動畫《神奇寶貝》講述了以小智為首的訓練家和一群志同道合的夥伴一起到世界各地旅行，與不同的人相遇和戰鬥，並在此過程中培養自己與神奇寶貝的感情和默契，並鍛鍊小精靈們實力的過程。
神奇寶貝作為很多九零後小朋友們的回憶，即使在現在也仍然有很高的話題熱度。今天小編就帶大家來盤點一下動畫連載至今所透露的那些未解之謎，這些未解之謎恐怕是連作者本人都難以解釋，畢竟他只管挖坑，不管填坑。
第一個要提到的就是困惑了所有人的一個問題，小智的父親究竟是誰？
動畫中，我們從來都只見到小智母親的身影，也僅僅只能從那些大人的口中了解到確實是有小智爸爸這樣一個人存在的，但是卻從未露面。直到後來，由於每次小智打電話給家裡問候時，大木博士總是出現在電話的另一頭，不少人開始調侃說不定大木博士就是小智的父親，但其實這樣的說法有點牽強，又有點離譜。
我們不知道作者究竟是何用意，為什麼偏偏就不給小智爸爸一個簡單的形象呢？這又不是多麼困難的原因。不少網友還有另一種推斷，就是作者將自己視為小智的父親，畢竟是他一手創作了這樣的人物角色和劇情故事，所以那些在動畫裡提到的小智爸爸其實就是暗指自己。
第二個問題可能還是要圍繞我們的主人公小智，小智簡直過著不少人理想的生活，可以遊山玩水，去世界各地看一看，不用擔心各種學業、工作和錢的事，不少人就表示作為一個中少年難道不需要上學的嗎？
畢竟這是一個虛構的世界，那裡的動物都擁有各樣的招式、各種特殊能力，哪像我們身邊的動物都非常普通。所以小智所生活的世界也許就是把訓練小精靈等同於我們的學習，而參與各種道館戰鬥、各種比賽也許就等同於我們的工作賺錢。這樣一想，突然覺得小智在十歲就開始背井離鄉，仿佛還有點心酸呢！
第三個問題就出現在寵物醫院，無論是旅行到哪個地區，寵物醫院是必不可少的，畢竟戰鬥中受傷也是不可避免的，如果沒有醫生和護士的照料和治療，不知道有多少神奇寶貝因為戰鬥而死亡。但是細思極恐的是，每個醫院的護士小姐都長得一模一樣，神奇寶貝咱就不說了，畢竟咱是見過一群皮卡丘的人。
但是作為護士的喬伊小姐全部長得一樣就有些恐怖了吧，如果不是克隆或者高科技怎麼可能會出現這麼多樣貌完全相同的人類呢？那麼究竟是誰創造了這一切，我簡直不敢往下細想了。
最後一個問題就比較輕鬆搞笑了。我們都知道小剛在劇中是廚藝擔當，負責照顧大家的飲食起居，與此同時他還是一個好色擔當，凡是遇見長得好看的小姐姐，小剛從不膽怯，向來選擇主動出擊，要個聯繫方式什麼的都是小菜一碟。
但是在故事進行到橘子群島篇時，小智主動要求想要成為內木博士的助手，小智便先行離開了。但是當小智回到真新鎮時，小剛卻又出現在了自己的家裡，而且整個人非常不舒服的樣子，之後再提起內木博士也總是會流露出一種不適的感覺，那到底這兩人究竟經歷了什麼呢？誰也不知道，但是能讓小剛之前那樣活潑開朗的人發生一百八十度大轉彎，總覺得事情不簡單。
以上就是小編整理的動畫中的四個未解之謎，其實有的大家能從邏輯上自行解答，但有的就真的只能靠作者來填坑了。