉駕駛自由高達和克魯澤的天意高達互慫，最後天意被直插駕駛艙而自由則是創世紀的光線掃射至半毀，最後打敗了克魯澤後漂浮在太空的基拉被阿斯蘭和卡嘉麗找到。
其實到這裡整部SEED的劇情已經算得上是完滿，大戰過後扎夫特和地球聯盟都相互認識到再戰鬥下去的損害會更大於是就籤訂停戰協議，到此戰鬥的停止幕後boss戰死主角全部生還大戰之後換來了和平其實這樣的結局還是挺合理也算得上是完滿。
當然在種命那邊戰火再起只是更多的為了再撈一筆，這樣的做法還是讓人非常的反感，畢竟結局之後還能可以重新再開那種命之後一樣也可以用相同的手法再來一次，這種做法剛開始的確噁心了不少的觀眾，當然罵是一定的了但收視率依然堅挺。
種命不少的橋段都是直接再搬之前的SEED，這一點就是讓不少的粉絲非常氣，尤其是一開始輪到地球軍過來扎夫特搶高達，這不僅是讓人覺得編劇簡直連思考都已經不想去做，還有脈衝不斷重複的合體畫面也讓人非常的煩厭，總之種命一開始就槽點滿滿。
戰爭並不是由人引起的而是由主角獲得武器開始，當基拉的自由高達半毀而阿斯蘭的正義高達自爆，兩個主角都已經沒有了力量可以安心享受和平的成果，至少在大結局中主角手中武器的毀滅就預示著和平的到來，明明期待著和平卻被無情的再撿起武器，修復後的自由又被基拉重新啟動，當在最終戰時候強襲自由和無盡正義都完好無缺，但死死的不來第三部。
明明SEED的大結局已經砍掉不少人到了種命卻再翻倍出來，那個長長的聲優列表幾乎是原來的兩部，至少在前期還好但到了大天使好重新登場，原來新增的角色就基本只有之前一半的戲份，阿斯蘭混入敵陣到成功逃離經和眾多角色的互動但都沒有能夠帶得起他們的戲份，甚至到了後期更多的偏向基拉一行人，始終還是以基神和阿斯狼做主角。
其實SEED的結局不能夠解決自然人和協調人的矛盾，而這一點到了種命也依然沒有達成，哪怕是拉克絲和卡嘉麗分別領導兩大勢力，這一點依然沒有改善所以種命的這一戰打了還是等於白打，除了讓背後的金主賣模型再賺一波以外。