自9月1日大陸推出臺胞居住證以來，臺胞申領踴躍。截至9月10日，已有超2.2萬名臺灣同胞申領了居住證。
對此，民進黨當局感到坐立不安，如臨大敵。
據臺灣媒體報導，臺灣方面陸委會或將於近日針對大陸居住證祭出所謂"更加嚴密的安全管理機制"，計劃要求領用居住證的臺灣民眾，履行向島內相關主管機關申報的義務，否則將面臨罰款。此外，還計劃進一步限縮領用居住證者的權利，包括領證者不能報考公職、不得擔任臺當局重要職務或涉及機密的職務、軍職等。
上述消息引發島內民眾的強烈不滿和不安。有人質問道，蔡英文當局為什麼不規定持有美國綠卡、加拿大楓葉卡的也申請報備，而只對臺胞居住證下手，其針對性不言可喻。
據了解，部分大陸臺商協會計劃聯合起來，在本月25日臺灣海基會舉行的臺商中秋節座談會中表達意見，甚至不排除採取抗爭手段。
針對臺灣方面陸委會這一不得人心的做法，國民黨前主席洪秀柱指出：
民進黨當局想盡各種手段阻撓大陸給予臺商、臺胞方便的居住證政策，到底誰在扮演北風、誰在扮演太陽，昭然若揭。在民進黨當局愚蠢的領導下，臺灣民心思變，就算有再多規定都無法阻擋趨勢。
臺灣媒體發文指出，民進黨當局目前的做法無異於拿臺胞做籌碼，出動大棒嚇阻，逼使他們選邊站。大陸在不斷營造更適合臺胞居住和發展的環境與制度，反觀民進黨當局，除了對兩岸僵局束手無策，最後還把腦筋動到在大陸的臺胞臺商這些自己人的身上，這種做法非但無法嚇阻在大陸臺胞申領居住證的現實需要，還在把民心越推越遠。
香港中評社直言，從申領大陸居住證的人數快速增加的現狀看，民進黨當局在兩岸爭取民心的戰場上又輸了一仗。
對於大家關心的居住證與臺胞在大陸納稅的關係問題，國臺辦發言人安峰山日前在例行記者會上表示，
臺胞在大陸的納稅身份和納稅義務是由新修正的個人所得稅法和個人所得稅法實施條例及相關規範性文件有關規定來認定的。是否申領臺灣居民居住證和相關稅收規定沒有對應關係。臺胞不會僅因申領了居住證而改變其在大陸的納稅身份和納稅義務，也不會僅因領取了居住證而在大陸負有全球所得納稅義務。
對涉及臺灣同胞利益福祉的事情，大陸方面一直本著「兩岸一家親」理念，認真傾聽臺胞呼聲，積極回應臺胞訴求，為臺胞做實事、辦好事。而臺灣有些人總看不順眼，以對抗性思維和逆反心理橫加指責。民進黨當局更一再威脅、恐嚇、阻撓、限制，這實際上是在壞臺胞好事。無論大陸為臺灣同胞做什麼好事，民進黨當局都要刻意歪曲抹黑、限制阻撓，這是民進黨的本性決定的。
9月12日，國臺辦主任劉結一在受訪時也針對相關問題回應表示，
辦理居住證是在辦好事。任何一個真正關心廣大臺灣福祉的人，都不應該對居住證的事「說三道四」。