《創造101》自開播以來一直熱度居高不下，上周六晚第三期播出首期公演之後更是將話題度推到新的高度。同時期能夠一較高下的也就只有謝娜回歸《快樂大本營》的首秀。
與第一期和第二期瘋狂圈粉，頗受好評相比，第三期反而更具爭議。從臺前選手們的表演以及賽制的更改，以及臺後的故事使得這一期成為最具爭議性的一期。首先引起爭議的就是賽制的大幅度修改，原版的C位是分組後內部投票選出，而《創造101》則分成勤奮組和能力組進行對抗，勤奮組選擇是根據額外訓練時長來決定的，而能力組是由導師指派。
這就產生了比賽的第一個爭議點，導師的權力放大，原版節目裡導師的作用就是指導，並沒有多餘的權力。而《創造101》裡導師教導的鏡頭沒有多少，還額外加入了戰隊賽制，導師們在臺下派戰隊出戰（恍惚間回到了《中國好聲音》）。
101系列富有魔力之處在於觀眾全程參與，選手們的晉級淘汰完全由觀眾投票決定，數據上也是完全公開的。哪怕是公演也會將票數精確到選手個人，在臺下的屏幕前即時放出。
《創造101》則是把票數歸為組合，個人票制度取消，票數也沒有公開，只是簡單說明哪個隊伍勝出。這就使得觀眾質疑節目的公正性，沒有個人票公開這一環節，人氣低迷的選手依舊沒有個人鏡頭，使得選手人氣兩極分化再度拉大。
如果說賽制的更改是第一個爭議點，那麼節目中出現的不少播出問題也為人詬病。字幕更新不及時，《寵愛》一組的演出甚至出現聲畫脫軌的現象。雖然節目組第一時間做出了道歉並承諾會儘快更改，但在評論區能夠看到觀眾的怨氣。
播出時令許多人驚訝的是，人氣選手Sunnee在節目一開始被選為C位，但是在節目正式表演的時候表演的C位變成了李子璇，並且到Sunnee唱歌的部分個人鏡頭全無。相同情況同樣出現在Sunnee同個公司的選手身上，這樣神剪輯是節目組的問題嗎？
據網友爆料，原來和Sunnee同公司的鄭丞丞在節目公演錄製前突然跑路去劇組拍戲，101個人變為100人。鄭丞丞這一行為還獲得了公司的支持，節目組因為這種違規且失信的行為才對同公司的其他選手進行「雪藏」。這種違背節目規則而連累其他人的行為實在令人惋惜。
另外網友爆料，在楊超越所在的一組中，C位姜彥汐因為自己不會唱歌，就不準其他隊友唱歌，要陪著她一起跳舞。因此把樂華公司最小的妹妹潘珺雅欺負哭了，組裡來自SING組合的許詩茵看不下去直接和她吵了起來。最終導致許詩茵幾乎沒有鏡頭，甚至在宣傳圖中都沒有出現。
回歸到演出上，《創造101》由原版的一首歌不同組表演兩遍改為了每組表演不同的歌曲，在內容上大大豐富了，但是缺乏了對比度。不過也是出了不少精品舞臺，比如孟美岐組的《撐腰》。而在節目中的一大爭議點就是在於首輪PK中，吳宣儀組的《我又初戀了》敗給了《Sugar》。
其實現在看來吳宣儀組的優點很明顯，就是C位個人風格很明顯，以至於很容易掩蓋其他隊友的表現力。加上現場觀眾反映有選手演唱車禍，失敗是正常的。而Sunnee組的成員個人風格都極其明顯，李子璇專長跳舞，許靖韻唱歌能力極強，熱依娜氣場強大，多個極端共處一個舞臺竟然達成了一種奇妙的平衡，風格也很強烈，這也是獲勝的原因。
節目播出至今，我們可以看到《創造101》做出的創新，但這一系列節目的精髓就是在於觀眾參與的養成感，希望節目組可以把握住精髓，真正推出屬於中國的女團偶像。